苯甲酸衍生物对酪氨酸酶活力抑制的定量构效关系

利用Gaussian 03W程序,采用密度泛函理论(DFT)的B3LYP/6-3 1G**方法全优化计算,计算25种苯甲酸衍生物的量子化学参数.通过相关性分析,从8种量化参数中选4种影响化合物活性的独立参数,然后利用多元线性逐步回归法,研究4种参数对酪氨酸酶抑制活性(log1/IC50))的关系,建立QSAR方程,结果表明,该类化合物的分子以最高占据轨道能(EHOMO),分子中的最大负电荷(Q-max)以及疏水性参数(ClogP)对抑制剂活性(log(1/IC50))影响最大,其结果为进一步研究酪氨酸酶抑制剂的设计提供参考.     

苯酚衍生物式电位的QSAR研究

以AM1量子化学半经验分子轨道方法计算苯酚及其衍生物的分子结构参数,以多元线性回归的方法研究了苯酚及其衍生物的氧化式电位与其分子结构参数之间的关系;在选择的分子结构参数中,苯酚衍生物的式电位与C-O键长,L（C1-O7）,离子化电势,Ip,C3上的静电荷,e（C3）;Z轴的偶极矩,Dz,有很好的相关性。回归方程为：E^o=-25．267＋17．00L（C1-O7）＋0．293Ip＋1．415e（C3）＋0．9825Dz（R=0．897,SD=0．057）。预测了11种衍生物的式电位,总结出取代基类型和取代位置对氧化还原活性的影响规律。     

有机缓蚀剂定量构效与活性相关的热力学参数量子化学计算值与缓蚀效率的QSAR研究

用AM1和PM3半经验方法对5种缓蚀剂进行了优化计算并将获得的量化参数与缓蚀性能进行构效关系（QSAR）研究，结果表明，由AM1方法得到的不同温度下的缓蚀剂热力学参数焓和熵的量子化学计算值与该缓蚀剂缓蚀实验的腐蚀电流有良好的相关性。根据所得的相关模型可对缓蚀剂在一定温度范围的腐蚀电流进行预测，进而预测其缓蚀性能。     

含磷类血管紧张素转化酶抑制剂的3D—QSAR研究

文章利用限制性构象搜寻（Ｃｏｎｓｔｒａｉｎｔｓ Ｓｅａｒｃｈ）,确定了血管紧张素转化酶（ＡＣＥ）掏剂的药效团模型（活性构象或重叠规则）。用比较分子场分析法（Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ＭｏｌｅｃｕｌａｒＦｉｄｌｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ,ＣｏＭＦＡ）建立了含磷类ＡＣＥ掏剂的３Ｄ－ＱＳＡＲ模型。较高的交叉验证回归系数（q＾２＝０． ７２１）及此模型对不同类型抑制剂活性的预测结果,说明了其可靠性和较好的活性预测能     

有机缓蚀剂定量构效与活性相关的热力学参数量子化学计算值与缓蚀效率的QSAR研究

用AMI和PM3半经验方法对5种缓蚀剂进行了优化计算并将获得的量化参数与缓蚀性能进行构效关系(QSAR)研究,结果表明,由AMI方法得到的不同温度下的缓蚀剂热力学参数焓和熵的量子化学计算值与该缓蚀剂缓蚀实验的腐蚀电流有良好的相关性。根据所得的相关模型可对缓蚀剂在一定温度范围内的腐蚀电流进行预测,进而预测其缓蚀性能。     

基于QSAR模型研究芳烃化合物对小球藻的抑制活性

芳烃化合物正随着工业的快速发展和溢油事故的频繁发生影响着海洋生态系统的健康,提高定量构效关系（QSAR）模型预测未知芳烃化合物毒性的能力是做好芳烃化合物安全防范措施的任务之一。为建立芳烃化合物物化性质与小球藻抑制活性间的QSAR模型,以实验获取的21种芳烃化合物对小球藻96 h的抑制活性数据为基础,采用密度泛函理论（DFT）中的B3LYP方法,在6-311G^**基组上全优化计算21种芳烃化合物结构参数,运用SPSS 12.0 for Windows程序,将这些结构参数作为理论描述符,逐步回归得到芳烃化合物对藻类抑制活性的QSAR模型。该模型相关系数R²为0.925,交叉验证相关系数q²为0.898,说明所建模型具有良好的预测能力和较强的稳定性;所建模型包含2个参数（分子体积和最正氢电荷）,其中分子体积显著影响了该类化合物对小球藻的抑制活性。     

硫代氨基甲酸酯类衍生物抗HIV-1逆转录酶抑制活性的QSAR研究

采用以MLR为基学习器的Boosting算法模型,对79种硫代氨基甲酸酯类衍生物做抗HIV-1逆转录酶抑制活性的QSAR研究。以E-Dragon软件计算的7组描述符分别为自变量,以化合物的半数效应浓度EC_(50)值为因变量构成7个原始数据集,用PSO算法筛选变量并建立MLR模型。各描述符建立的MLR模型中仅有RDF描述符模型同时通过外部预测和内部验证,故确定以其建立关于硫代氨基甲酸酯类衍生物抗HIV-1逆转录酶抑制活性的Boosting-MLR预测模型。Boosting-MLR模型与MLR模型相比,训练结果的决定系数R~2分别为0.728和0.741,预测结果R~2则分别为0.718和0.667,表明其泛化能力明显增强。对Boosting-MLR模型进一步进行稳定性验证,证明其预测稳定性较高。     

16α取代雌二醇衍生物的三维定量构效关系和分子对接研究

采用比较分子力场方法(CoMFA)及分子对接方法对一系列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其与受体作用方式进行研究,建立了3D-QSAR的CoMFA模型,获得了化合物的相对亲合力RBA(Relative Binding Affinity)与静电场及立体场分布之间的关系;CoMFA模型的统计学参数为:q2=0.667,r2=0.939,sD=0.280,F=49.033,立体场与静电场的贡献分别为56.8%和41.6%.相对亲合力小的化合物一般带有较大的取代基,其对接能量得分较低;相对亲合力大的化合物一般带有较小的取代基,其对接能量得分较高.化合物的对接能量得分和相对亲合力之间有良好的线性关系,其线性相关系数R为0.890.活性口袋周围的环境也与3D-QSAR的立体场分布相匹配.对接结果还显示这类化合物和雌激素的结合主要是通过氢键作用来实现,即3-OH与R394上的氨基以及17-OH与受体残基H524咪唑环上的氮形成的氢键.     

一些有机锡化合物的QSPR和QSAR研究

应用量子化学HF/3-21G从头算法计算得量子化学参数,研究一些有机锡化合物的定量结构-性质关系和定量结构-活性关系。结果表明:有机锡化合物的正辛醇/水分配系数(logK_(ow))与分子极化率和分子范德华体积有关,而有机锡化合物对巨溞(daphnia magna)的急性毒性,则与分子最高占用轨道能和分子水化能有关,并建成它们的构效关系式。     

一类伊马替尼衍生物酪氨酸激酶抑制剂作用模式的理论研究

第1代Bcr-Abl抑制剂伊马替尼问世以来取得了巨大的商业成功。本文对酪氨酸激酶和伊马替尼、尼罗替尼复合物晶体的结构(PDB ID:2HYY、3CS9)中伊马替尼、尼罗替尼的活性结构、药效团进行了分析研究,探讨了酪氨酸激酶与抑制剂的相互作用模式。研究表明伊马替尼分子结构中哌嗪基部分与酶作用较弱,没有明显的药效团,适合在此部分结构进行结构改造。基于69个伊马替尼衍生物抑制剂的结构和活性数据,利用遗传算法,建立了合理伊马替尼衍生物的定量构效关系。确定的酪氨酸激酶与抑制剂的作用模式,可以指导抑制剂的设计,用于开发新型抗癌药物。     

小波神经网络测定复方苯甲酸酊中主要成分的含量

依据小波函数的非线性逼近能力和神经网络的自学习能力,用Morlet小波基函数代替传统的神经网络传递函数Sigmoid函数,克服BP神经网络易陷入局部极小等缺陷,建立了小波神经网络算法,用于紫外分光光度法不经分离同时测定复方苯甲酸酊中的苯甲酸和水杨酸。苯甲酸和水杨酸的平均加标回收率和RSD分别为101.1%,1.7%;102.1%,1.8%。结果表明,该方法不需要物理化学分离,分析速度快,精确度较高,适用于该制剂的含量测定。     

毛细管区带电泳结合人工神经网络测定足光散中苯甲酸、水杨

苯甲酸和水杨酸是中成药足光散的两种主要成分,使用毛细管区带电泳很难将这两种成分完全分离。寻找最优实验条件费时费力且成本高。本文应用径向基函数人工神经网络结合主成分分析处理苯甲酸和水杨酸的毛细管区带电泳重叠峰。无需对这两种酸完全分离则可准确测定足光散中两种酸的含量。测定两种酸的相对误差分别为2.662%和5.516%。这是一种简单可行的测定足光散中苯甲酸和水杨酸含量的方法。     

3-取代4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性的定量构效关系研究

目的:研究3-取代4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物分子结构与抗肿瘤活性的关系.方法:采用量子化学和分子力学方法计算分子结构参数,利用Cram-Schmidt正交化法筛选参数,利用偏最小二乘法建立QsAR模型.结果:建立合理的3-取代-4.氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性模型.结论:3-取代-4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性与分子油水分配系数LogP和8位取代基R1上的非氢原子净电荷Q1相关,研究结果可为同类抗肿瘤药物的分子设计提供参考.     

黄酮类化合物抗肿瘤活性的构效关系研究

应用分子力学MM 和半经验量子化学AM1法对18种黄酮类化合物进行了几何优化,并计算了各化合物的电子结构,根据其电子结构,结合它们在体外抑制60-Cellline人体肿瘤细胞的活性数据(IC50)进行讨论,得出了黄酮类化合物抗肿瘤活性的定量构效关系。结果表明：B环和C环对黄酮类化合物抗肿瘤活性影响大;且B环负电性越高,活性越强,而C环正电性越高,活性越强。     

Thermodynamic analysis of the interaction between 3-aminophenylboronic acid and monosaccharides for development of biosensor

The special interaction between 3-aminophenylboronic acid and monosaccharides, particularly glucose, fructose and galactose, has been investigated and used for the development of electrochemical and surface plasmon resonance (SPR) based saccharide sensors. The binding constants and thermodynamic parameters of interaction such as free energy of binding (ΔG), enthalpy (ΔH) and entropy (ΔS) were determined for the first time using isothermal titration calorimetry revealed the enthalpic and entropic contributions to the free energies of binding. Effects of pH and buffer on the binding constants (k) between 3-aminophenylboronic acid and monosaccharides were also examined. The binding constant of fructose was found to be six times higher than glucose and four times higher than galactose at pH 11, leading the specific detection of fructose. SPR and potentiometric calibration for fructose were linear in the concentration range of 10–120 mM and 8–84 mM, respectively. Limit of detection of the SPR and potentiometric method were found to be as 8.9 mM and 1.4 mM, respectively.     

容错控制在浓硝酸高压反应釜中的应用研究

介绍了直硝法生产浓硝酸工艺的关键工序,并分析了对高压反应釜生产进程的质量与产量影响较大的"管道化配料新工艺".针对浓硝生产系统的变参数、强耦合、多变量、高腐蚀、非线性等工艺特征,利用"动态系统故障检测与诊断技术"与"PSBE算法",建立了高压反应釜运行的数学模型,并提出了多个传感器同时发生故障时的容错控制策略,给出了高压反应釜管道化混合装置容错控制方法.     

4-X-N-Y-6-氮杂雄-17-羰基-Z-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性与结构关系的研究

应用分子力学方法MM,和半经验量子化学AM1法,获得22种4-X-N-Y-6-氮杂雄-17-羰基-Z-4-烯-3-酮衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术,获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些参数和衍生物对3β-羟类固醇脱氢酶(3BHSD)的抑制活性相关联。结果表明,衍生物对3BHSD的抑制活性大小和分子最高占用轨道能(E_(HOMO))、16号碳原子的净电荷(Q)及5号碳原子和6号氮原子间键长的相关性较好,成功地建立了22种衍生物的构效关系式。HOMO轨道组成分析表明,A环上的4号、5号碳原子和羰基氧原子(O_(1(?)))及B环上的6号氮原子和7号碳原子可能是与受体作用时的活性位点。     

4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性与结构关系研究

应用分子力学方法MM 和半经验量子化学AM1法得到了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些参数和4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3β-羟类固醇脱氢酶(3BHSD)的抑制活性相关联。结果表明,4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性大小和分子范德华体积(V)、分子最高占用轨道能(EHOMO)及9号碳原子的净电荷(Q)的相关性较好,成功地建立了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的构效关系式。HOMO轨道组成分析表明,A环上的4号、5号碳原子和羰基氧原子(O18)及B环上的7号、8号碳原子和6号氮原子可能是与受体作用时的活性位点。     

烷烃保留指数与结构关系的数据挖掘

投影寻踪方法被用来进行烷烃结构和保留指数关系的数据挖掘。发现各种同系物表现了不同性质，它们各自成为一类。因此提出分支变量，用来与部分拓扑指数共同描述结构和保留指数的关系。得到了非常好的模型：R＝0.99995,残差小于4i.u.。