量化参数在黄酮化合物构效关系研究中的应用

将量在数应用于黄酮类化合物的结构与抗肿瘤活性的相关分析中,并运用最佳子变量进行压缩计算分析,获得了比较好的相关模型。     

药物设计构效关系研究的聚类-判别分析方法

尝试在药物设计构效关系研究中引入分层聚类与判别分析相结合的数量化方法,并以芳氧基乙酰肼衍生物对单胺氧化酶的抑制率为例,具体说明了该方法的实现步骤和结果分析.该方法所得的结果直观生动,可以在实际实验之前较明显地判别出新样本(化合物)的活性属类,对化合物进行活性预测,以指导新化合物的合成.该方法为药物分子设计中判断未知化合物的生物活性提供了新的思路.     

多维标度法选择回归测试子集

在软件改动较大且资源限制严格时,回归测试目前的方法难以满足实际需要。因此,提出利用多维标度法选择回归测试子集的方法。该方法使用测试执行剖面表示测试集,通过计算剖面数据,将测试集合按照测试效果可视化分类,综合考虑了软件变更及测试用例的典型性,适用于大规模软件更改较多时获取有代表性的测试子集。实验表明,多维标度法能够全面反映原测试集对变更的测试程度,从而使得回归子集的获取及测试实施更有针对性,能够满足限制严格的回归测试要求。     

药物设计构效关系研究的聚类—判别分析方法*

尝试在药物设计构效关系研究中引入分层聚类与判别分析相结合的数量化方法,并以芳氧基乙酰肼衍生物对单胺氧化酶的抑制率为例,具体说明了该方法的实现步骤和结果分析。该方法所得的结果直观生动,可以在实际实验之前较明显地判别出新样本（化合物）的活性属类,对化合物进行活性预测,以指导新化合物的合成。该方法为药物分子设计中判断未知化合物的生物活性提供了新的思路。     

基因表达式编程在环氧酶抑制剂定量构效关系中的应用

基因表达编程方法(GEP)是1种较新的进化计算算法,是1种较好的数据挖掘和建模工具。因其出色的数据挖掘能力并能以数学模型表达数据关系而广受关注,但在化学领域的应用还较少。本文应用GEP方法研究环氧酶抑制剂活性和选择性的构效关系(QSAR),选择变量和建立模型,同时与BP人工神经网络(BP-ANN)和遗传算法-多元线性回归(GA-MLR)方法比较。结果发现,GEP方法的预测较好,且模型稳定。研究显示GEP在定量构效关系研究中,具有广阔的应用前景。     

苯酚类化合物的三维定量构效关系研究

对苯酚类化合物结构与活性ＩＤ５０进行了三维构效关系研究,取得了满意的结果。其中ＩＤ５０为引起半数梨形化合物四膜虫生长受到抑制所需的苯酚类化合物的浓度。     

基于多维标度法的专利文本可视化聚类研究*

为了从当前海量的专利文本信息资源中迅速准确地获取所需的信息并将其以可视化的形式展现出来,通过研究文本挖掘相关理论和关键技术,结合专利文本的特征及现有的分析方法,提出一种基于多维标度法的专利文本可视化聚类方法,并结合实际进行了相关分析讨论。实验结果表明,该方法较好地展现了当前专利技术领域的应用主题分布状态及其关联图谱,可为相关部门的管理决策和技术创新提供有意义的参考和支持。     

选择性神经网络二次集成方法在定量构效关系建模中的应用研究

针对在建立定量构效关系(QSAR)模型中,单个人工神经网络模型难以确定参数,容易产生“过拟合”;一般神经网络集成模型虽然建立过程简单,但由于个体差异度小而导致泛化能力相对单个神经网络没有明显改善等问题,提出了一种基于随机梯度法的选择性神经网络二次集成方法。在建立除草剂(苯乙酰胺类化合物)的QSAR模型的实验研究中表明,该方法设计过程简单,能够以较小的运算代价明显地提高了模型的泛化能力,是建立QSAR模型的一个有效方法。     

聚醚类海生毒素的构效关系与分子设计研究

在对聚醚类海生毒素构效关系研究的基础上，设计了5个结构简化的高活性化合物，对它们的电子结构和空间结构进行了计算和研究，并同CTX、BTX类化合物进行了比较，讨论了新化合物和已知化合物在电子结构与空间结构上的一致性，依据相关关系对新化合物进行了活性预测。     

黄酮类化合物抗肿瘤活性的构效关系研究

应用分子力学MM 和半经验量子化学AM1法对18种黄酮类化合物进行了几何优化,并计算了各化合物的电子结构,根据其电子结构,结合它们在体外抑制60-Cellline人体肿瘤细胞的活性数据(IC50)进行讨论,得出了黄酮类化合物抗肿瘤活性的定量构效关系。结果表明：B环和C环对黄酮类化合物抗肿瘤活性影响大;且B环负电性越高,活性越强,而C环正电性越高,活性越强。     

基于优化策略的混合定位算法

针对无线传感器网络(Wireless sensor network, WSN)的应用需求提出一种基于优化策略的混合节点定位算法. 选择1-hop节点最多的点作为初始点, 利用多维标度(Multi-dimensional scaling, MDS)方法计算初始节点及其1-hop节点的相对坐标, 并将这些节点的坐标发送给周围未定位节点; 未定位的节点根据接收到的坐标与节点间的距离, 利用极大似然法估算自身的坐标; 最后通过坐标变换计算所有节点的绝对坐标. 在此基础上, 进一步提出将本文节点定位算法与集中式和分布式优化策略相结合来优化网络节点的估计坐标, 以提高节点定位精度. 仿真结果表明本文提出的算法是有效的, 能够较好地完成无线传感器网络节点的定位.     

粗糙集方法在吲哚芳砜类化合物抗HIV构效关系研究中的应用

应用粗糙集方法来研究吲哚芳砜类化合物抗HIV构效关系。以AM1和MINDO3方法在STO-3G水平上计算79个吲哚芳砜化合物的结构参数,再结合相应的EC50数据进行属性约简、属性值约简和决策规则的简化。结果表明分子总能量(E_Total)、吲哚环5-位和苯环3-6-位的净电荷(Q2,Qp3-Qp6)是影响吲哚芳砜类化合物抗HIV活性的主要因素。阐述了粗糙集方法研究结构特异性药物构效关系的特点。     

酚类化合物对Shk1发光细菌毒性的定量结构-活性相关研究

以PM3算法计算所得的量子化学参数为自变量,应用偏最小二乘法(PLS),建立酚类化合物对Shk1发光细菌毒性的定量结构-活性相关(QSAR)模型。模型所提取的PLS主成分所能解释的因变量总方差的比例Q2cum为0．810,表明模型具有较好的稳定性和预测能力。模型结果表明,影响酚类化合物对Shk1发光细菌毒性的主要因素是分子次最高占据轨道能 (EHOMO 1)、相对分子质量(Mr)、平均分子极化率(α)和分子总的核-核排斥能(CCR),酚类化合物对Shk1发光细菌的毒性值随着分子EHOMO 1的增大而减小,随着Mr、α和CCR的增大而增大。     

基于鲁棒尺度的统计建模数据中异常点去除算法的研究及应用

针对基于主元分析 (PCA)的统计监控模型受到历史数据中异常点强烈影响的不足,鉴于建模历史数据中存在的异常点会影响过程监控效果,分析目前常用的鲁棒异常值检测算法原理及其缺陷,提出将中心最短距离(CDC)法与椭球多变量整理(MVT)法相结合,构成一种基于鲁棒尺度的CDC-MVT异常值综合检测算法,更加准确地检测异常点。将该算法应用于工业发酵过程,与CDC法和MVT法相比较,该算法能够有效去除建模数据中的异常点。     

四氢咪唑苯二氮卓酮类抗艾滋病药物定量构效关系的研究

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)研究89个四氢咪唑苯二氮卓酮(TIBO)类抗艾滋病药物的定量构效关系(QSAR).分别运用偏最小二乘回归、人工神经网络建模,同时采用内部及外部双重验证的办法深入分析和检验模型的稳定性.PLS与ANN建模的复相关系数(R2cum)、留一法(leave-one-out,LOO)交互校验(cross-validation,CV)复相关系数(Q2CV)和外部样本校验复相关系数(Q2ext),分别为0.802、0.710、0.552和0.871、0.864、0.760.表明用3D-HoVAIF表征TIBO类抗艾滋病药物分子结构信息较好,建立QSAR模型的稳定性和预测能力良好,运用ANN建模优于PLS及前人报道的多元线性回归(multiple linear regression,MLR).     

Inverse analysis method using MPP-based dimension reduction for reliability-based design optimization of nonlinear and multi-dimensional systems

There are two commonly used analytical reliability analysis methods: linear approximation - first-order reliability method (FORM), and quadratic approximation - second-order reliability method (SORM), of the performance function. The reliability analysis using FORM could be acceptable in accuracy for mildly nonlinear performance functions, whereas the reliability analysis using SORM may be necessary for accuracy of nonlinear and multi-dimensional performance functions. Even though the reliability analysis using SORM may be accurate, it is not as much used for probability of failure calculation since SORM requires the second-order sensitivities. Moreover, the SORM-based inverse reliability analysis is rather difficult to develop.This paper proposes an inverse reliability analysis method that can be used to obtain accurate probability of failure calculation without requiring the second-order sensitivities for reliability-based design optimization (RBDO) of nonlinear and multi-dimensional systems. For the inverse reliability analysis, the most probable point (MPP)-based dimension reduction method (DRM) is developed. Since the FORM-based reliability index (β) is inaccurate for the MPP search of the nonlinear performance function, a three-step computational procedure is proposed to improve accuracy of the inverse reliability analysis: probability of failure calculation using constraint shift, reliability index update, and MPP update. Using the three steps, a new DRM-based MPP is obtained, which estimates the probability of failure of the performance function more accurately than FORM and more efficiently than SORM. The DRM-based MPP is then used for the next design iteration of RBDO to obtain an accurate optimum design even for nonlinear and/or multi-dimensional system. Since the DRM-based RBDO requires more function evaluations, the enriched performance measure approach (PMA+) with new tolerances for constraint activeness and reduced rotation matrix is used to reduce the number of function evaluations.     

Examples in the theory of convergence of the affine scaling method

Examples of homogeneous linear programming problems are investigated. The objective function of such a problem is not bounded below on a feasible set. A starting point is presented such that the affine scaling method generates a sequence of vectors that converges to zero. __________ Translated from Kibernetika i Sistemnyi Analiz, No. 1, pp. 178–179, January–February 2006.     

蛙皮降压肽类似物构效关系的研究

蛙皮降压肽(Sauvagine,Svg)是一种良好的促肾上腺皮质激素,释放因子2受体(CRF2R)激动剂,但它是一种非选择性激动剂,作用于CRF1R而产生副作用。为了探讨蛙皮降压肽类似物对CRF2R与CRF1R选择性的影响,本文使用正交因子(Orthogonal Factors,Orth-Factors)描述子,对45个蛙皮降压肽类似物与CRF2F、CRF1R的亲合力进行了QSAR研究,所建立的QSAR模型预测能力良好。通过QSAR模型信息,设计了17个蛙皮降压肽类似物,其中3个对CRF2R与CRF1R受体选择性良好(SQ:110,TQ:105,VQ:110),有进一步研究的价值。