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相似文献
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1.
应用微卫星标记分析柱花草的遗传多样性   总被引:16,自引:1,他引:16  
采用18个微卫星(SSR)DNA标记对42个柱花草品系进行了遗传多样性分析,共扩增出84条带,其中多态性带71条,平均多态性水平为84.5%。运用POPGEN32软件计算了各品系的等位基因频率、多态性信息含量、遗传杂合度、等位基因数及有效等位基因数,结果表明,抗病柱花草品系的遗传变异高于感病柱花草品系的遗传变异程度。用NTSYS-pc软件计算品系间的遗传相似系数,其变化范围为0.26~0.94。按非加权成对平均数法(UPGMA)进行聚类分析,获得了聚类树系图,以所有品系的平均遗传相似系数0.60为阈值,42个品系分为6类。这些结果表明,SSR技术是分析柱花草遗传多样性的有效方法。  相似文献   

2.
牙鲆选择性养殖群体遗传结构的微卫星分析   总被引:9,自引:0,他引:9  
应用10对微卫星引物对三个牙鲆群体各30个个体进行了群体遗传多样性分析.普通群体的平均等位基因数为7.6,显著高于感病群体的5.80,略高于抗病群体的7.2.普通群体的10个位点的平均基因型数为11.4,而感病群体和抗病群体分别只有8.3和9.0.普通群体的平均有效等位基因数为3.97,略高于感病群体和抗病群体的3.78和3.72.普通群体10个位点最高频率等位基因的平均频率值为0.388,而感病群体和抗病群体分别为0.407和0.425.普通群体低频等位基因(0-0.05)总共有27个,而感病群体和抗病群体分别只有15个和19个.普通群体共得到14个私有等位基因,感病群体和抗病群体仅各得到3个等位基因.研究结果表明了感病群体和抗病群体两个选择性养殖群体遗传多样性的降低.  相似文献   

3.
首次从辽宁新宾县野生大豆原位保护区10个自然居群采集了150株野生大豆叶片样本,利用居群个体DNA等量混合建池,用53对微卫星(SSR)引物进行遗传多样性分析,目的是建立野生大豆原位保护群体多样性快速评价方法,为野生大豆原位保护点的选择提供理论依据.在参试材料中共检测到123个等位变异,平均每个位点2.3个.经相似系数矩阵分析,发现用20~25对引物进行分析与用53对引物的分析结果可达极显著相关.因此,选择了25对SSR引物对150个个体进行深入分析,结果表明,居群期望杂合度(He)为0.317,群体间分化系数(Fst)为0.667,说明居群内分化较小,大部分遗传变异存在于居群间.居群间基因流强度很小(Nm=0.119),遗传多样性分布不均匀,异位保护取样时,应从不同居群中采集样本.随机抽样分析表明,40个左右样本可保留95%的遗传变异.  相似文献   

4.
红鳍东方鲀与假睛东方鲀的微卫星DNA多态性分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
为了对中国近海分布的红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)资源进行深入调查,以确定红鳍东方鲀与假睛东方鲀(Takifugu pseudommus)的种间关系,利用根据红鳍东方鲀基因组序列设计的9对微卫星引物,对野生红鳍(WR)、野生假睛东方鲀(WP)两个地理种群和一个养殖红鳍东方鲀(CR)群体进行了遗传多样性分析。结果表明:9对引物在三个群体中均表现为多态;共获得106个等位基因,每个位点的等位基因数目在5~25之间,9个位点在三群体观测杂合度的范围从0.8167到1.0000,三群体平均杂合度观测值E,排列顺序为wR(0.8661)〉WP(0.8272)〉CR(0.7832);3个群体之间的遗传距离较小,其中WR和WP群体间的遗传距离最小(0.0586),WR和CR群体的遗传距离最大(0.0923);3群体的遗传分化系数Gsr很小,其中,WR和WP两群体间遗传分化系数最小(0.0177),WR和CR群体间的遗传分化系数最大(0.0290),与遗传距离的分析结果相一致。群体遗传结构的分析结果表明:红鳍东方鲀养殖群体遗传多样性显著下降,应及早加强对其种质的保护;从分子遗传学的角度来看,红鳍东方鲀与假睛东方鲀应为同一个种。  相似文献   

5.
精子冷冻保存对大菱鲆后代遗传结构影响的微卫星分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
用微卫星技术对大菱鲆冻精和鲜精受精鱼苗的遗传结构进行了分析比较,以期间接地检验冷冻保存没有对精子的遗传结构产生影响。精子冷冻按三步法进行,冻后成活率为65%(对照为85%)。精子在液氮中保存半小时后解冻授精,冻精受精率和孵化率与鲜精的没有显著差异。实验用冻精和鲜精受精鱼苗各15条,且来自相同的父母本,这减少了亲本遗传结构不同对实验结果的干扰。10对微卫星引物的分析结果显示,15条鲜精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5747;15条冻精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5714。在鲜精受精大菱鲆和冻精受精大菱鲆的30个等位基因中,只有7个等位基因的频率发生了比较显著变化。  相似文献   

6.
人工诱导牙鲆异质雌核发育群体的微卫星标记分析   总被引:14,自引:0,他引:14  
采集牙鲆成熟精、卵,通过紫外线照射精子和冷休克处理受精卵,经形态学和染色体计数检测获得了异质雌核发育牙鲆群体,采用筛选获得的10对高多态性的微卫星引物对该群体进行了遗传变异分析。结果为:10对引物中,Po91可能因为出现了无效等位基因而没有扩增产物,其余9对引物全都扩增出目的片段,其中7对表现出多态性,其多态座位比例为77.8%,平均杂合度为0.3856,明显低于自然和养殖群体;在具多态性的7个基因座位上均发生了基因一着丝点之间的重组,重组率在42.6%~100%之间。通过抑制第二极体排出获得的牙鲆雌核发育群体在个体和群体水平尚具有一定的基因杂合。  相似文献   

7.
丝羽乌骨鸡微卫星多态性及其与产蛋性能的关系   总被引:5,自引:0,他引:5  
选用12个微卫星标记,通过对丝羽乌骨鸡多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度。通过标记多态性与产蛋性状的最小二乘分析和多重比较,进行了分子标记与产蛋性状的相关分析。结果表明,12个微卫星标记中,9个表现出丰富的多态性。微卫星标记座位平均检测到4.5556个等位基因(3~7个)。9个微卫星标记平均多态信息含量为0.6072。标记平均杂合度为0.7423。通过最小二乘分析,检测到4个标记G31913、X82867、Z95315、G01672与3种性能指标(4个月连产蛋量、开产蛋重、500天产蛋量)存在显著相关。标记G31913中基因型AB的开产体重最小二乘均值最高,Z95315的基因型CC的开产蛋重、开产体重最小二乘均值最高,标记G31913的基因型AB和标记Z95315的基因型CC有望作为开产蛋重、开产体重早期选择辅助标记,标记X82867基因型为CD的产蛋量较低,而基因型为AB的产蛋量相应较高。  相似文献   

8.
采用AFIP分子标记技术对我国海湾扇贝的4个不同地理群体共80个个体利用7对引物组合进行了遗传多样性分析。4群体的多态位点比例分别为:加拿大养殖群体48.8235%,墨西哥湾养殖群体49.2914%,秦皇岛养殖群体38.2353%,浙江养殖群体41.1765%。平均杂和度分别为0.1878,0.1886,0.1265和0.1618。遗传距离介于0.1188~0.0941之间。4个群体的Fst为0.1883。根据遗传距离绘制了UPGMA聚类图。4个群体间的遗传关系如下:加拿大群体和浙江群体聚为一支,墨西哥湾群体和秦皇岛群体聚成一支,最后这两支聚在一起。试验结果表明,经过长时间累代养殖的浙江、加拿大、墨西哥湾群体仍保持较高的杂合度,与引种时间最短的(2年)、最为接近美国自然群体的秦皇岛群体比较,以上3个群体没有出现多态位点比例和杂合度显著下降的现象。  相似文献   

9.
采用基因组荧光原位杂交(GISH)技术,结合改进的染色体滴片和压片法,对栉孔扇贝和虾夷扇贝远缘杂交正、反交子代4-8细胞胚胎及担轮幼虫的染色体构成及其变异进行了研究.结果表明,在染色体数目上,绝大部分正、反交子代早期胚胎的染色体数目为38条,与其双亲一致; 在染色体构成上,绝大部分正、反交子代分别继承了栉孔扇贝和虾夷扇贝各一套染色体,为真正的杂交种,核型也为双亲染色体核型的综合:2n=6m 29(sm,st) 3t;正、反交子代之间在染色体构成上无明显差别,结果说明两种扇贝的属间杂交正反方向均能产生正常的杂交种胚胎,合子中两套染色体具有较强的亲合性.此外,杂交子代在胚胎发育早期还存在较小比例的染色体数目异常、不对称染色体继承等遗传学现象.在群体杂交所产生的正反交子代中还存在极小比例的疑为雌核发育的母本类型个体,但在单对杂交产生的正反交子代中均未见雌核发育的个体.本文就这些异常现象产生的可能原因进行了探讨.  相似文献   

10.
通过在连续-非连续单元方法(CDEM)中引入朗道点火爆炸模型及岩体塑性-损伤-断裂模型,实现了赤铁矿爆破破碎过程的模拟。提出了5个评价爆破后块度分布特征的指标,分别为平均破碎尺寸(d50)、极限破碎尺寸(d90)、块体不均匀系数(d90/d50)、系统破裂度(Fr)及大块率(Br)。基于CDEM方法及上述5个评价指标,分析了改变炮孔直径、改变间排距等两种改变炸药单耗的方式对赤铁矿爆破块度的影响规律。数值计算结果表明:随着炸药单耗的增大,赤铁矿的破碎尺寸逐渐减小;相同炸药单耗情况下,改变炮孔直径的破碎效果略优于改变间排距的破碎效果。在双对数坐标下,随着炸药单耗的增大,平均破碎尺寸(d50)及极限破碎尺寸(d90)均线性减小;采用衰减型幂函数进行了拟合,给出了平均破碎尺寸(d50)及极限破碎尺寸(d90)与炸药单耗间的函数关系。随着炸药单耗的增加,块体不均匀系数(d90/d50)及系统破裂度(Fr)均逐渐增大,而大块率(Br)则迅速减小。当炸药单耗大于0.25 kg/t时,大块率(Br)已经小于0.5%;当炸药单耗超过0.6 kg/t时,大块率(Br)为0.0%。  相似文献   

11.
泥蚶遗传多样性的研究   总被引:5,自引:0,他引:5  
采用垂直聚丙烯酰胺同工酶电泳技术对我国及周边海域的7个泥蚶群体的11种同工酶、近28个位点的表型变异及遗传分化进行了研究,结果发现,绝大多数同工酶在7个群体之间谱型上都存在较大差异。遗传变异统计结果表明:7个泥蚶群体多态位点比例(P.99)和(P.95)分别在39.3%~53.6%和28.6%~44.4%之间;平均杂合度观测值在0.035~0.083之间,平均杂合度预期值在0.086~0.186之间;而平均位点等位基因数在1.786~2.381之间。比较了7个群体之问的遗传相似度和遗传距离表明,7个泥蚶群体明显地分为两大类群,第一个类群包括釜山、荣成、奉化、乐清、福鼎5个群体,它们的平均遗传距离是0.0072;第二个类群包括汕头和湛江两个群体,它们的遗传距离是0.0320;而这两个类群问的不同群体问的平均遗传距离为0.4279。因此这两个类群的分类学地位值得进一步探讨。  相似文献   

12.
水稻细菌性条斑病抗性基因定位   总被引:6,自引:0,他引:6  
以高感和高抗细菌性条斑病(细条病)的两个籼稻品种H359和Acc8558为亲本,建立了一个重且自交系群体。利用该群体构建了一张包含225个分子标记的连锁图。1996年和1997连续两年对该群体进行了细条病抗性鉴定。采用t测验法、复合区间定位法及多性状复合区间定位法对细条病抗性基因(QTL)进行了定位分析。共检测出11个QTL,分别位位于第1、2、3、4、5、7、8和11号染色体上,效应大小彼此接近  相似文献   

13.
This research explored the changes in genetic diversity and spatial distribution of microbial communities in association with the changes in phenol concentration during a bioremediation process. Results using the traditional plate count method indicated an increase of average bacteria densities in groundwater from 10(4) to 10(7)CFUml(-1) initially to 10(7) to 10(9)CFUml(-1) after remediation. The diversity and stability of phenol-degrading bacterial communities were investigated by using single-strand-conformation polymorphism (SSCP) genetic profile analysis of 16S rDNA fragments amplified from groundwater samples. The molecular data showed a high degree of genetic similarity between communities from certain monitoring wells during the early phases of remediation, probably due to similar initial physical conditions among wells. Molecular signatures of several cultivated phenol-degrading bacterial strains could be seen in most groundwater profiles throughout the study period, suggesting that these strains were indigenous to the study site. It was also observed that the species diversity of these microbial communities increased as the phenol levels in the groundwater decreased during the 9-month study period, and recovered to the pre-treatment levels after the remediation program was completed.  相似文献   

14.
应用RAMP分子标记探讨仲彬草属的种间关系   总被引:15,自引:0,他引:15  
对仲彬草属Kengyilia14个种和1个变种进行了RAMP分析。结果表明物种间遗传差异明显。40个引物组合产生的254条DNA扩增片段中,216条(85.0%)具有多态性,每个引物组合可扩增出l一9条多态性带,平均5.4条。遗传相似系数变化范围为0.327—0.886,平均值为0.549。同时,形态相似、地理分布一致的物种有一定的亲缘关系,聚类在一起。这与RAPD、形态学和细胞学等分析结果基本一致。因此,RAMP评分子标记是评价仲彬草属种间关系十分有效的方法。  相似文献   

15.
The purpose of this study was to investigate the most suitable polymer material for supporting stem cell growth as a myocardial patch. After cell isolation and expansion of mouse bone marrow mesenchymal stem cells (BMSC), the cells were induced to differentiate into cardiomyocytes with 5-azacytidine to determine their differentiation potential. BMSCs were also seeded onto three types of polymer material film, including polyurethane (PU), 3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate [P(3HB-co-4HB)], and polypropylene carbonate (PPC). The results revealed that cell numbers were more abundant on both the PU and P(3HB-co-4HB) material surfaces. Conversely, the surface of PPC was smooth with only cell lysate debris observed. The average cell counts were as follows: 143.78 ± 38.38 (PU group), 159.50 ± 33.07 [P(3HB-co-4HB) group], and 1.40 ± 0.70 (PPC group). There was no statistically significant difference in cell numbers between the PU and P(3HB-co-4HB) groups. A statistically significant difference was identified between the PPC group and both the PU (P1) and P(3HB-co-4HB) groups (P2). Polymer biomaterial patches composed of PU and P(3HB-co-4HB) permit good stem cell growth. P(3HB-co-4HB) has the potential for development as a clinical alternative to current treatment methods for the regeneration of cardiomyocytes in patients with myocardial infarction.  相似文献   

16.
The monetary value of the man-mSv for operators of Korean nuclear power plants (NPPs) was calculated using a radiation aversion factor based on a survey of NPP workers. Initially, the life expectancy in the population is 79.4 y, the average age of cancer occurrence is 60 y, the average annual wage for an electric worker is 56 000 $ y(-1) and the nominal risk coefficient induced by radiation is 4.2E(-5) mSv were used to evaluate the basic monetary value (α(base)) resulting in 45.6 $ mSv(-1). To investigate the degree of radiation aversion, the subject of the investigation was selected as the working radiation workers in 10 NPPs in Korea (Kori 1-2, Yeonggwang 1-3, Ulchin 1-3 and Wolseong 1-2). In August 2010, with the cooperation of KHNP and partner companies, a total of 2500 survey questionnaires to 10 NPPs (or 250 surveys to each NPP) were distributed to currently employed radiation workers. From these, 2157 responses were obtained between August and October 2010. The assessed radiation aversion factor and the monetary value of the man-mSv from the calculated radiation aversion factor were 1.26 and ~50 $ in the 0-1 mSv range, 1.38 and ~200 $ in the 1-5 mSv range, 1.52 and ~1000 $ in the 5-10 mSv range, 1.65 and ~4000 $ in the 10-20 mSv range and 1.74 and ~8500 $ >20 mSv.  相似文献   

17.
测定了节旋藻属3个品系和螺旋藻属1个品系的全长16SrRNA基因基因和16S rRNA转录单元内间隔区序列(ITS),分析了已知的节旋藻、螺旋藻和相关品系的相应序列的同源性,构建了系统发生树,并评价了这两段DNA序列在节旋藻、螺旋藻种属分类和种质鉴定中的意义。结果表明:(1)16SrRNA基因序列和ITS序列均可用于节旋藻属和螺旋藻属的属间分类,以两序列为基础的系统学分析结果一致;(2)ITS序列变异程度高于16SrRNA序列,适用于节旋藻和螺旋藻属内品系或种质鉴定;(3)节旋藻属可明确界定,16SrRNA基因序列相似性大于98%,ITS序列相 似性大于88%;(4)螺旋藻属某些品系间16SrRNA序列和ITS序列相似性较低,与不同属间的序列相似性程度为同一水平。  相似文献   

18.
An approach to genetic identification using biallelic single-nucleotide polymorphism (SNP) genetic markers is described in which the three possible genotypes, AA, Aa, or aa, where "A" and "a" represent the two SNP alleles, are assigned a ternary (base 3) digit of 0, 1, or 2, respectively. Genotyping an individual over a panel of separate SNP markers produces a composite ternary genetic code that can be converted to an easily stored, decimal (base 10) genetic identification number. The unambiguous identification of 11 individuals is demonstrated using ternary genetic codes generated from MALDI-TOF mass spectrometric genotyping data from 7 different SNP markers.  相似文献   

19.
五个紫菜品系间遗传差异的RAPD分析   总被引:23,自引:1,他引:22  
应用随机引物扩增片段多态性(RAPD)技术对2种紫菜的5个品系进行遗传多样性分析。共筛选出21条随机引物,PCR反应得到147条扩增片段。根据共享扩增片段计算遗传相似性指数(F)和相对遗传距离,利用NJ法构建系统树。结果表明,条斑紫菜或坛紫菜的养殖品系首先聚类在一起,两个条斑紫菜养殖品系之间的遗传距离是0.32,两个坛紫菜养殖品系之间的遗传距离是0.31。条斑紫菜养殖品系CPY1-08A与坛紫菜养殖品系CPH8-83之间的遗传距离最大,达0.42。本文结果显示RAPD可以作为简便有效的分子工具应用于紫菜的遗传多样性和种质鉴定研究中。  相似文献   

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