大曲高温放线菌CICC 10681在不同温度下的脂肪酸代谢变化

通过RNA-seq结合实时荧光定量PCR研究了不同温度下大曲高温放线菌脂肪酸代谢相关基因差异表达,并利用气相色谱结合Sherolock全自动细菌鉴定系统研究了不同温度大曲高温放线菌脂肪酸的组成变化。结果表明:与45℃相比,大曲高温放线菌CICC 10681在55℃和60℃时与脂肪酸合成相关基因平均上调表达7. 3和8. 4倍,与脂肪酸分解相关基因平均下调表达7. 3和7. 6倍,与支链氨基酸分解相关基因平均下调表达5. 3和6. 0倍,与乙酰辅酶A合成相关基因平均上调表达2. 7和3. 1倍。大曲高温放线菌主要以饱和的直链和支链脂肪酸为主,随着温度升高,支链饱和脂肪酸呈下降趋势,直链饱和脂肪酸呈上升趋势。与45℃相比,大曲高温放线菌在60℃条件下的C_(16∶0)和C_(18∶0)的含量分别升高了1. 6和10倍。     

Halogranum amylolyticum TNN58全基因组测序及PHBV代谢途径分析

解淀粉盐颗菌TNN58(Halogranum amylolyticum TNN58)是一株极端嗜盐古菌,它可以利用葡萄糖积累3HV摩尔分数高达20%的PHBV。首次通过鸟枪法对H.amylolyticum TNN58进行了全基因组测序,利用Velvet软件进行组装,得到32个支架序列,整个基因组大小约为4.71Mb,测序深度为218X。通过对基因组数据进行分析,发现该菌株PHA合酶由pha E和pha C两个亚基组成,存在4条3-HV的供应途径,同时发现该菌株不存在乙醛酸循环途径,但存在甲基天冬氨酸循环途径作为乙酸盐的回补利用途径。本研究的结果为揭示H.amylolyticum TNN58的PHBV合成机制和后续的功能基因组学研究的提供了数据。     

贵州省遵义地区3 个酱香型大曲细菌群落的比较分析

研究酱香型大曲主要产地遵义地区的细菌类群组成,并利用主成分分析法对这些细菌的类群和大曲的关系进行评定。样品采用454 FLX＋平台进行测序,样品中所测微生物为细菌,测序片段为16S rDNA V3～V5区,所有样品的优质序列按97%的相似度进行聚类,计算这些细菌类群的相对含量。用主成分分析法对细菌类群和大曲样品进行分析,结果显示：从3 个大曲样品中共检测出6 个门49 个属细菌,主要是厚壁菌门;样品MT01以高温放线菌属（Thermoactinomyces）34.40%、芽孢杆菌属（Bacillus）31.40%、Scopulibacillus 13.60%为主,占总量的79.40%,样品ZJ01以高温放线菌属（Thermoactinomyces）34.80%、芽孢杆菌属Bacillus 49.00%为主,占总量的84.80%,样品ZX01以高温放线菌属（Thermoactinomyces）66.10%为主;对3 个大曲样本进行主成分分析,发现棒状杆菌属（Corynebacterium）、魏斯氏菌属（Weissella）是影响样品MT01与ZJ01距离最近,ZX01相对距离较远的细菌类群。     

蜡样芽孢杆菌GW-01全基因组测序及生物学特性分析

目的：通过全基因组测序和生物信息学,研究前期筛选可降解高效氯氰菊酯（β-CY）蜡样芽孢杆菌GW-01的基因组序列信息和生物学特性,为其安全性评估提供参考。方法：利用HPLC验证了GW-01降解β-CY的能力。GW-01的整个基因组基于二代Illumina NovaSeq与三代PacBio Sequel测序平台相结合的测序技术,对菌株GW-01进行全基因组测序,并对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、碳水化合物活性酶预测、毒力因子和抗生素抗性分析,此外,还基于gyrA基因序列对菌株GW-01构建系统发育树。结果：GW-01在第6 d可降解48.4%的β-CY;GW-01菌株全基因组大小为5244145 bp,基因组类型为环状,平均GC含量36.43%,共编码5314个基因,含有104个tRNA基因,313个ncRNA,GW-01菌株全基因组序列在GO、KEGG、COG、NR和Swiss-Prot、CAZy、VFDB、CARD数据库分别注释到基因3536、4714、4434、5290、3854、135、263和96个,GW-01与其他四个近缘菌株相比显示出高GC含量,并且毒力因子和...     

两株土壤放线菌ZSM-1和ZSM-2的分离与鉴定

对分离自土壤的2 株编号为ZSM-1和ZSM-2的放线菌进行分类鉴定,提取基因组脱氧核糖核酸（deoxyribonucleic acid,DNA）后经聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）扩增菌株16S rDNA,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合培养特征、生理生化特征,将该2 株菌分别鉴定为纳士维尔链霉菌（Streptomyces nashvillensis）与土地戈登氏菌（Gordonia terrae）。     

1株T1样噬菌体vB_EcoS_IME18的分离鉴定及其受体分析

以大肠杆菌BL21为指示菌分离得到1 株噬菌体vB_EcoS_IME18（IME18）,通过电镜观察噬菌体形态,并测定其最佳感染复数、一步生长曲线、裂解谱和体外杀菌效果;使用Illumina MiSeq测序仪完成噬菌体全基因组测序,利用比较基因组学分析噬菌体基因组特征;通过筛选噬菌体抗性株分析其耐受原因,利用受体基因沉默突变实验、噬菌体斑点实验和噬菌体吸附实验验证噬菌体受体。结果表明,噬菌体IME18具有二十面体头部和非收缩性尾部,属于长尾噬菌体科,Tunavirinae亚科,T1类噬菌体;噬菌体IME18的最佳感染复数为0.01,潜伏期为5 min,裂解期50 min,爆发量高达223 PFU/cell;在体外,噬菌体IME18能在90 min内有效杀死处于对数期的BL21;噬菌体IME18基因组全长50 354 bp,G＋C含量为45.6%;蛋白FhuA、TonB在噬菌体IME18的吸附和侵染过程中发挥重要作用。     

高通量测序揭示高、低温季节下长牡蛎菌群变化

为解析高、低温季节对养殖长牡蛎（Crassostrea gigas）微生物群落组成,及微生物群落变化对长牡蛎品质和食品安全的潜在影响,利用16s扩增子高通量测序技术,对高温季节和低温季节采集自青岛鳌山湾的长牡蛎软体组织微生物群落结构进行分析。高通量测序结果表明,高温季节长牡蛎样本软体组织中的细菌群落主要由变形菌门（Proteobacteria,40.35%）、厚壁菌门（Firmicutes,19.87%）、放线菌门（Actinobacteria,12.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes,10.39%）组成;在属水平上优势菌为双歧杆菌属（Bifidobacterium,5.11%）、栖水菌属（Enhydrobacter,5.03%）、内源性单胞菌属（Endozoicomonas,4.81%）和甲基杆菌属（Methylobacterium,3.04%）。低温季节长牡蛎样本软体组织中细菌群落发生变化,放线菌门占比大幅降低至4.14%,蓝细菌门（Cyanobacteria,9.05%）占比由2.61%上升至9.05%;在属水平上鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas,21.13%）、蓝细菌（Cyanobacteria,7.70%）和支原体属（Mycoplasma,5.08%）占比上升,成为优势菌,而双歧杆菌属（0.58%）、栖水菌属（0.05%）占比大幅降低;弧菌属（Vibrio）在外套膜组织中占比最高,整体占比由高温季节的1.25%降低至0.10%,与传统培养结果一致。从高温季节到低温季节,长牡蛎样品中微生物群落丰富度略有增加,而多样性有所下降。该研究可为评估不同季节长牡蛎品质与安全的影响提供参考。     

全基因组测序和real-time PCR法检测食源性沙门氏菌parC、gyrA基因突变特征

以45 株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象,采取全基因组测序和实时聚合酶链式反应（real-time polymerase chain reaction,real-time PCR）法检测parC、gyrA基因突变位点,并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行评估和分析。首先将4 株沙门氏菌进行二代全基因组测序,根据测序数据分析结果,建立了一种real-time PCR法检测gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80Ile这4 个突变位点。将沙门氏菌进行qnrS、qnrA、qnrB的real-time PCR检测,发现有31 株菌未检出qnr基因。以这31 株菌为对象,采取real-time PCR法筛查基因突变位点,结果发现parC Thr57Ser和gyrA Asp87Asn型突变最常见。将real-time PCR阳性的10 株菌扩增parC、gyrA基因全长并测序,real-time PCR检测和测序结果完全吻合,说明了real-time PCR检测的可靠性。全基因组测序和real-time PCR法相结合的方法用于耐药基因突变筛查,既可以发现新的基因突变,又可以快速筛查大样本的主要突变类型,可作为沙门氏菌耐药性研究的一种可靠手段。     

基于高通量测序的烟草粉螟基因组初步研究

为研究烟草粉螟基因组信息,基于低深度高通量测序,利用Illumina测序平台对烟草粉螟基因组进行了分析,采用K-mer法预测烟草粉螟基因组大小、杂合度和重复序列等基因组特征,并使用SOAP de novo软件对烟草粉螟基因组进行了初步组装。研究表明:(1)烟草粉螟预估基因组大小为546.4 Mb,杂合度为1.93%,重复序列比例为48.59%,GC含量为36.9%,属于复杂昆虫基因组。(2)基因组初步组装后,得到3 192 823条Contigs,Contig N50为244 bp,组装质量较低。对烟草粉螟基因组的初步研究为后续获得高质量烟草粉螟全基因组信息提供了必要参考。     

美国发布全基因组测序技术应用问答

据美国食品药品管理局（FDA）消息,4月27日美国FDA发布全基因组测序技术（WGS）应用问答。全基因组测序技术通过对致病菌DNA化学构成的测序,揭示致病菌的基因指纹。例如近来它被用于鉴定3月份的一起李斯特菌疫情,将软奶酪中的致病菌与李斯特菌的基因指纹进行比对,进而做出判定。     

HPLC法测定小儿泻速停颗粒中儿茶素和表儿茶素的含量

目的建立测定小儿泻速停颗粒中儿茶素和表儿茶素含量的HPLC方法。方法采用Shiseido Capcell Pak C18色谱柱（4．6mm×150mm,5μm）;流动相为Ⅳ,N-二甲基甲酰胺-四氢呋喃（4：1）-0．04mol／L枸橼酸溶液（13：87）,流速1mL／min;检测波长280nm。结果阴性对照品与样品分离良好,儿茶素的线性范围为0．0646～1．6150μg,r=0．99996,表儿茶素的线性范围为0．0818～1．0225μg,r=0．99996。儿茶素的平均加样回收率为101．06％,RSD为1．71％;表儿茶素的平均加样回收率为99．13％,RSD为1．63％。样品溶液在8h内稳定。结论此方法简便、准确、可靠,可用于该制剂的质量控制。     

HPLC法测定蓝莓中绿原酸的含量

建立了高效液相色谱法对蓝莓中绿原酸含量的测定方法,采用Aglient C18(250mm×4.6mm,5um)色谱柱;流动相为乙腈:0.4%磷酸溶液为13:87;流速为1.0mL/min;检测波长:327nm。结果显示,绿原酸在浓度为3.3×10-3—40×10-3mg/mL范围内,线性关系良好(Y=61.07x+8.896,R2=0.99996),精密度RSD为3.33%,平均回收率为106.01%,RSD为1.22%。本方法简便,结果准确,重现性好,可以作为蓝莓中绿原酸含量检测的良好方法。     

偶数顶点不含四圈图的无符号拉普拉斯谱半径

G是一个简单图,矩阵Q（G）=D（G）＋A（G）记为图G的无符号拉普拉斯谱半径,其中D（G）和A（G）分别为对角元素为图G顶点度的对角阵和图G的邻接矩阵．本文证明了图G是偶数顶点不含四圈的图,G。是G中有最大无符号拉普拉斯谱半径的图,p＆G。的无符号拉普拉斯谱半径,则p3-p2,z-1）p＋1-或＋d∑（d。＋以）反≤0,对于u∈V（G。）．     

唾液乳杆菌XH4B的a-半乳糖苷酶纯化及性质研究

本研究通过超滤、SephedaxG200凝胶过滤层析纯化来源于唾液乳杆菌XH4B（GeneBank索引号：JXl25456）的a-半乳糖苷酶,并对其酶学性质进行了研究。结果表明,超滤时采用100kDa的滤膜,分子量大于100kDa的组分有酶活。利用SephadexG200进行柱层析洗脱至370-400min时得到的组分表现出明显的a-半乳糖苷酶活力。SDS．PAGE电泳结果表明,该酶的蛋白质单体分子量为70-80kDa,未变性的酶蛋白应为多聚体,总分子量大于100kDa。利用酶比活力计算的结果,相对于粗酶,超滤纯化效率为149．80％,柱层析纯化效率为391．91％。经响应面优化,确定唾液乳杆菌XH4B来源的a-半乳糖苷酶最佳酶促反应条件为：柠檬酸缓冲液pH值5．5,离子强度0．15mol／L,反应温度52℃。该酶对pNPG的Km值为0．817。相对于纯水,各类金属离子中,仅有心和Na＋对酶活力有正向的激活作用,酶活力分别达到了102．50％和104．18％。EDTA（96．54％）,Mg”（91．53％）,ca2＋（82．51％）,以及DTT（79．38％）能够较大限度保留酶活力,而Zn2＋、cu2＋、pb2＋、Fe3＋和vc则显著阻碍了酶促活力,仅能保留5-7％。     

一株蛋白酶产生菌的分离鉴定

从郑州奶牛场土壤样品中分离到一株芽孢杆菌,命名为A—19菌株。该菌株有较高的蛋白酶活性,37℃、pH7．0培养48h后,其蛋白酶活力可达63．5U/mL。菌体生长专性需氧,有运动性,粗糙型菌落,氧化酶试验阳性,DNA（G＋C）的摩尔分数为47％。该菌株的16SrDNA序列与芽孢杆菌属有很高的同源性,Bacillus vallismortis（99．61％）,B．subtilis（98．81％）,B．amyloliquefaciens（98．95％）,B．licheniformis（97．93％）。通过其生理生化特征和16S rDNA序列相似性的系统发育分析,确定A—19菌株属于芽孢杆菌属。该菌的16S rDNA序列已被GenBank收录,序列登陆号为EU561347。     

上半空间积分方程组正解的轴对称性

烄考虑上半空间R+n中积分方程组{u(x)=∫n R+(Gx,y)vq(y)dy,v(x)=∫R+n G(x,y)up(y)d y}正解的性质,其中G(x,y)是具有Dirichlet边界条件的超调和算子(-Δ)m的格林函数.采用积分形式的移动平面法,证明了指数12m p和q之一严格小于1,且在1/p+1+1/q+1+2m/n=1的情形下,方程组正解关于某一平行于xn轴的直线轴对称.     

榆耳液态发酵培养的优化及多糖的抑菌活性

对榆耳进行液态发酵培养条件的优化,并考察榆耳多糖的抑菌活性.采用响应面中心复合设计方案,确定了麦芽糖(X1)、豆粕(X9及维生素B6(X3)的加入量,运用二阶多项式回归模型进行响应值预测,并进行试验验证.结果表明,榆耳液态培养最优条件为麦芽糖12.96g/L,豆粕11.68g/L,维生素B6 159mg/L,配合无机盐的条件下榆耳菌丝体湿重为11.27g/100mL.多元二次回归模型为:Y=10.50+0.75X1+0.63X2+ 0.20X3+0.044X1X2-0.075X1X3+ 0.088X2X3-0.51X12-0.79X22-0.55X32,因变量的总变化中有92.57％可以由回归曲线解释.利用杯碟法考察榆耳多糖的抑菌活性,结果显示,榆耳胞内和胞外多糖对福氏志贺氏菌、枯草芽孢杆菌、鼠伤寒沙门氏菌及产气杆菌有较强的抑制效果.以上结果说明,利用麦芽糖、豆粕、维生素B6配合无机盐可获得较高产量的榆耳菌丝体,其胞内多糖和胞外多糖均有一定的抑菌作用.     

高效液相色谱法同时测定营养强化面包中脂溶性维生素

本试验建立了高效液相色谱法同时测定营养强化面包中3种脂溶性维生素—维生素A(视黄醇)、维生素E(α-生育酚)和维生素D3含量的方法,采用C18色谱柱,流动相为甲醇-水(98:2),检测波长300nm,流速1.6ml/min,各维生素的线性关系良好(R2≥0.9996),回收率88.5%～107.1%(RSD2.36%～4.14%)。本文详细说明标准品的处理和标定方法,结果表明,该方法准确可行。     

“根瘤菌＋Mo”菌剂和AM菌剂对花生生长和产量的影响

针对四川花生主产区酸性紫色土缺氮、磷、钼的现状,并依据“高效花生根瘤菌＋Mo”显著的增产效果和丛枝菌根（AM）真菌高效吸磷特性,分别将R（高效花生根瘤菌）＋Mo、AM菌剂（Clomusmosseae）、AM＋R＋Mo对盆栽花生进行处理。试验结果如下：（1）单接种G.mosseae能显著提高土著根瘤菌的结瘤能力,极显著提高盛花期植株含磷量。植株盛花期干重、叶绿素、总氮、总钾量高于单接种花生根瘤菌Spr4-5（R）和CK,且与CK达到显著或极显著水平。单接种根瘤菌Spr4-5比单接种G.mosseae增产10．1％,差异不显著;分别比CK增产52．5％、38．5％,差异均达极显著水平。Spr4-5和G.mosseae均是高效菌株。（2）Spr4-5和G.mosseae双接种比单接种Spr4-5或G.mosseae分别增产3．8％、14．3％,差异不显著;比CK增产58．3％,达极显著水平。（3）“AM＋Spr 4—5＋钼酸铵”菌剂处理比等钼量的“Spr4-5＋钼酸铵”菌剂的产量低,且达到极显著水平;G.mosseae对钼敏感;与供试根瘤菌正协同效果最佳的钼酸铵浓度为2‰。     

并流共沉淀法制备铜锡镧复合预合金粉末的研究

文章研究了Cu^2＋,Sn^2＋,La^3＋,OH^-,C2O2^4-,Cl^-,H2O体系中金属离子的分布特点、变化规律及pH值对Cu-Sn-La共沉淀过程的影响。本次实验的目标是制备Cu84.5Sn15La0.5预合金粉末。通过ICP-AES法测定了Cu-Sn-La预合金粉末前驱体的沉淀率。在空气气氛中铜锡镧复合氢氧化物煅烧成铜锡镧复合金属氧化物;在氢气还原气氛中,铜锡镧复合金属氧化物被还原为Cu84.5Sn15La0.5预合金粉末。用X射线衍射仪（XRD）分析其物相组成,扫描电子显微镜（SEM）观察其形貌特征。结果表明,通过共沉淀反应前的设计,可以控制预合金粉末的成分。