LAMP实时浊度法快速检测转基因玉米MON810

LAMP实时浊度法是采用环介导等温扩增（Loop Mediated Isothermal Amplification,LAMP）技术通过实时浊度仪实时检测反应过程中所产生的白色沉淀,从而实现对扩增全过程的监控,弥补了显色法只能观看反应终点的缺陷,使引物筛选和反应体系的优化有数据可依。本研究以转基因玉米MON810为研究对象,针对外源基因苏云金芽孢杆菌杀虫毒蛋白CryIA(b)与内源基因边界序列设计6条特异性引物,通过实时浊度法在63 ℃的恒温条件下完成检测,对检测的灵敏度、特异性、稳定性进行了评价。建立了转基因玉米MON810的LAMP实时浊度检测方法,该方法最低检出限为0.5%,与LAMP显色法和实时荧光PCR法进行结果比对,符合率为100%,经评价具有特异性高、稳定性强、准确简便等优点,非常适合转基因玉米MON810的快速检测,有较好的应用价值。     

LAMP实时浊度法快速检测肠出血性大肠杆菌O157的研究

采用环介导等温扩增(Loop Mediated Isothermal Amplification,LAMP)技术,利用实时浊度仪实时检测LAMP反应过程中所产生的焦磷酸镁白色沉淀,实现对扩增反应全过程的监控,建立食品中肠出血性大肠杆菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)O157的LAMP实时浊度法快速检测方法。针对EHEC O157抗原基因rfbE的序列设计4条特异性LAMP引物。通过实时浊度仪在恒温63℃下1小时完成检测,对方法的特异性、灵敏度、稳定性进行了评价,并进行了食品样品添加试验以评价其应用于实际样品的效果。结果显示,经优化后,该方法的最低检出限为2.8×103 CFU/mL,与PCR法灵敏度比较高100倍。样品添加试验能检出的最低添加菌量为2.8×102 CFU/25 g(或mL)。LAMP实时浊度法具有快速、灵敏、特异性高、操作简便的优势,为食源致病菌快速筛查提供了一种良好的检测模式。     

动物源性成分实时等温扩增检测方法的建立

目的建立一种实时荧光环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)快速检测动物源性成分的分析方法。方法根据鸡、鸭、牛、羊物种cytb、COX3、12S rRNA、cytb特异性基因分别设计LAMP引物,反应时加入荧光染料SYTO-9,在63℃条件下反应45min,通过实时检测荧光强度判断反应结果,并进行实时监测。结果实时荧光LAMP方法对鸡、鸭源性成分的检测灵敏度为1pg,对牛、羊源性成分的检测灵敏度为10pg。对熟肉制品中掺杂肉检测时,掺杂鸡肉、鸭肉、牛肉和羊肉的检出限为0.01%。结论该方法可用于快速检测肉制品中动物源性成分,具有操作简单、无需贵重仪器、反应过程可实时监控、灵敏度高和特异性强等优点,适合于基层监管部门的现场快速检测。     

实时荧光LAMP法检测罗非鱼污染金黄色葡萄球菌的研究

建立了实时荧光环介导恒温扩增技术(LAMP)检测罗非鱼中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的方法,并对方法的灵敏度和特异性进行了评价。针对金黄色葡萄球菌特异性耐热核酸酶ncu基因设计引物进行LAMP扩增。选取LAMP内外引物浓度比、d NTP浓度、Bst聚合酶用量、甜菜碱添加量、扩增温度和扩增时间6个因素进行单因素优化实验,优化确定了其LAMP扩增条件。在优化条件下,该方法的检测限为37 cfu/m L,方法对污染的副溶血弧菌、志贺氏菌、沙门氏菌和大肠杆菌4种病原菌均不呈现非特异性扩增,具有良好的特异性,同时结合实时荧光检测,可以较好地弥补LAMP终点显色无法区分非特异性扩增的缺点。结果表明,该方法用于检测罗非鱼中污染的金黄色葡萄球菌具有灵敏度高、特异性强、操作简便、快速的特点,在食品安全检测方面具有良好的实际应用前景。     

实时浊度LAMP法检测豆制品中转基因成分

通过设计转基因大豆内源基因(Lectin)、外源基因NOS和2个转基因大豆品系(GTS 40-3-2,MON89788)特异性LAMP引物,建立快速检测转基因大豆以及鉴定转基因大豆品系的LAMP体系,并选取国内豆制品利用CTAB法进行DNA提取,并针对上述基因进行PCR和LAMP扩增的对比,建立起了检测大豆制品中转基因成分的定性的LAMP方法。结果表明:4个LAMP方法均有较好的特异性,除了NOS、GTS 40-3-2的检测限为0.1%外,其他LAMP方法的灵敏度为0.01%,均能满足实际检测要求;在实时浊度LAMP法检测大豆制品转基因成分的鉴定中,传统的CTAB法能成功提取大豆粗加工制品的DNA,且DNA纯度能够进行核酸扩增反应。利用转基因外引物进行的普通PCR结果与实时浊度LAMP结果是一致的,说明建立的转基因实时浊度LAMP检测方法有很好的准确性。     

羊乳中牛乳成分的直接实时环介导等温扩增检测

根据线粒体保守序列选取牛、羊特异性引物,建立无需核酸提取的直接实时环介导等温扩增(LAMP)技术,用于羊乳中掺入牛乳成分的检测。结果表明,所建立的LAMP方法特异性好,对其他物种没有交叉反应及假阳性现象的发生,对牛、羊的检测灵敏度可达0.07 pg/μL和0.7 pg/μL,在掺假样品(即二元混合乳)中直接实时LAMP技术可检测到掺入1%的牛乳成分。通过对10种市售羊乳制品检测显示,直接实时LAMP方法与经DNA提取的实时LAMP方法检测结果一致。因此建立的直接实时LAMP技术无需核酸提取,样品经简单处理即可作为模板直接进行LAMP扩增,简化了样品前处理过程,缩短了检测时间,适用于羊乳制品中牛乳成分的快速检测。     

实时荧光等温扩增法检测4种常见食源性致病菌

目的建立实时荧光等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特氏菌4种常见食源性致病菌的分析方法。方法根据4种致病菌特异性基因合成LAMP引物,在反应前加入荧光染料,在63℃条件下反应45 min;反应结果可以根据扩增曲线变化直接判断。并通过在实际样品中添加标准菌株菌液,测定了其在增菌0、6、24 h的检测灵敏度。结果金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌等基因组DNA的LAMP检测灵敏度为1 pg,副溶血性弧菌的检测灵敏度为10 pg;在样品加标实验中,其灵敏度在6 h分别可达到101、100、100、102 CFU/mL。结论该方法用于食源性致病菌的快速检测,具有可实时监控反应过程、反应快速,灵敏度和特异性高等优点,适合于基层食品安全监管领域现场快速检测。     

食品中单核细胞增生李斯特菌DNA环介导恒温扩增快速检测方法的建立

基于单核细胞增生李斯特菌胞壁质水解酶iap基因,设计两对特异性引物,利用DNA环介导恒温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术,以扩增副产物焦磷酸镁实时浊度为判定标准,建立食品中单核细胞增生李斯特菌LAMP快速检测方法。结果显示,本LAMP方法特异性强,经过对29株细菌进行检测,所试单核细胞增生李斯特菌均为LAMP阳性,其他菌株为阴性;本LAMP方法对单核细胞增生李斯特菌纯培养菌的检测灵敏度为8CFU/管,对污染食品中单核细胞增生李斯特菌的检测灵敏度为12CFU/管。本研究建立的LAMP检测方法简便快速、结果判断直观。     

基于环介导等温扩增技术快速检测阪崎肠杆菌

为实现婴幼儿配方乳粉中阪崎肠杆菌快速检测,建立等温荧光扩增方法特异性检测阪崎肠杆菌。针对阪崎肠杆菌特异性保守ompA基因设计3套引物,通过引物筛选和反应体系优化,建立阪崎肠杆菌快速检测的实时荧光环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法。以人工污染方式检验该方法在乳粉中阪崎肠杆菌检测灵敏度和稳定检测限,并对比实时荧光LAMP法和国标法在48份市售婴幼儿配方乳粉中的实际检测效果。结果显示,筛选ompA-2引物扩增效率最优,且与常见食源性致病菌无交叉反应;建立的实时荧光LAMP法对人工污染乳粉样品中的阪崎肠杆菌检测灵敏度、稳定检测限分别为10~2 cfu/g和10~3 cfu/g;48份市售乳粉样品进行增菌12 h,实时荧光LAMP法检测结果与传统国标培养结果一致。建立的实时荧光LAMP方法将为阪崎肠杆菌快速检测提供有力手段。     

原料乳中志贺氏菌的实时荧光环介导等温扩增技术研究

为了建立原料乳中志贺氏菌快速检测的有效方法,提高志贺氏菌的检出效率。研究根据Gen Bank中志贺氏菌侵袭性质粒抗原H基因(ipa H),设计特异性LAMP引物,将SYBR GreenⅠ荧光染料结合到LAMP扩增技术中,通过实时荧光监测仪优化Mg~(2+)、d NTPs、温度和引物等反应条件,建立了实时荧光环介导等温扩增技术检测志贺氏菌的反应体系,对纯菌的菌悬液及原料乳人工污染样品中的志贺氏菌进行检测,并对该检测方法的特异性、灵敏度进行了研究,并与普通的LAMP检测方法进行比较。结果表明,该检测方法特异性强灵敏度高,纯菌的菌悬液灵敏度和人工污染样品的检出限都能够达到100 cfu/m L,且灵敏度高于普通的LAMP检测方法。综上所述,研究建立的实时荧光LAMP检测方法灵敏度高、特异性强、耗时短,且检测结果直观易于分析,适用于快速准确监测原料乳中志贺氏菌的污染情况。     

食品中牛奶过敏原成分LAMP检测方法的建立

目的 建立食品过敏原牛奶成分LAMP检测方法,并与实时荧光PCR(real-time PCR)检测方法比对。方法 针对牛线粒体细胞色素b(cyt-b)基因设计LAMP引物并建立反应体系,在特异性和灵敏度方面与real-time PCR检测方法比对。结果 本研究建立的LAMP方法检测9份不同品牌的牛奶和羊奶及其加工制品,没有出现交叉反应,具有良好的特异性。通过添加试验方法的检测灵敏度为0.5 %,与real-time PCR方法检测灵敏度相当。检测了69份实际样品,检测结果与real-time PCR检测结果一致。结论 本研究建立的食品过敏原牛奶成分LAMP检测方法简单经济,检测结果可靠,可有效缩短检测时间,适用于过敏原牛奶成分的检测,具有良好的应用前景。     

Development of a fimY-based loop-mediated isothermal amplification assay for detection of Salmonella in food

In this study, we developed a rapid and sensitive fimY-based loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay on a real-time turbidimeter platform for the detection of Salmonella in food. Since turbidity of the reaction mixture would increase in correlation with the DNA yield, real-time monitoring of the LAMP reaction was achieved by real-time turbidimeter. Time threshold values which indicate positive results for 81 Salmonella strains of different serotypes ranged from 36 to 40 min. For the 20 non-Salmonella strains, turbidity did not increase in the reaction mixture. When testing 10-fold serial dilutions of Salmonella Typhimurium-ATCC 14128 DNA by LAMP, the time threshold ranged from 36 to 52 min on the real-time turbidimeter. The detection limit was 13 cells per reaction in pure culture, up to 10-fold more sensitive than that of PCR. When applied in deli food samples, the LAMP assay was able to detect Salmonella even though the sample was contaminated with very low concentration after 3 h enrichment culture. Increase in turbidity was observed on real-time turbidimeter. Additionally, the LAMP results detected by naked-eye or turbidity consistently matched with each other. Results from this study showed that the fimY-based LAMP assay is an effective method for the rapid detection of Salmonella.     

环介导等温扩增方法在食品中沙门菌检测的应用和评价

将环介导等温扩增检测方法应用于食品中沙门菌的检验,并在检测方法特异性、灵敏度等方面与实时荧光PCR和传统检测方法进行比较。方法 针对沙门菌属高度保守的fimY基因设计环介导等温扩增检测引物并优化反应体系,在特异性、灵敏度和实际样品检测等方面与实时荧光PCR及传统检测方法比对。结果 本研究建立的LAMP方法检测沙门菌93株和非目标菌31株,具有良好的特异性。在纯培养、无需增菌情况下,其检测灵敏度为6.4×10²cfu/ml,与实时荧光PCR方法相当。食品基质添加试验中,环介导等温扩增方法检测低限为2cfu/25g样品;对45份实际食品样品检测结果表明,该方法实际样品检出率为11.1%,与实时荧光PCR及传统方法检测结果一致。结论 本研究建立的沙门菌环介导等温扩增检测方法具有良好的特异性,检测灵敏度与实时荧光PCR相当,适用于沙门菌的快速筛选。     

副溶血弧菌tdh基因LAMP检测技术的建立

环等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种在等温条件下高特异性、高效、快速地扩增靶基因的DNA扩增技术。根据副溶血弧菌特异性的毒力基因tdh保守序列,本文设计1套特异性引物对该基因进行环等温扩增,同时对反应条件进行优化,建立携带tdh基因的致病性副溶血弧菌的LAMP快速检测技术。结果表明,LAMP最适反应在60.8℃恒温、45min内完成,与其它常见的细菌无交叉反应。LAMP方法的细菌DNA最低检出限为35.5fg/反应管,灵敏度较PCR方法高10倍。对扇贝样品中分离的菌株的检测表明,LAMP方法对检测致病性副溶血弧菌具有良好的可靠性。     

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for rapid detection of cry1Ab gene in transgenic rice (Oryza sativa L.)

The cry1Ab gene is a foreign gene which encodes Bt insecticidal Cry1Ab protein and was transferred into genomic DNA of plants to acquire insect resistance. Here a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay with high specificity and rapidity under isothermal conditions was developed for detecting cry1Ab gene in transgenic rice. Partial sequence of cry1Ab gene was used as the target template to design LAMP primers. The reaction conditions were optimized as follows: 60 min of reaction time, 1:3 of outer primer and inner primer concentration ratio, 25 μL of reaction volume and 0.6 μM of betaine. The results of detection could be evaluated by the white precipitate or the fluorescence intensity under ultraviolet irradiation, both visible to naked eyes. The sensitivity and specificity of the LAMP assay were further analyzed in comparison with that of regular PCR and real-time PCR. The results showed that the LAMP assay exhibited high specificity and the sensitivity of 3 × 10² copies number of the positive control plasmid, and of 0.5 % genetically modified (GM) contents. In comparison with real-time PCR method, LAMP showed the same results with simple instruments. The amplified reaction could be accomplished in about 1 h, with the results visible to naked eyes. Hence, the LAMP assay developed by this study can provide a rapid and simple approach for detecting cry1Ab gene from transgenic rice plants and rice ingredients in processed foods aimed at screening the growing transgenic crops in the fields and detecting genetically modified (GM) ingredients in imported and domestic foods.     

利用LAMP技术快速检测羊肉制品中的鼠源性成分

为实现羊肉制品中鼠源性成分的定性检测,基于环介导等温扩增（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）技术,以鼠的线粒体基因（大鼠环氧化酶基因KP244683.1和小鼠的16S rRNA基因KY018919.1）为靶标,分别设计相应的LAMP特异性引物,通过优化反应条件,确定最佳LAMP反应体系。对混合模拟样品进行特异性、灵敏度和稳定性评估,应用LAMP和聚合酶链式反应检测方法分别对市售羊肉制品进行检测,对比分析检测结果。结果表明,本研究建立的LAMP方法特异性强,大鼠和小鼠的检出限分别为0.1%和0.5%,稳定性好,LAMP与聚合酶链式反应市售实际样本检测结果具有高度的一致性。因此,本实验建立的鼠源性成分LAMP检测方法操作简便、高效、准确,为鼠肉掺假快速诊断和基层诊断提供了新的选择,可作为羊肉制品中鼠源性成分的快速检测新方法。     

Visual and Rapid Detection of Two Genetically Modified Soybean Events Using Loop-mediated Isothermal Amplification Method

To develop effective alternatives for detecting genetically modified organisms (GMOs), we reported one optimized visual loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for the detection of exogenous DNA targets from two GM soybean events in this study. This isothermal amplification can be performed within 40 min without polymerase chain reaction (PCR) equipment and the derived LAMP products can be directly observed by naked eye employing SybrGreen I dye instead of conventional gel electrophoresis analysis. The limits of detection of these established visual LAMP assays were about 4 copies of haploid soybean genomic DNA, and which were much higher than those of reported conventional PCR assays. Furthermore, the high specificity of LAMP assays was determined. All the results demonstrated that the developed visual LAMP assays are convenient, cost-efficient, and rapid for on spot detection of GMOs.     

Rapid detection of Listeria monocytogenes in raw milk with loop-mediated isothermal amplification and chemosensor

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) allows a rapid amplification of nucleic acids under isothermal conditions. It can be combined with a rhodamine-based dual chemosensor for much more efficient, field-friendly detection of Listeria monocytogenes. In this report, LAMP was performed at 63 °C for 10 min, followed by a rapid reaction of DNA amplification and the byproduct, pyrophosphate ion, with a rhodamine-based dual chemosensor and Cu(2+) is visualized as a disappearance of red color. The detection limit of L. monocytogenes by the LAMP-chemosensor was 8 to 10 cells per reaction tube, and the total assay time including 10 min for rapid DNA extraction was approximately 30 min. Data on naturally contaminated raw milk samples indicated that the LAMP method was highly specific and sensitive, giving 100% concordance with the ISO 10560 reference method. The results showed that the LAMP-chemosensor method has the advantages of better sensitivity and speed and less dependence on equipment than the standard Polymerase Chain Reaction for specifically detecting low levels of L. monocytogenes DNA, and this can be useful in the field as a routine diagnostic tool. PRACTICAL APPLICATION: The LAMP-chemosensor method reported here provided a powerful tool for detection of L. monocytogenes in raw milk samples due to its specificity, sensitivity, and rapidity.     

环介导等温扩增技术快速检测植物蛋白饮料中大豆成分

目的 建立植物蛋白饮料中大豆成分环介导等温扩增（Loop-mediated isothermal amplificantion,LAMP）快速检测技术方法。方法 根据大豆Lectin基因保守序列,设计大豆成分环介导等温扩增检测特异性引物和反应体系,对方法特异性、灵敏度和稳定性进行测试,并以实时荧光PCR方法为参比方法,对32种植物蛋白饮料进行检测应用验证。结果 本研究建立的LAMP方法特异性强,稳定性好,最低检出限为0.1%（以质量分数计）;通过参比方法验证,方法特异性和灵敏度为100%,不存在假阳性和假阴性。结论 本研究建立的LAMP技术快速检测植物蛋白饮料大豆成分的方法具有操作简单、快速准确、检测成本低等优点,可为植物蛋白饮料大豆成分掺杂掺假提供一种快速检测方法。     

食品中芥末过敏原成分LAMP检测方法的建立

目的：建立食品过敏原芥末成分环介导等温扩增（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）检测方法,并与实时荧光-聚合酶链式反应（real-time polymerase chain reaction,RT-PCR）检测方法比对。方法：针对白芥的主要过敏原基因Sin A1,设计LAMP引物并建立反应体系,在特异性和灵敏度方面与RT-PCR检测方法比对。结果：建立的LAMP检测方法,经特异性验证,与所测试的13 种植物,无交叉反应。通过添加实验,方法的检测灵敏度为0.5%,与RT-PCR方法检测灵敏度相当。检测了25 份实际样品,检测结果与RT-PCR检测结果一致。结论：建立的食品过敏原芥末成分LAMP检测方法简单经济,检测结果可靠,可有效缩短检测时间,适用于芥末过敏原成分
的检测,具有良好的应用前景。