生物信息学

生物信息学(Bioinformatics)是生物学、数学和计算机科学交叉所形成的一门学科,它主要是运用信息科学和计算技术的手段,通过数据分析和处理,揭示海量数据间的内在联系和生物学含义,进而提炼有用的生物学知识。由于生物信息学是在20世纪90年代才出现的一门新兴学科,因此,许多挑战和尚待解决的问题吸引了生物学家、数学家、统计学家、信息学家等众多学者的广泛关注。《计算机教育》在2006年4月期的杂志上刊登了密苏里大学哥伦比亚分校许东博士的一篇名为《生物信息学与计算机科学》的论文,许多老师反映良好,并要求本刊再多介绍一些相关知识。…     

基于图划分的全基因组并行拼接算法

提出了一种基于图划分的全基因组并行拼接算法．该算法巧妙地将数据划分问题转化成图划分的问题，解决了传统数据划分算法中存在的节点负载不平衡的问题．同时，算法在建立关系图时有效地利用了WGS测序中所提供reads之间的长度信息和配对信息，使reads关系图能更准确地反映出数据之间的关系特性，从而提高了数据划分的准确性．实验结果表明，该算法可以准确地划分各种模拟数据、真实数据的数据集，相对于传统数据划分算法划分质量有了明显改善．     

Providing Source Code Level Portability Between CPU and GPU with MapCG

Graphics processing units (GPU) have taken an important role in the general purpose computing market in recent years.At present,the common approach to programming GPU units is to write GPU specific cod...     

COS:度量分布式大数据处理系统的效率

【目的】在大数据处理领域,分布式计算系统得到广泛应用,它们的可扩展性得到重点关注,但其绝对性能往往没有得到重视。我们希望提出科学合理、与时俱进的度量标准,对分布式系统的性能进行评估。【方法】本文通过对比特定任务的单机实现和分布式实现来讨论分布式系统的性能,提出COS(Configuration that Outperforms a Single machine)这一指标,来衡量分布式系统在达到单台机器的性能时,需要的硬件资源数量。我们选取k-means聚类和逻辑回归两个经典机器学习算法,对其进行单机多线程实现,并通过向量化计算、优化内存分配与访问等方式对性能进行了优化,为分布式多机系统的性能提供参考。【结果】以Apache Spark作为对标系统,实验发现无论是使用其原生编程接口,还是经过悉心优化的机器学习库,都要使用数倍甚至数百倍的机器,才能达到单机多线程实现的性能。【局限】分布式系统与单机实现进行性能对比并不是完全公平的,分布式系统的额外开销客观存在。【结论】但COS指标仍能反映分布式系统存在的绝对性能较差、没有充分利用硬件优势等问题。     

河道淤泥自保温烧结多孔砖生产技术

研究并提出了利用河道淤泥生产烧结自保温多孔砖的产品配方设计、孔结构优化设计、生产工艺及实际生产关键技术,并在砖厂成功烧制出性能符合GB 13544—2000《烧结多孔砖》要求的河道淤泥自保温烧结多孔砖。     

矿井噪声治理的分析与研究

针对矿井噪声进行具体的分析与研究,从而制定有效的控制措施,降低噪声,改善矿井的工作环境。     

中性束注入器抑制极电源技术研究

中性束注入(NBI)器抑制极电源是中性束电源系统的组成部分,输出电压能根据实验情况在1~5kV内可调且脉冲式输出,脉冲波形的前后沿时间不大于20μs。采用串联谐振变换技术和移相脉宽调制技术设计高压直流平台,然后使用真空四极管进行调制,满足波形上的参数需要。对有关主电路和控制方法进行了分析说明。初步实验证明该设计调整性能好,抗过载与短路能力增强,能在脉冲负载状态下运行,具有较好的NBI实验应用前景。     

大量程霍尔电流传感器带宽检测方法研究

针对检测设备的限制导致不能使用不同频率的大电流对大量程霍尔电流传感器的带宽进行测试的问题,设计一种带宽检测电路并探究大量程霍尔电流传感器的带宽与测试电流大小的关系。通过带宽检测电路将直流大电流斩波可以得到不同频率的大量程脉冲测试电流,该测试电流流经霍尔电流传感器和康铜丝阵列。根据-3 dB原则比较霍尔电流传感器输出信号幅值相对康铜丝阵列的失真程度,确定霍尔电流传感器的带宽。使用30～100 A不同大小测试电流对霍尔电流传感器的带宽进行测试,结果表明测试电流大小不同,大量程霍尔电流传感器的带宽不同,且随着测试电流的增大,带宽逐渐减小。     

温度对大型工件测量准确性的影响及对策分析

详细分析了影响大型工件现场检测准确性的主要因素,指出了温度是决定现场检测准确性的关键要素,论述了温度对测量结果影响的原因及两种解决方案。分析表明,采用温度修正法的解决方案将逐渐成为机床在线检测大型工件尺寸的首选方案。     

HL-2AMW级中性束注入系统弧流电源设计

中性束注入是磁约束受控核聚变实验装置中加热等离子体最有效的方法之一。针对中国环流器2号中性束大功率离子源的特点,从系统功能、主电路拓扑结构、控制硬件及控制时序等方面对弧流电源进行设计。整个电源由低位移相交流调压、高压隔离降压变压器、整流滤波和电流快速转移电路4部分组成。IGBT与电阻串联组成电流快速转移阵列电路,与离子源并联,可实现电流单次或多次快速转移、参数远程设定,有效用于强流离子束的引出和保护。选用DSP和CPLD电路技术实现低位与高位控制器。实验数据显示,该电源最大输出为200kW/1000A,纹波小于2％,开关上升下降时间达μs级。目前,该电源已安全运行3年,可靠性高,完全满足装置离子源及系统要求,也可应用于其它等离子体技术应用场合。