基于高通量测序分析结肠息肉患者肠道细菌群落结构

结直肠癌是胃肠道中最常见的恶性肿瘤,而结肠息肉尤其是腺瘤性息肉是结肠癌前病变的指征之一.作者采用基于16S rRNA基因的高通量测序技术,对收集自云南省第一人民医院结肠息肉患者粪便样品的细菌群落结构进行分析研究.不同患者粪便样品微生物群落存在较大差异,其中拟杆菌门、厚壁菌门以及变形菌门在7个样品中所占序列比例较高;在科的水平上,拟杆菌科、毛螺菌科、瘤胃菌科以及肠杆菌科为主;在属的水平上,所占序列比例较高的菌属为拟杆菌属(Bacteroides)、Clostridium Xl Va、Lachnospiracea科未分类属以及粪杆菌属(Faecalibacterium).部分结肠息肉患者肠道细菌组成与健康人群存在较大差异,分析结肠息肉患者肠道微生物群落组成,有利于发现早期癌症病变指征,为建立无创早期肿瘤诊断方法提供依据.     

利用高通量测序分析云南豆豉中细菌群落多样性

发酵食品是人类饮食的重要组成之一,其中豆豉风味独特,富含多种生理活性物质。微生物在食品发酵过程中起着极为重要的作用。作者选择云南豆豉为研究对象,使用焦磷酸高通量测序,可以全面地分析豆豉中的细菌群落,能够得到其中稀少群落(rare biosphere)的信息。乳酸杆菌是丰度最高的细菌,占总序列数的72%,在豆豉发酵中起重要作用;芽孢杆菌也是重要的细菌,占序列总数的10%。此外,还发现了属于人类致病菌(Shigella flexneri)和植物病原菌(Erwinia persicina)的序列,显示出传统方法制作的豆豉中存在着食品安全隐患。     

食源性致病菌活菌检测方法的应用现状及展望

传统的细胞培养方法是活体致病菌检测的"金标准"，但往往程序繁杂、耗时长。该文主要论述基于核酸[荧光定量聚合酶链式反应（quantitative polymerase chain reaction，qPCR）和信使PCR检测法]及噬菌体（噬菌体扩增法、噬菌体扩增与PCR/qPCR结合法、免疫测定或酶测定法及电化学噬菌体生物传感器法）两类非细胞培养的活菌检测方法，并对其在食源性致病菌活菌检测方面的应用及未来发展前景进行讨论，特别是基于噬菌体的方法，与传统检测相比在检测速度、灵敏度和特异性方面具有关键优势。     

红河传统发酵豆豉中高纤溶活性菌株的分离筛选及其纤溶酶基因分析

运用脱脂乳固体培养基及纤维蛋白固体培养基的两步分离筛选法,从云南红河传统发酵豆豉中分离筛选具有高产豆豉纤溶酶活性的菌株,同时对它们的豆豉纤溶酶基因进行克隆分析,以期为新型功能性豆豉的研发提供备选菌株及理论依据。研究结果表明,两步分离筛选法能有效地从云南红河传统发酵豆豉中筛选到高产豆豉纤溶酶的菌株Bacillus subtilis LC-2-1,对该高产菌株的豆豉纤溶酶成熟肽基因分析及预测结果表明,菌株B subtilis LC-2-1确实能分泌一种由825个碱基编码275个氨基酸残基且分子量约为27.4kDa的豆豉纤溶酶,与纳豆激酶及其他豆豉纤溶酶相比差异显著,同源性仅为85.1%。同时其豆豉纤溶酶活性分析结果则表明,菌株B subtilis LC-2-1所产纤溶酶活性较高,可达79.84 U/mL。因此,本研究结果将为新型且具有溶血栓功能发酵豆豉的研发提供备选菌株及理论依据。     

利用高通量测序分析云南两个地区豆豉微生物群落的多样性

豆豉是一种具有独特风味的传统发酵食品。研究豆豉的微生物群落多样性,对于提高豆豉质量和食用安全性具有重要意义。本研究分别采取云南西双版纳州的景洪市和勐海县的两个豆豉样品,提取DNA,PCR扩增细菌16S r DNA和真菌ITS区域并进行焦磷酸测序,通过分析测序所得结果比较两个豆豉样品中的细菌和真菌群落多样性。结果表明:景洪样品的最优势细菌是Leuconostoc mesenteroides,其次是Leuconostoc fallax。勐海样品中丰度最高的细菌是Staphylococcus gallinarum,其次是Tetragenococcus halophilus。两个样品中都含有少数序列与能够产细菌素的Weissella confusa和Weissella cibaria具有较高相似性。两个样品的优势真菌都是耐盐的Candida etchellsii和Candida versatilis。总之,西双版纳的豆豉具有较高的微生物群落多样性,以嗜盐菌居多。     

汾酒大曲和酒醅样品DNA提取方法的优化

以汾酒不同发酵时期的酒醅、不同制作过程中的酒曲以及制曲环境样品为材料,采用酶物理化学法与物理化学法两种方法对不同样品DNA进行提取,实验结果表明,采用酶物理化学法获得了质量及纯度较好的DNA。后续实验表明,酶物理化学法提取获得的高质量DNA能全面反映汾酒酿造过程中的微生物群落结构多样性。     

模拟高原条件下含氧燃料对发动机性能的影响

以掺混不同体积分数(5%、10%)二乙二醇二甲醚(DGM)的柴油为燃料,采用F6L913柴油机进行发动机台架试验,通过控制进气压力模拟高原地区柴油机的工作条件,考察了海拔2000~4000 m下不同掺混比例的含氧燃料对发动机性能的影响。结果表明,在海拔2000 m以上地区,发动机燃用含氧燃料的功率均大于燃用纯柴油,且功率会随燃料中DGM添加量的增加而增大;海拔越高,转速越大,燃用含氧燃料时发动机动力性越好。在海拔2000 m以上地区,发动机燃用含氧燃料的燃油消耗率比燃用纯柴油低,且会随着海拔的升高和DGM添加量的增加而明显降低;含氧燃料可以显著降低柴油机高原地区碳烟、HC、CO的排放,NOx排放有所增加。在高原地区使用高含氧燃料是恢复柴油机性能的有效方法。     

不同植物乳杆菌发酵液抑菌活性及其主要有机酸组成比较

对分离自云南传统发酵食品的18 株植物乳杆菌代谢产物的主要有机酸成分及对病原菌抑菌活性进行分析。采用Spot-on-lawn及琼脂扩散法研究不同植物乳杆菌代谢产物抑菌活性;通过高效液相色谱法分析主要有机酸的种类和产量;选取其中3 株植物乳杆菌对其进行包括生长曲线、pH值、抑菌活性在内的动态监测。结果表明,抑菌活性取决于不同的植物乳杆菌菌株、病原菌及发酵碳源。当大肠杆菌O157:H7作为病原菌、葡萄糖作为碳源时,植物乳杆菌YmL-4-5具有最高的抑菌活性;当沙门氏菌ATCC 6538作为病原菌、果糖作为碳源时,植物乳杆菌S5抑菌作用最强。数据证明植物乳杆菌发酵液的抑菌活性受上清液低pH值的影响,且主要抑菌物质为有机酸。有机酸的主要成分是乳酸（930.9～3 008.7 μg/mL）,其次为苹果酸和乙酸。其中乳酸和乙酸的产量与其对大肠杆菌O157:H7的抑菌活性呈正相关（r分别为0.474、0.488,P＜0.05）。本研究为研发新的生物防腐剂提供了理论依据。     

具有高效ACE抑制活性乳酸菌的筛选及其益生特性研究

本研究运用紫外分光光度法初筛,再以HPLC法进行复筛,从31株源自云南传统发酵食品的乳酸菌中筛选具有高效ACE抑制活性菌株,同时研究其益生特性及脱脂乳发酵过程中ACE抑制率的动态变化。综合各项研究结果,最终筛选出ACE抑制率较高、抑菌谱广、耐酸耐胆盐性强,且对抗生素敏感的Lactobacillus plantarum YM-4-3作为研究菌株。益生特性研究表明,该菌株对Escherichia coli O 157:H 7和Listeria monocytogenes的抑菌圈直径可分别达41.30 mm和42.00 mm,甚至在高胆盐(0.3%)及强酸(p H 2.5)处理后仍保持较高活菌数(大于105 cfu数量级)。脱脂乳发酵过程中ACE抑制活性的动态监测表明,37℃发酵48 h是Lb.plantarum YM-4-3菌株发酵产生ACE抑制肽的最适培养条件,该发酵条件下获得的发酵乳的ACE抑制率可高达81.23%,菌体生物量、游离氨基酸及多肽含量也均达到最大值。本研究成果将为新型具有高效ACE抑制活性发酵乳制品的研发提供理论依据及菌株保证。     

缺氧条件下含氧燃料燃烧性能研究

采用低压氧弹法模拟高原缺氧条件下燃料的燃烧状况,选择二乙二醇二甲醚、己二酸二乙酯、生物柴油作为含氧添加剂,分别以不同配比掺混到柴油中,研究了这3种含氧添加剂在缺氧条件下的助燃性能,并采用燃烧改善系数作为评价指标来评价它们的助燃效果。结果表明：在缺氧条件下,加入3种含氧添加剂均能不同程度地提高燃料的燃烧性能;助燃作用的大小与添加剂本身的热值和含氧量有关;在海拔3 000 m处,最优含氧添加剂是二乙二醇二甲醚,其最佳添加量(w) 为18%。