酱香型白酒窖底泥微生物组成分析

对酱香型白酒发酵窖池中不同时间的窖底泥及环境土样中的微生物区系构成进行了测序分析。扩增样本中细菌16S r DNA的V6区并采用Illumina高通量测序平台进行深度测序。结果表明,酱香型白酒厂周边土壤中的微生物多样性极其丰富,相比窖底泥中的微生物组成更加复杂。在土壤驯化成窖底泥的过程中,微生物的复杂度逐渐降低,随着窖底泥的不断驯化,Lactobacillaceae(乳杆菌科)、Clostridiaceae(梭菌科)和Ruminococcaceae(瘤胃菌科)等厌氧微生物逐渐成为主要优势种群。土壤微生物为窖底泥驯化提供了重要的微生物来源,酱香型白酒生产地域周边土壤对于窖底泥的形成具有一定的影响。     

美藤果油研究进展

该文概述美藤果起源及国内外资源分布情况,介绍美藤果油制备工艺及理化性质,并分析其安全性和营养作用,为美藤果油进一步研究、开发利用提供参考。     

DNA条形码技术在深圳鱼肉制品鉴定中的应用

以线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ ）基因为目标基因,应用DNA条形码技术鉴别深圳批发市场和超市零售鱼肉制品的种类来源,判别其产品标签是否正确。本研究调查的77 份鱼肉制品均能扩增出特异性条带,28 份样品与产品标签标示不符,“错贴”率高达36.36%,其中所有标示“龙俐鱼”的商品都是低价的“巴丁鱼”（Pangasianodon hypophthalmus）。DNA条形码技术可用于鱼肉制品的来源物种鉴定。     

1株与大肠埃希菌O157生化结果相似的 志贺氏菌的鉴定

目的对一菌株sznjO23进行分析鉴定。方法从猪肝中分离到菌株sznjO23,并对该菌株的菌落形态、生化特征及分子生物学特性进行分析。结果该菌株在CT-SMAC平板上呈圆形、光滑、较小的无色菌落,在改良CHROMagarO157显色平板上为紫色圆形的菌落。经全自动微生物鉴定分析系统VITEK 2 Compact鉴定,其生化结果96%可能性为大肠埃希菌O157,但血清学试验结果反应完全混浊,未出现任何凝集。16SrDNA序列分析发现,该菌株与志贺氏菌(ATCC29903)的进化距离较近、同源性高,相似度为99.26%。结论菌株sznjO23为志贺氏菌。当生化试验、血清学试验结果不一致时可选择16SrDNA序列分析的方法进行鉴定,以保证结果的准确性。     

生物基因测序高性能计算日志的任务分析及建模

生物基因测序是生物信息学分析中最常用的高性能计算任务.旨在通过分析生物基因测序日志找出生物基因测序日志中的任务特性,构建一种通用的适合分析生物基因测序的任务模型,并应用于面向基因测序的高性能计算系统的任务调度及性能优化.基于任务日志,主要分析了生物基因测序日志中任务到达时间的规律特性、任务运行时间和任务的并行尺寸等特性,通过这些任务特性利用指数分布、伽马分布、正态分布以及线性拟合构建了相应的局部任务模型,然后提出一种局部模型融合的方法,将各个局部模型合并为统一的任务模型.通过两种通用的模型评测方法对任务模型进行的评测结果显示,最终的任务模型与原有任务日志的4种任务属性趋于相同的分布,验证了所构建的任务模型具有很好的通用性.     

利用显色法快速筛选大豆脂肪氧化酶缺失突变体

以杭州国家大豆改良分中心保存的野生和栽培大豆资源为研究材料,利用显色法对大豆脂肪氧化酶自然缺失突变体进行筛选。从348份种质中发现同时缺失大豆脂肪氧化酶Lox1和Lox2的野生大豆种质1份ZYD04511,同时缺失大豆脂肪氧化酶Lox2和Lox3野生大豆种质1份ZYD04452,以及缺失大豆脂肪氧化酶Lox2或其含量极低的栽培大豆种质5份:ZDD06271、ZDD06044、ZDD13834、ZDD06245和VP35。试验结果同时表明显色法是一种简便快速的大豆脂肪氧化酶缺失突变体筛选方法。     

"天河二号"上一种DNA序列denovo拼接方法的并行优化策略

基于String Graph理论的序列拼接工具SGA是当前国际上的一种新型序列拼接工具.首先,形式化证明了SGA的序列拼接问题是一个NP完全问题,然后对SGA的拼接效率进行了分析,发现与业界同类拼接软件相比,SGA在内存开销方面具有优势,但却有更大的时间开销,其中构建索引占了60%~70%的比例.基于此,设计了一种并行优化策略,并实现了面向天河二号体系结构的并行策略来解决这一问题.分别在普通机群和天河二号上进行性能测试,针对小规模数据,优化后的索引构建时间比之前的最佳性能提高了3.06倍,中等规模数据提高了1.60倍,实验结果表明,其优化效果明显,且并行构建局部索引过程具有良好的线性扩展性.其中用到的优化方法和策略对相关问题的研究有一定的借鉴意义.这也表明,天河二号的超级计算能力能够很好地助力生命科学领域的相关研究.     

科学与科普——从人类基因组计划谈起

人类基因组计划得以产生如此巨大的历史性科学和社会影响,参与者和支持者在科学普及和传 播方面的艰苦努力功不可没。如何将科普融于科学之中, 使新的科技研究和进展能为大众接受并得到他 们及时和持久的支持,人类基因组计划给了我们很好的启示。