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1.
分析同构集群中的并行计算熵,验算并行计算熵对负载均衡程度的影响.研究结果表明,同构集群的最大相对负载率随着并行计算熵的递增而递减,当且仅当负载完全均衡时,并行计算熵达到最大值.并行计算熵能较好地衡量同构集群的负载均衡程度,可有效提高同构集群的性能.  相似文献   
2.
保持粒子活性的改进粒子群优化算法   总被引:6,自引:3,他引:6  
针对基本粒子群优化算法(Particle Swarm Optimization,简称PSO)存在的早熟收敛问题,提出了一种保持粒子活性的改进粒子群优化(IPSO)算法。当粒子失活时,对粒子进行变异或扰动操作,重新激活粒子,使粒子能够有效地进行全局和局部搜索。通过对4种Benchmark函数的测试,结果表明IPSO算法不仅具有较快的收敛速度,而且能够更有效地进行全局搜索。  相似文献   
3.
由于缺乏详尽的热力学参数,基于网络拓扑的代谢途径分析是现阶段最重要的途径分析方法。首先简单地介绍了基于网络的途径分析方法发展简史,随后着重说明了基于凸分析的两种代谢途径分析方法:基元模式和极端途径及它们之间的异同,并详细阐述了这两种方法的具体应用。最后,使用极端途径分析了苏云金杆菌的PHB代谢。结果表明,除了传统的途径,还存在一些新颖的途径可用于PHB合成。  相似文献   
4.
针对萤火虫算法FA对于高维复杂问题,收敛速度慢、求解精度低,优化效果不理想等缺点,提出一种基于全局信息共享的自适应FA算法。分别从三个方面对FA算法进行了改进:通过引入群体距离,改进γ值的调节方式,提升算法的自适应调节能力;通过增加过程搜索信息,加强算法的精细化调节能力;通过引入基于全局平均位置信息的量子空间下的δ势阱模式,增强算法的全局搜索能力。最后对几种典型函数的测试结果表明,改进算法在收敛速度与收敛精度上,较其它算法有明显提高。  相似文献   
5.
重建代谢网络及其结构与功能的分析   总被引:5,自引:4,他引:1  
文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能.首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库.然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作.用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线.最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体.该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络.同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义.  相似文献   
6.
随着可用的基因组水平代谢网络越来越多,计算方法在这些网络的分析中越来越重要.约束建模法只需少量参数即可建立模型,备受代谢网络分析的重视.本文借助COBRA工具箱,采用约束建模法对1个含137个基因,72个代谢物和95个代谢反应的大肠杆菌代谢网络核心模型进行分析,主要包括:计算其最优生长率,模拟动态生长情况,并做鲁棒性、基因删除、通量可变性以及统一随机取样等有关约束的分析.本研究提供了对大肠杆菌代谢网络核心模型进行约束建模分析的1个框架.  相似文献   
7.
数据流分类是数据挖掘中最重要的任务之一,而数据流的概念漂移特性给分类算法带来了巨大的挑战.基于极限学习机算法进行优化是解决数据流分类问题的一个热门方向,但目前大多数算法都采用提前指定模型参数的方式进行学习,这种做法使得分类模型只能在特定的数据集上才能发挥较好的性能.针对这一问题,提出了一种简单有效的处理概念漂移的算法—...  相似文献   
8.
针对移动通讯的便利性,利用J2ME开发移动图书服务终端应用程序,构筑智能客户端。通过PushRegistry注册机制动态注册引入的网络连接及定时提醒实现移动图书“随时、随地、随身”的离线及在线服务与通知,同时采用SyncML实现服务器中读者数据与终端中的同步。基于注册机制的优势在于信息的主动性、及时性及灵活性,充分满足移动用户的需求。  相似文献   
9.
针对利用粒子群优化算法进行多极值函数优化时存在早熟收敛和搜索效率低的问题,提出混合的PSO-BFGS算法,并增强了混合算法的变异能力使算法能逃出局部极值点.通过对三种Benchmark函数的测试结果表明,PSO-BFGS算法不仅具有有效的全局收敛性能,而且还具有较快的收敛速度,是求解最优化问题的一种有效算法.  相似文献   
10.
基于神经网络的多聚脯氨酸二型结构预测   总被引:1,自引:0,他引:1  
使用“机器学习方法”对稀有的多聚脯氨酸二型(PPⅡ)的二级结构进行预测,在预处理蛋白质序列的基础上,使用生物信息学中常用的BP神经网络预测PPⅡ二级结构.通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试,得出在输入窗口长度为13个氨基酸残基和隐节点数为15时预测效果最好,此时的预测精度可达73.8%.  相似文献   
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