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随着物联网、移动互联网、云计算以及各种数据自动采集技术的迅猛发展,许多领域迅速积累了大量具有图结构的可用数据。其中一个重要的图应用是股市图。如何分析股市图达到合理充分的投资决策支持一直是一个重要的课题。其中极大团(Maximal Clique)分析是分析股市图的一个重要方法。股市图的规模庞大,传统的极大团枚举算法仅仅罗列图中所有的极大团。但一个图中可以有指数级数量的极大团,而一支股票对应的点可以参与到任意多的极大团中。因此,传统的极大团枚举算法不能直接有效支持股市图分析。本文提出一个支持快速选择、自动分组及导航浏览三种股市图交互式可视化操作的大规模股市图分析系统。根据用户感兴趣的股市图节点,这三种股市图交互式可视化操作从股市图中快速枚举出与这些特定股票相关的极大团、查看这些特定股票之间的组合关系以及显示与这些特定股票相关的其他股票,是有效支持股市图分析的必要手段。同时基于对某些特定顶点或边相关的极大团枚举的需求,本文提出了从图中枚举出与特定顶点或边相关的极大团算法。我们使用真实数据验证了本文提出的算法的优越性。 相似文献
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目前基因拼接软件中应用最广泛的技术是基于De Bruijn图的基因拼接算法,需要对长达数十亿BP长度的基因组测序数据进行处理.针对海量的基因测序数据,快速、高效和可扩展的基因拼接算法非常重要.虽然已出现一些并行拼接算法（如YAGA）开始研究这些问题,但是拼接过程中时间、空间消耗较大的构图和单链化简这两大步骤在海量数据的挑战下仍然是最主要的计算瓶颈.这是因为现有工作在处理这几个步骤时通常使用了并行的表排序（list ranking）,而该方法需要多次对De Bruijn图的海量顶点信息进行分布式的排序,产生了大量的计算节点间的通信.单链化简可由1次De Bruijn 图深度优先遍历完成而不再需要表排序,于是提出一种基于分布式海量图遍历方法对单链化简进行优化,极大地减少了处理器间的通信和计算节点之间的数据移动,因而取得较好的扩展性,其算法复杂度为O（g/p）,通信复杂度为O（g）,这里g为参考序列的长度,p为处理器的核数.当对E.coli和Yeast数据集进行测试,处理器的核数从8个增加到512个时,算法可以得到13倍和10倍的加速比;当对C.elegans和人类1号染色体（chr1）数据集进行测试,处理器的核数从32个增加到512个时,算法可以得到7倍和10倍的加速比. 相似文献
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后缀树的重要性可以为多年来学术界对它总是有新的发现而印证．它的结构简单，但可以在线性的时间里解决许多复杂的问题，被大量的使用在字符串及树的模式匹配中，对于XML标准，有很多基于关系库和对象库的索引技术和查询方案被提出来，我们试图给出一种基于后缀树进行路径导航的查询机制：用后缀树构造XML路径字典加速路径查询评价速度，我们提出可以在线地建立一个trie树的后缀树，讨论了XML路径字典中的后缀树建树算法，阐述了整个索引方案和查询机制，并探讨了包括RPE在内的它所支持的各种查询操作，XML路径字典被用于加快路径查询的评价速度． 相似文献
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