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1.
《Journal of dairy science》2022,105(6):5221-5237
Approximate multistep methods to calculate reliabilities for estimated breeding values in large genetic evaluations were developed for single-trait (ST-R2A) and multitrait (MT-R2A) single-step genomic BLUP (ssGBLUP) models. First, a traditional animal model was used to estimate the amount of nongenomic information for the genotyped animals. Second, this information was used with genomic data in a genomic BLUP model (genomic BLUP/SNP-BLUP) to approximate the total amount of information and ssGBLUP reliabilities for the genotyped animals. Finally, reliabilities for the nongenotyped animals were calculated using a traditional animal model where the increased information due to genomic data for the genotyped animals is accounted for by including pseudo-record counts for the genotyped animals. The approaches were tested using a multiple-trait ssGBLUP model on 2 data sets. The first data set (data 1) was small enough such that exact ssGBLUP model reliabilities could be computed by inversion and compared with the approximation method reliabilities. Data 1 had 46,535 first-, 35,290 second-, and 23,780 third-lactation 305-d milk yield records from 47,124 Finnish Red dairy cows. The pedigree comprised 64,808 animals, of which 19,757 were genotyped. We examined the efficiency of the MT-R2A approximation on a large data set (data 2) derived from the joint Nordic (Danish, Finnish, and Swedish) Holstein dairy cattle data. Data 2 had 17.8 million 305-d milk records from 8.3 million cows and first 3 lactations. The pedigree had 11 million animals of which 274,145 were genotyped on 46,342 SNP markers. For data 1, correlations between the exact ssGBLUP model and the ST-R2A for the genotyped (nongenotyped) animals were 0.995 (0.987), 0.965 (0.984), and 0.950 (0.983) for first, second, and third lactation, respectively. Correspondingly, correlations between exact ssGBLUP reliabilities and MT-R2A for the genotyped (nongenotyped) animals were 0.995 (0.993), 0.992 (0.991), and 0.990 (0.990) for first, second, and third lactation, respectively. The regression coefficients (b1) of ssGBLUP reliability on ST-R2A for the genotyped (nongenotyped) animals ranged from 0.87 (0.94) for first lactation to 0.68 (0.93) for third lactation, whereas for MT-R2A they were between 0.91 (0.99) for first lactation to 0.89 (0.99) for third lactation. Correspondingly, the intercepts varied from 0.11 (0.05) to 0.3 (0.06) for ST-R2A and from 0.06 (0.01) to 0.07 (0.02) for MT-R2A. The computing time for the approximation method was approximately 12% of that required by the direct exact approach. In conclusion, the developed approximate approach allows calculating estimated breeding value reliabilities in the ssGBLUP model even for large data sets.  相似文献   
2.
基于电子病历观察性数据的真实世界研究成为目前临床科研的热点。然而关系数据模型无法直接支撑起科研应用中医疗事件的时序关系表示以及知识融合的查询需求。针对上述问题,该文提出了一种新的基于RDF的医疗观察性数据表示模型,该模型可以清晰地表示临床检查、诊断、治疗等多种事件类型以及事件的时序关系。对来源于医院的电子病历数据,经过数据预处理、数据模式转换、时序关系构建以及知识融合4个步骤建立事件图谱。具体地,使用三家上海三甲医院的电子病历数据,构建了包括3个专科、173 395个医疗事件以及501 335个事件时序关系的医疗数据集,并融合了5 313个中文医疗知识库概念。基于临床文献与医生科研需求,该文根据公共卫生流行病学的病因研究、治疗研究等类型,分别提供了针对本数据集的40个问题示例,并将其中的部分问题与传统关系数据库在查询的构建与执行方面进行了实验比对,论证了该事件图谱的优越性。该数据集遵循开放链接标准,在OpenKG上发布并提供了在线访问的SPARQL站点,链接为 https://peg.ecustnlplab.com/dataset.html。  相似文献   
3.
崔博文  金涛  王建民 《计算机应用》2021,41(4):1055-1063
电子病历信息抽取技术能够从自由文本电子病历中获取到有用的关键信息,从而为医院的信息管理和后续的信息分析处理工作提供帮助。简要介绍了现阶段自由文本电子病历信息抽取的主要流程,分析了近十几年来关于自由文本电子病历中命名实体、实体修饰与实体间关系三类关键信息的单独抽取以及联合抽取方法的研究成果,对这些成果所采用的主要方法、使用的数据集、最终的实验效果等进行了对比总结。除此之外,还对最新的几种流行方法的特点以及优缺点进行了分析,对目前电子病历信息抽取领域常用数据集进行了总结,分析了目前国内相关领域的现状和发展趋势。  相似文献   
4.
体能监控仪作为生命体征监测设备,对于辅助大学生完成体能训练有很大帮助;基于STM32单片机技术,设计开发集成了多种传感器的一种大学生体能监测装备,它能够有效的检测包括心率检测、人体的步数、运动圈速、消耗卡路里等信息;该设计采用了STM32作为主控芯片,采用模块化的设计思路;在系统硬件设计方面,设计了包括STM32控制系统、心率获取电路、三轴传感器电路、显示电路以及按键电路等;同时将软件模块拆分成了初始化子程序、心率获取子程序,步数获取子程序,显示子程序等;Proteus仿真结果显示,使用STM32单片机技术设计的体能监测系统,能够运行稳定,测量心率范围60次/min~180次/min,可在心率异常时报警,同时检测步数的准确率达98%,满足体能监测任务需要,实验结果符合预期;为STM32单片机在体育运动研究信息化中应用提供参考。  相似文献   
5.
Infrared (IR) photodetectors are a key optoelectronic device and have thus attracted considerable research attention in recent years. Photosensitivity is an increasingly important device performance parameter for nanoscale photodetectors and image sensors, as it determines the ultimate imaging quality and contrast. However, photosensitivities of state-of-the-art low-dimensional nanostructure-based IR detectors are considerably low, limiting their practical applications. Herein, a biomimetic IR detection amplification (IRDA) system that boosts photosensitivity by several orders of magnitude by introducting nanowire field effect transistors (FETs), resulting in a peak photosensitivity of 7.6 × 104 under an illumination of 1342 nm, is presented. Consequently, high-contrast imaging of IR light is obtained on the flexible IRDA arrays. The image information can be then trained and recognized by an artificial neural network for higher image-recognition efficiency. This work provides a new perspective for developing high-performance IR imaging systems, and is expected to undoubtedly enlighten future work on artificial intelligence and biorobotic systems.  相似文献   
6.
非易失性内存(Non-Volatile Memory,NVM)具有支持按字节寻址、持久性、存储密度高、读写延迟低等特点,因此成为解决DRAM(Dynamic Random Access Memory)容量有限问题的首选技术。随着数据库系统中NVM的引入,传统的日志技术需要考虑如何适应NVM特性。首先总结了已有的面向NVM的日志技术研究,进而提出了一种尽可能限制NVM写操作的数据库日志方案NVRC(Non-Volatile Record-updating with Cacheline)。文中提出了结合异地更新和原地更新的日志管理方案。具体而言,NVRC在异地更新的“影子记录”的基础上,引入了“缓存行原地更新”策略,并通过代价分析选择合理的日志更新策略,从而减少对NVM的写操作。采用DRAM模拟NVM的方式在YCSB测试负载上进行了实验,并对比了NVRC与传统的WAL(Write Ahead Log)以及NVM感知的PCMLx(PCMLoggingx)方法。结果表明,NVRC的NVM写次数在修改均匀的情况下比WAL和PCMLx分别减少了54%和17%,同时更新性能分别提升了59%和10%。  相似文献   
7.
李浩  胡文娜 《城市规划》2015,39(7):70-76
以"一五"时期西安市首轮城市总体规划为例,通过对苏联专家谈话记录进行深入解析,再现了苏联专家对我国城市规划工作进行帮助的鲜活事实。苏联专家对我国城市规划工作的帮助,既有城市规划的基本依据和规划原则等指导思想的明确,也有城市规划的科学基础、标准定额、设计方法和成果规范等工作内容的指导,还有签订协议文件等制度建设方面的建议。苏联专家对规划工作的帮助是全面、系统而深入的,兼顾了理论和实践、远景和近期、苏联经验和中国实际等多方矛盾,体现了科学、严谨而务实的态度。在对建国初期城市规划事业创立和发展的认识方面,应对苏联专家的重要贡献予以客观评价。  相似文献   
8.
随着我国医药行业的快速发展,竞争能力不强是医药行业亟待解决的问题。文中通过分析我国制药业的现状、特点及相关法规(即GMP良好作业规范)等,介绍了采用MES管理的解决方案,实现了对制药行业的信息化管理,可有效地提高了企业的生产质量和效益,对增强企业的竞争能力是有益的。  相似文献   
9.
中文电子病历命名实体标注语料库构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
针对中文电子病历命名实体语料标注空白的现状,研究了中文电子病历命名实体标注语料库的构建。参考2010年美国国家集成生物与临床信息学研究中心(1282)给出的电子病历命名实体类型及修饰类型的定义,在专业医生的指导下制定了详尽的中文电子病历标注规范;通过对大量中文电子病历的分析,提出了一套完整的中文电子病历命名实体标注方案,而且采用预标注和正式标注的方法,建立了一定规模的中文电子病历命名实体标注语料库,其标注语料的一致性达到了92%以上。该工作对中文电子病历的命名实体识别及信息抽取研究提供了可靠的数据支持,对医疗知识挖掘也有重要意义。  相似文献   
10.
王珏  吴皓南  高岑  韩效奇 《砖瓦》2020,(5):60-63
文件化的管理体系是实验室按照相关标准和准则有效运行的纲领和证据,然而随着实验室信息管理系统(LIMS)的飞速发展和广泛应用,传统的质量手册、程序文件和记录表格等文件化的管理体系方式也伴随着新的信息管理体系模式发生新的变化。认可与检验检测行业实验室管理体系文件化方式的进行探索,并由此对未来实验室管理体系文件化的发展提出建议。  相似文献   
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