蛋白质序列比对方法的研究进展

先导化物的发现是新药研发流程中首要环节。基于靶点结构的药物设计在先导化物的发现过程中具有十分重要的作用和地位。在靶点三维结构缺乏的情况下,用计算机模拟的方法来预测是获得其结构的一条重要渠道。同源建模是应用最为广泛的蛋白质三维结构模拟方法,而蛋白质序列比对是同源建模中的关键一环。对蛋白质的序列比对、比对结果评价、比对结果优化等内容进行论述,并对相关方面的最新进展作介绍。     

高速逆流色谱快速分离四种甘草黄酮及其结构鉴定

通过高速逆流色谱从新疆产甘草粗提物中分离得到甘草黄酮醇、甘草素、芒柄花素和甘草异黄酮甲四种甘草类黄酮。溶剂系统为正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水（1：2：1：1），上相作为固定相，下相作为流动相，主机旋转方向为顺时针，转速850rpm，流速4．0mL／min，检测波长260nm。经过160min分离，从400mg甘草粗提物中得到甘草黄酮醇26mg、甘草素8mg、芒柄花素12mg、甘草异黄酮甲10mg，纯度分别为96．3％、95．7％、98．5％、98．8％。结构经熔点、UV、MS、^1H—NMR和^13C-NMR鉴定。     

(R)-5-扁桃酰基-3-对甲基哌嗪苯甲酰基-4,6-二氢吡咯[3,4-c]吡唑的合成工艺改进

以甘氨酸为起始原料,经Micheal反应、酯化、氨基保护、环合、得3-氨基-4,6-二氢吡咯并[3,4,c]吡唑-5(1H)-叔丁氧羰基,再经酰化、脱boc保护,生成的化合物与扁桃酸酰化、脱保护得(R)-N-5-(2-甲氧基-2-苯乙酰)-3-([4-(4-甲基哌嗪)苯甲酰基]氨基)-4,6-二氢吡咯[3,4-c]吡唑,总收率为24.5%。     

制备型高速逆流色谱分离纯化北豆根中的生物碱类化合物

采用制备型高速逆流色谱仪TBE-300A分离纯化北豆根药材中的活性生物碱类化合物。在实验过程中对溶剂系统和参数条件进行了系统的优化,获得较好的分离条件：溶剂系统为石油醚-乙酸乙酯-乙醇-水（1：2：1：2,V／V／V／V）,上相（有机相）为固定相,下相（水相）为流动相,反相模式洗脱;进样浓度20mg／ml;进样体积20ml;流速2．0ml／min;转速850r／min。通过一步分离,获得了四种高纯度的生物碱类化合物,经HPLC、MS和NMR鉴定,分别为蝙蝠葛苏林碱（101．47mg,96．79／6）,蝙蝠葛碱（155．68mg,95．6％）,蝙蝠葛诺林碱（（25．4mg,96．2％）,蝙蝠葛新苛林碱（10．2mg,97．8％）。     

碳化法原位成盐包膜提高CAC稳定性的研究

对无水氯化钙与液氨的反应产物的稳定性进行了研究,提出了改进ＣＡＣ稳定性新技术一碳化法原位成盐包膜技术。研究表明：碳化法原位成盐包膜可以较好地提高ＣＡＣ稳定性。包膜ＣＡＣ的最佳条件是：当ＣＡＣ呈膏状且不流动时通以流速为１２０ｍＬ／ｍｉｎ的ＣＯ２３－５ｍｉｎ对ＣＡＣ进行微粒包膜,经造粒后进行大颗粒二次包膜,二次膜后的ＣＡＣ的２５－３５℃范围可以较稳定存在,且包膜后的ＣＡＣ含氮量可以稳定在３１％以上。大     

和厚朴酚衍生物的合成以及细胞毒性和凋亡活性评价

针对几个效果良好的和厚朴酚衍生物,在肝癌细胞（HepG2）上,应用MTT分析、细胞形态学分析、DNA碎片分析和细胞流式分析等方法,进行抗增殖和促凋亡活性评价研究。研究结果表明,化合物3a在HepG2细胞上展现了非常显著的抗增殖活性（半数抑制浓度为21.58微摩）和促进细胞凋亡作用。     

制备型高速逆流色谱分离纯化木蝴蝶中的黄酮苷类化合物

采用制备型高速逆流色谱技术对木蝴蝶甲醇提取物中的活性黄酮苷类化合物进行分离纯化.实验过程中对二相溶剂体系、转速、流速、进样体积和进样浓度等参数进行了系统的优化,获得较优分离条件:溶剂体系,氯仿-甲醇-水(9.5:10:5),水相(上相)为固定相,有机相(下相)为流动相,正相洗脱;转速,800 r/min;流速,3.0 mL/min;进样体积,20 mL;进样浓度,2.0×104 mg/L;一步收集到五种高纯度黄酮苷类物质,经HPIC、MS和NMR鉴定分别为baicalein-7-O-glucoside (137.8 mg,98.3%),baicalein-7-O-diglucoside(78.6 mg,99.2%),chrysin-7-O-glucuronide(70.6mg,99.3%)和baicalin(57.2 mg,99.6%),及一种新的 chrysin-diglucoside(9.5 mg,98.8%).其中 chrysin-7-O-glucuronide和baicalin是首次通过制备型高速逆流色谱从这种植物中分离得到.     

和厚朴酚衍生物对肝癌细胞(HepG2)凋亡的影响

为探讨和厚朴酚衍生物对肝癌细胞的毒性,在合成了6个和厚朴酚衍生物的同时,并应用MTT分析和细胞流式分析等手段研究了活性较好的厚朴酚3#H对肝癌HepG2细胞凋亡的影响。采用倒置显微镜观察细胞的形态学的改变,用流式细胞分析技术测定亚二倍体峰等方法检测该药物对细胞凋亡影响,结果表明和厚朴酚3#H可明显诱导HepG2细胞凋亡。     

高速逆流色谱分离鬼臼中六个鬼臼毒素类化合物及其结构鉴定

采用制备型高速逆流色谱对鬼臼中鬼臼毒素类成分进行分离纯化。实验经优化获得的分离条件为：先用正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水（2∶3.5∶2∶3.5,V/V）上相为固定相,下相为流动相洗脱48分钟后,换用正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水（4∶5∶4∶5,V/V）下相进行洗脱;转速为1200r/min;流速为50mL/min;进样体积50mL;进样浓度20mg/mL;共收集到六种高纯度化合物,经鉴定为鬼臼毒素、山荷叶素、4’-去甲基鬼臼毒素、异苦鬼臼毒酮、4’-去甲基去氢鬼臼毒素和去氢鬼臼毒素。     

高速逆流色谱分离纯化合成的和厚朴酚抗肿瘤衍生物

首次采用高速逆流色谱对合成的和厚朴酚生物进行分离纯化。本实验首先通过Reiman—Tie—mann反应将和厚朴酚甲酰化,再与盐酸羟胺生成3个和厚朴酚的衍生物,然后通过HSCCC将它们分离纯化。分离过程,我们对溶剂体系和样品浓度以及进样速度等参数条件进行了优化,获得了较好的分离。溶剂体系为正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水（1：0．4：1：0．4,V／V）,下相作为固定相,进样浓度为20mg／ml,进样体积为20ml,流速设定为2ml／min,转速为850rpm。分离产物经MS和NMR结构鉴定。