一种蛋白质复合体模块度函数及其识别算法

蛋白质复合体对于研究细胞活动具有重要意义.随着新的生物实验技术的不断出现,产生了大量的蛋白质相互作用网络.通过对蛋白质相互作用网络进行聚类识别蛋白质复合体是当前研究热点.然而,目前大多数蛋白质复合体识别算法的性能不够理想.为此,提出了蛋白质复合体模块度函数(PQ),并在此基础上提出了基于蛋白质复合体模块度函数的模块合并(based on protein complexes modularity function for merging modules,BMM)算法.BMM算法首先识别网络中一些稠密子图作为初始模块,然后依据PQ函数对这些初始模块进行合并,最终得到了质量较高的蛋白质复合体.将识别出的复合体分别与2种已知的蛋白质复合体数据集进行比对,结果表明BMM算法具有很好的识别性能.此外,与其他最新的识别算法相比,BMM算法的识别准确率较高.     

实时荧光定量法检测新城疫疫苗株和野毒株前处理方法比较

从缓冲液处理、倍比稀释、反复冻融等几个方面来对检验样品进行前处理,以期寻找更优的前处理方法,为进出口鸡肉产品中新城疫病毒的检测提供可靠参考.采用pH7.2的磷酸盐缓冲溶液(PBS),加入双抗的PBS、0.9%生理盐水、Hank's液等不同的缓冲液对样品进行前处理,结果表明,pH7.2的PBS效果最好;对鸡拭子进行倍比稀释,结果表明,当稀释度达到1:128时,检测结果为阴性;反复冻融对检测结果影响不大.