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AVAL是一个自行设计、实现的虚拟组合衍生程序系统。该系统的基础是分子拓扑结构处理模块AVALsdk,经封装、集成为组合衍生程序AVALapp;再以C/S方式开发了CGI网站,并增加守护程序AVALd以适应AVALapp多任务、长时间运行的要求。该系统配合有机合成数据库,能查询分子骨架合成通式,还自动提供约100种取代基。除分子骨架,用户也可以提交自己的有机合成反应和取代基。对每个分子骨架,根据其R基团数目和每个R基团取代基数目的变化,AVAL可以生成不同数量级的衍生结构。 相似文献
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提出一种针对有机分子的新的子结构匹配方法 ,子结构采用树状结构数据表示 ,方法简单灵活 ,匹配快速准确。 相似文献
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NKChemSQL——针对MySQL的化学信息学扩展 总被引:1,自引:0,他引:1
化学数据库是进行化学信息学研究的重要资源,分子属性与指纹计算、分子结构格式转换、分子相似度匹配、精确匹配和子结构匹配以及分子结构图片导出等,都是必需的基本服务内容。应用广泛的数据库系统MySQL却缺乏这些功能,难以满足化学信息处理、网站开发等开发的需求。NKChemSQL是自行编制的MySQL扩展库,通过对开源软件OpenBabel的功能进行包装,以SQL语言的格式完成相应操作。NKChemSQL具有良好的运行表现,经过对含26万余条分子结构信息的NCI数据库进行的测试,全结构匹配只需不到1秒而子结构匹配达300个结构/秒,相似度匹配则达1万个结构/秒。NKChemSQL为开发化学信息学软件和网站提供了非常便利的新方式。 相似文献
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模糊理论在汽车空调系统故障诊断中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
阐述构建汽车空调故障诊断系统的目的,并以模糊理论为基础,分析汽车空调故障原因与故障征兆之间的模糊关系,建立汽车空调模糊故障诊断数学模型.最后以一个故障诊断实例进行具体分析,验证了模糊理论在汽车空调故障诊断中的可行性. 相似文献
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阐述了构建汽车空调故障诊断系统的目的,并以模糊理论为基础,分析了汽车空调故障原因与故障征兆之间的模糊关系,建立了汽车空调模糊故障诊断数学模型.最后以一个故障诊断实例进行具体分析,验证了模糊理论在汽车空调故障诊断中的可行性. 相似文献
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针对网上分子信息数据库在线显示分子结构的需要,利用Java3D技术,以Java Applet方式,设计和开发了在网页中动态、多模式显示生物大分子结构的浏览器插件JDM。对于该插件的性能分析、外部函数接口、模块设计以及关键的Java3D技术等都进行了介绍,并讲解了使用方法并展示了运行示例。 相似文献
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虚拟组合化学分子库的程序设计、实现与应用 总被引:2,自引:3,他引:2
介绍了一个组合化学基本工具程序:虚拟组合化学分子库生成程序(Virtual Combinatorial Library Enumerator,VCLE)。以Accelrys公司Accord开发包为基础用C/C 语言进行开发,支持微软公司Windows系统上和太阳微系统公司的Solaris操作系统。VCLE通过解析通式反应,以通式反应物为模板把实际反应物裁剪为取代基,再把取代基连接到通式产物对应的取代位置上,从而组合出以通式产物为骨架的大量分子结构。作为药物发现研究的方便工具,VCLE既可以运行于桌面系统也可以运行于服务器上。 相似文献