基于SSE2的Smith-Waterman算法

Smith-Waterman动态规划算法是生物信息学使用最广泛的序列匹配算法,由于存在严重的数据依赖关系,该算法的细粒度数据并行性开发受到了很大限制。文章从简化数据依赖关系出发,采用前驱计算思想,提出了基于X86处理器多媒体指令集SSE2的Smith-Waterman细粒度并行算法SWSSE2,在相似性显著的情况下比普通的SW算法性能提高5倍,且与测试集无关。一般相似性不显著的情形下,同目前最好的动态规划细粒度并行算法SWMMX相比可以获得1.5倍的加速比。     

基于磁盘阵列的MQ前置系统改造方案

基于MQ中间件技术的前置服务器能实现系统报文的自动收发,但独立主机的冷备方式使得在系统切换后需要进行通道的重置及报文的重新发送,效率不高。本文探讨了基于磁盘阵列的前置系统改造方案,实践表明,这一方案降低了系统切换时间,并保证了报文信息的连贯性,是一种有效的MQ前置系统实施方案,同时也指出了此方案的不足。     

基于Veritas Netbackup备份平台的优化措施

NBU备份平台能自动进行系统的集中备份,为数据安全提供有效保障,但运行中也存在一些问题。本文给出了针对运行中存在问题的四个优化措施。实践表明,这些措施切实解决了备份平台恢复时间长及流量带宽占用大等问题,进一步提高了备份平台的可靠性。     

基于TongGTP的一种异地备份实现方式简

当今社会是一个大数据的时代，数据的备份越来越重要，否则造成的将是灾难性的后果。实现数据异地备份的方式有很多种。本文选用了基于中间件传输平台的一种方式，实践表明，基于TongGTP的方式可以提供更好地并发支持，是一种安全、有效、便捷的异地备份方式，同时也给出了此种方式的不足及瓶颈。     

基于GPU的串匹配算法研究

BF算法是串匹配算法中最基础的算法，但它是串行算法，不适合图形处理器（Graphic Processing Unit, GPU）的体系结构。结合GPU的特殊体系结构，通过数据存取方式和计算策略的改进，充分利用了GPU的并行处理能力，从而基于GPU实现了BF算法。实验结果表明基于GPU的并行算法能够取得较好的加速比，同时也给出了在现有GPU架构上有效实现通用计算的瓶颈。     

基于TongGTP的一种异地备份实现方式

当今社会是一个大数据的时代,数据的备份越来越重要,否则造成的将是灾难性的后果。实现数据异地备份的方式有很多种。本文选用了基于中间件传输平台的一种方式,实践表明,基于TongGTP的方式可以提供更好地并发支持,是一种安全、有效、便捷的异地备份方式,同时也给出了此种方式的不足及瓶颈。