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提出了一种基于偏最小二乘判别分析和F-score的特征筛选方法,并将其用于蛋白质组学质谱数据分析。该方法主要包含3个步骤:(1)用LIMPIC算法对原始数据进行预处理;(2)计算每个变量的F-score值并将所有变量按F-score值降底的顺序排列;(3)采用偏最小二乘判别分析交互检验按前向选择法选择最佳变量子集。用本方法对一组结肠癌数据进行分析,最终从原始的16331个质荷比变量中选择了8个特征质荷比作为潜在的生物标记物。用所选择的特征对独立测试集的样本进行判别,其灵敏度和特异性分别达到了95.24%和100%。结果表明,所提出的方法可用于蛋白质组学质谱数据的特征筛选及样本分类。 相似文献
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提出了一种基于光谱纯度值的变量选择方法。对光谱中各变量计算其纯度值后,按降序将相应变量排列,采用PLS交互检验按前向选择法选择最佳变量子集。用本方法对3组分混合物体系及烟草样品的近红外光谱进行变量选择,并与全谱变量建模的结果进行了比较。结果表明本实验给出的波长变量优选方法是一种比较有效和实用的变量筛选方法,通过变量筛选,可极大地减少光谱信息重叠,从而提高定量校正模型的预测精度和建模效率。 相似文献
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以甲苯、氯苯和正庚烷混和三组分体系为分析样品,应用模型转移法来校正不同仪器和不同测量时间导致的近红外光谱之间的差异。在校正测量时间导致的差异时,以16日由Bruker近红外光谱仪扫描的光谱作为主光谱,而17日由同台仪器扫描的光谱作为从光谱。在校正仪器导致的光谱差异时,以16日由Bruker近红外光谱仪扫描的光谱作为主光谱,而在同一天由Perkin-Elmer近红外光谱仪扫描的光谱作为从光谱。采集光谱后,用分段直接校正(PDS)和典型相关分析(CCA)校正从光谱。结果显示:虽然仪器和测量时间差别均导致从光谱偏离主光谱,但是CCA的效果更佳,使得校正后的从光谱能用主光谱的模型准确预测样品含量。 相似文献
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偏最小二乘法同时测定食醋的有效成分和防腐剂的含量 总被引:2,自引:1,他引:2
偏最小二乘方法建立近红外光谱与组分浓度的多元校正模型,用于同时快速测定食醋的有效成分(总酸)和防腐剂(苯甲酸)含量。采用透射模式,样品不经任何处理测定近红外光谱。用17个食醋样品建立偏最小二乘法(PLS)模型,用3个样品作为预测样品以评估PLS模型。结果:食醋中的总酸和苯甲酸在2 125~2 325 nm区域之间,与光谱有良好的线性关系,总酸的PLS模型中,隐变量为3时,预测均方根误差0.038 7 g·L~(-1),总酸含量与光谱的线性相关系数达到0.999 7,相对预测误差5.89%;苯甲酸的PLS模型中,隐变量为6时,预测均方根误差降至0.013 8 g·L~(-1),苯甲酸含量与光谱的线性相关系数达到0.999 8,相对预测误差降至4.29%。 相似文献
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鱼腥草注射液指纹图谱数据库系统的实现与应用 总被引:2,自引:0,他引:2
建立中药色谱指纹图谱的目的在于全面反映中药所含内在化学和生物成分的种类与数量,考虑到如何全面完整地利用指纹图谱的信息来为中药质量控制提供依据,提出采用数据库来存储和管理指纹图谱数据,并利用化学计量学中的数据预处理手段和模式分析等方法对指纹数据进行分析处理。本文讨论了利用MATLAB开放式可扩充体系结构,开发出鱼腥草注射液指纹图谱数据库系统的构想和设计思想,实现数据的标准化和动态更新、标准指纹谱的动态生成、相似度检验、化学模式分析、特征物质峰的查找等功能。该数据库具有操作简便,界面友好、功能强大等特点。实践证明,通过该数据有系统的应用可以有效跟踪产品质量,可广泛应用于鱼腥草注射液的质量控制。 相似文献
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利用近红外光谱分析结合偏最小二乘法测定甲苯、氯苯和正庚烷构成的三元混合体系中氯苯的浓度。通过考察混合物吸光度与氯苯浓度的相关性,以预测残差平方和为评价指标,对光谱进行了变量筛选,并将选择的33个波长变量建立的定量校正模型与全谱范围的校正模型进行比较。结果表明本方法可使最终所得的模型中变量数大大减少,通过波长变量优选最小化冗余信息、提高预测精度及建模效率。 相似文献
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通过模拟博物馆馆藏环境搭建了颜料光致变色研究的实验装置,采用漫反射紫外可见光谱技术对古书画、壁画等常用的朱砂、朱磦、胭脂、三绿、三青颜料在365nm紫外光照射下的变色规律进行了考察,并利用主成分分析对光谱数据进行分析,进一步对其变色规律进行研究。结果显示,朱砂、朱磦、胭脂三种颜料的光谱呈"S"型,它们对365nm紫外光的稳定性依次为朱磦、朱砂、胭脂;三绿和三青的光谱呈"钟"型,三绿的稳定性好于三青。所建立的漫反射紫外可见光谱方法为颜料光致褪色的规律及机理研究提供了新的无损分析手段。 相似文献