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1.
郭茂祖  王诗鸣  刘晓燕  田侦 《软件学报》2017,28(11):3094-3102
microRNAs(miRNAs)在生命进程中发挥着重要作用.近年来,预测miRNAs与疾病的关联关系成为一个研究热点.当前,计算方法整体上可以分为两大类:基于相似度度量的方法和基于机器学习的方法.前者通过度量网络中节点之间的关联强度预测miRNA-疾病关联,但需要构建高质量的生物网络模型;后者将机器学习相关算法应用到这个问题中,但需要构建高可信度的负例集合.基于以上困难和不足,提出了一种计算模型BNPDCMDA,用于预测miRNAs-疾病关联关系.该方法首先构建miRNA-疾病双层网络模型,然后利用miRNA的功能相似度对其进行基于密度的聚类,进而将二分网络投影应用于聚类后的miRNAs及疾病集合构成的miRNA-疾病双层子网中,最终完成对miRNA与疾病关联关系的预测.实验结果表明,采用留一交叉验证法得到的AUC值可达99.08%,明显优于当前其他高效方法.最后,采用BNPDCMDA方法对某些常见疾病所关联的miRNAs进行预测,实验结果获得了文献的支持,进一步表明了该方法的有效性.  相似文献   
2.
提出了一种新型有机磷液晶传感器,其基底表面仅由Cu2+功能化。将液晶5CB滴凃其上,利用正交偏光显微镜对传感器的光学表征进行观察。传感器的光学表征随时间逐渐从亮转为暗,且其转为全暗态所需的时间与Cu2+的浓度呈反比;当通入甲基磷酸二甲脂(DMMP)气体时,传感器呈现出逐渐从暗到亮的光学表征变化,循环通入空气和DMMP气体时交替出现的暗与亮的光学表征转变显示了其对DMMP的光学响应具有可重复性;另外,水、乙醇、甲苯和丙酮等其他干扰气体的通入则不会引起光学表征的任何变化。同时,在实验范围内(0.1~10mmol/L),Cu2+的浓度越低,传感器对DMMP的光学响应灵敏度越高。结果表明了这种新型有机磷液晶传感器造价低廉,制作过程简易,可选择性、可重复性地应用于如DMMP等有机磷的检测中。  相似文献   
3.
向列型液晶分子具有取向序而无位置序,外界物理、化学和生物刺激非常容易引起分子取向变化,进而导致偏光图像的变化。本文利用玻璃基底表面沉积的Cu2+使4-腈基-4'-戊基联苯液晶(5CB)分子获得沿面垂直取向。当有机磷存在时,有机磷与5CB竞争Cu2+结合位点,从而使5CB分子被有机磷置换而呈水平或倾斜取向。这一取向的变化在偏光条件下通过肉眼即可观察到。利用该原理制作的液晶化学传感器能检测10 ppb的二异丙基磷酸甲基酯(DIMP),响应时间仅25 s。传感器对水蒸汽、乙醇以及丙酮均不响应,具有很高的特异性。与传统方法相比,该方法具有快速、灵敏、制作简单以及不需要复杂装置等优点。  相似文献   
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