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2.
针对谱聚类融合模糊C-means(FCM)聚类的蛋白质相互作用(PPI)网络功能模块挖掘方法准确率不高、执行效率较低和易受假阳性影响的问题,提出一种基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘(FSC-FM)方法。首先,构建一个不确定PPI网络模型,使用边聚集系数给每一条蛋白质交互作用赋予一个存在概率测度,克服假阳性对实验结果的影响;第二,利用基于边聚集系数流行距离(FEC)策略改进谱聚类中的相似度计算,解决谱聚类算法对尺度参数敏感的问题,进而利用谱聚类算法对不确定PPI网络数据进行预处理,降低数据的维数,提高聚类的准确率;第三,设计基于密度的概率中心选取策略(DPCS)解决模糊C-means算法对初始聚类中心和聚类数目敏感的问题,并对预处理后的PPI数据进行FCM聚类,提高聚类的执行效率以及灵敏度;最后,采用改进的边期望稠密度(EED)对挖掘出的蛋白质功能模块进行过滤。在酵母菌DIP数据集上运行各个算法可知,FSC-FM与基于不确定图模型的检测蛋白质复合物(DCU)算法相比,F-measure值提高了27.92%,执行效率提高了27.92%;与在动态蛋白质相互作用网络中识别复合物的方法(CDUN)、演化算法(EA)、医学基因或蛋白质预测算法(MGPPA)相比也有更高的F-measure值和执行效率。实验结果表明,在不确定PPI网络中,FSC-FM适合用于功能模块的挖掘。 相似文献
3.
"现在疫情反弹,每个星期要安排鱼、瘦肉、豆制品、乳制品等补充蛋白质";"这个菜吃的人很少,短时间内不要安排了"……见到徐师傅时他正在安排下星期的菜谱。徐师傅全名是徐炳顺,于2003年进入江西萍乡市烟草专卖局从事厨师岗位,在烟草辛勤工作了18年,一直以来兢兢业业、认真负责,注重主食和菜式的品种创新,兼顾外地员工的口味差异,力求品种丰富多样,每天的饮食安排就是他最上心的事。 相似文献
4.
大分子拥挤是指在蛋白质、多肽、核酸和多聚糖共同形成的环境中,由于大分子的不可穿透性,使任何一个大分子的实际可及空间大幅缩小,所形成的生物大分子环境是一种由于空间排斥引起的纯物理性非特异性效应。酶在机体中发挥高效专一的催化作用,细胞内分子环境改变可能导致酶活性的改变,影响细胞及机体的稳态,同时大分子拥挤还可能影响DNA的合成。本文主要从大分子拥挤对酶(包括酶蛋白性质、酶活性、酶蛋白最适温度)和DNA的影响及其可能的作用机制等方面作一综述。 相似文献
5.
牦牛肉分别经200、400、600 MPa超高压处理480 s,测定4°C条件下贮藏0、4、8、12、16 d后感官、pH、微生物、色泽、蛋白质与脂质氧化情况,以探讨超高压处理对牦牛肉贮藏期内品质的影响。结果表明:超高压处理可以显著降低贮藏期内牦牛肉的菌落总数、总挥发性盐基氮含量(total volatile basic nitrogen, TVB-N)(P<0.05),延长保质期,且经贮藏4~8 d后能良好保持牦牛肉的感官品质。经超高压处理后牦牛肉L*值、b*值显著增大(P<0.05),a*值在400 MPa时显著增大(P<0.05)并在贮藏期内维持在最高水平,且400 MPa组各类肌红蛋白(Myoglobin, Mb)含量也表现出良好的肉色稳定性,但a*值在其他压力处理后显著减小(P<0.05)。但经超高压处理后牦牛肉肌原纤维蛋白(Myofibrillar Protein, MP)羰基含量与表面疏水性增高、巯基含量降低,TBARS值升高。Pearson相关性分析结果也表示超高压处理后牦牛肉品质的变化与压力、蛋白质氧化、脂质氧化和微生物相关(P<0.05... 相似文献
6.
大豆在我国有着十分广泛的种植,近年来大豆深加工的发展也比较迅速,但是与欧美等发达国家相比,我国在大豆深加工技术以及设备等方面仍存在一定的差距。本文就大豆深加工的发展方向进行探究,希望对促进大豆深加工的发展有所帮助。一、世界大豆深加工的发展方向大豆中主要包含蛋白质、脂肪、维生素、碳水化合物等营养物质,还含有胰蛋白酶抑制素以及各种抗营养素等,同时还包含着异黄酮类以及豆皂甙等有益成分。 相似文献
8.
9.
为充分利用黑豆粕中的蛋白质资源,研究了复合蛋白酶水解黑豆粕制备多肽的工艺路线。从蛋白酶的筛选入手,考察了不同蛋白酶对黑豆粕水解效果的差异,并通过复配比例优化了最佳复合蛋白酶的组成。采用单因素试验及响应面试验确定了复合蛋白酶水解黑豆粕的最佳工艺条件。结果表明:最佳复合蛋白酶为胰蛋白酶、碱性蛋白酶与桔青霉蛋白酶按酶活比1∶3∶2复配;最佳工艺条件为加酶量5 670 U/g,底物蛋白质量浓度40 g/L,pH 9.55,水解温度50℃,水解时间6 h。在优化的工艺条件下水解黑豆粕,多肽得率可以达到82.44%。水解液中多肽的相对分子质量均在7.8 kDa以下,大部分多肽的相对分子质量小于3.3 kDa;多肽基本上保持了黑豆粕蛋白的氨基酸组成,具有较高的营养价值。 相似文献
10.