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普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析
引用本文:赵振祥,崔露莹,周东波,赵泽玉,张银霞,盖梦琦,解敏敏,蒲文宣,彭宇,李志远. 普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析[J]. 中国烟草科学, 2022, 43(4): 70-78. DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2022.04.010
作者姓名:赵振祥  崔露莹  周东波  赵泽玉  张银霞  盖梦琦  解敏敏  蒲文宣  彭宇  李志远
作者单位:1. 湖南中烟工业有限责任公司技术中心, 长沙 410007;2. 中国农业科学院烟草研究所, 烟草行业基因资源利用重点实验室, 青岛 266101;3. 湖北中烟工业有限责任公司三峡卷烟厂, 湖北 宜昌 443100
基金项目:湖南中烟工业有限责任公司科技项目(KY2020YC0013);中国烟草总公司重大专项项目[110201901018(JY-05)]
摘    要:Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物的多种生命进程中发挥着重要作用。为解析烟草中Dof家族成员在生长发育过程中的潜在作用,本研究利用比较基因组学、进化分析、共线性分析等方法解析烟草中的Dof家族成员的潜在生物学功能。结果表明,在烟草基因组中共鉴定到69个Dof转录因子,其Dof功能域在进化上十分保守,根据系统进化分析结果将其划分为9个亚家族。共线性分析表明,烟草中的16个Dof基因与拟南芥17个Dof基因有27个共线性基因对,同时,25个Nt Dof基因被检测到存在17个全基因组复制对,表明复制事件在烟草Dof基因家族的扩张中起关键作用。此外,表达模式分析表明Nt Dof基因的表达存在明显的组织特异性,其中NtDof05和NtDof28基因可能与根系生长发育有关。本研究对烟草基因组中的Dof转录因子进行了系统的鉴定和分析,为烟草Dof转录因子家族成员的功能研究奠定了基础。

关 键 词:普通烟草  Dof转录因子  鉴定  比较基因组学  表达模式
收稿时间:2021-11-11

Genome-wide Identification and Systemic Analysis of Dof Transcription Factors in Tobacco (Nicotiana tabacum L.)
ZHAO Zhenxiang,CUI Luying,ZHOU Dongbo,ZHAO Zeyu,ZHANG Yinxia,GE Mengqi,XIE Minmin,PU Wenxuan,PENG Yu,LI Zhiyuan. Genome-wide Identification and Systemic Analysis of Dof Transcription Factors in Tobacco (Nicotiana tabacum L.)[J]. Chinese Tobacco Science, 2022, 43(4): 70-78. DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2022.04.010
Authors:ZHAO Zhenxiang  CUI Luying  ZHOU Dongbo  ZHAO Zeyu  ZHANG Yinxia  GE Mengqi  XIE Minmin  PU Wenxuan  PENG Yu  LI Zhiyuan
Affiliation:1. Technology Center, China Tobacco Hunan Industrial, Changsha 410007, China;2. Key Laboratory of Tobacco Gene Resources, Institute of Tobacco Research of CAAS, Qingdao 266101, China;3. Sanxia Cigarette Factory, China Tobacco Hubei Industrial Co., Ltd., Yichang, Hubei 443100, China
Abstract:
Keywords:
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