PFGE与16S rDNA对阪崎克罗诺杆菌分型的研究 |
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引用本文: | 柴云雷,满朝新,卢雁,闫天文,刘泳麟,庞心怡,李然,姜毓君.PFGE与16S rDNA对阪崎克罗诺杆菌分型的研究[J].中国乳品工业,2014(10). |
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作者姓名: | 柴云雷 满朝新 卢雁 闫天文 刘泳麟 庞心怡 李然 姜毓君 |
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作者单位: | 东北农业大学;东北农业大学食品学院;东北农业大学国家乳业工程技术研究中心; |
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基金项目: | 国家科技支撑计划项目(2013BAD18B11,2012BAK17B04,2012BAD28B02);黑龙江省科研机构创新能力提升专项计划(YC13D005) |
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摘 要: | 研究脉冲场凝胶电泳(PFGE)与16S rDNA序列分析在阪崎克罗诺杆菌分型中的应用。对分离自不同来源的10株阪崎克罗诺杆菌进行16S rDNA序列扩增及测序,并构建系统发育树进行聚类分析。再利用限制性内切酶Xba I对这10株菌酶切后,进行PFGE电泳分型。16S rDNA序列分析显示,所有分离菌株与ATCC标准菌株在同一系统发育分支下,其序列相似性达到98.37%,并且不能进一步分型。而PFGE分型结果显示,10株分离菌株和2株标准菌株共分成11种PFGE基因型,说明PFGE的分型能力明显优于16S rDNA序列分析,部分菌株的基因型与分离来源具有一定的相关性,所以PFGE分型方法可用于阪崎克罗诺杆菌分子分型及溯源的研究。
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关 键 词: | 阪崎克罗诺杆菌 脉冲场凝胶电泳 SrDNA |
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