| 基于高通量测序的冷冻南极磷虾中细菌菌群 结构分析 |
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| 引用本文： | 江艳华,姚 琳,李风铃,郭莹莹,朱文嘉,王联珠.基于高通量测序的冷冻南极磷虾中细菌菌群 结构分析[J].食品安全质量检测技术,2016,7(7):2840-2845. |
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| 作者姓名： | 江艳华 姚 琳 李风铃 郭莹莹 朱文嘉 王联珠 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划课题(2015BAD17B03) |
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| 摘 要： | 目的分析冷冻南极磷虾中总细菌菌群和可培养细菌菌群的结构特征。方法提取冷冻南极磷虾中宏基因组,通过高通量测序技术进行总细菌菌群分析;提取冷冻南极磷虾中可培养细菌菌落的总DNA,通过高通量测序技术进行可培养细菌菌群分析。结果冷冻南极磷虾中总细菌菌群多样性丰富,相对丰度大于1%的包括芽孢杆菌属(Bacillus)、肠球菌属(Enterococcus)、克罗诺杆菌属(Cronobacter)、嗜碱菌属(Alkaliphilus)、八叠球菌(Sarcina)、乳球菌属(Lactococcus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、土壤杆菌属(Sediminibacterium)、未分类菌(unclassified)、罗尔斯顿菌属(Ralstonia)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)以及苯基杆菌属(Phenylobacterium),占总量的85.04%。冷冻南极磷虾中可培养的细菌种类少,主要包括假交替单孢菌属(Pseudoalteromonas)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和嗜冷单胞菌属(Psychromonas),相对丰度分别为64.43%、33.47%和1.75%。可培养细菌中占优势的假交替单孢菌属、嗜冷杆菌属和嗜冷单胞菌属仅占总细菌菌群的1.10%。结论本研究初步揭示了南极磷虾细菌菌群的多样性和相对丰度,为进一步研究微生物与南极磷虾品质的相关性奠定基础。
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| 关 键 词： | 南极磷虾 细菌菌群 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2016/5/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/7/14 0:00:00 |
Analysis for bacterial flora structure of frozen Antarctic krill Euphausia superba by high-throughput sequencing technique |
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| JIANG Yan-Hu,YAO Lin,LI Feng-Ling,Guo Ying-Ying,Zhu Wen-Jia and WANG Lian-Zhu.Analysis for bacterial flora structure of frozen Antarctic krill Euphausia superba by high-throughput sequencing technique[J].Food Safety and Quality Detection Technology,2016,7(7):2840-2845. |
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| Authors: | JIANG Yan-Hu YAO Lin LI Feng-Ling Guo Ying-Ying Zhu Wen-Jia and WANG Lian-Zhu |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences and Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Euphausia superba bacterial flora high-throughput sequencing |
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