盐干海参的2种核酸提取方法比对及其分子鉴定

目的 建立盐干海参的核酸提取及其分子鉴定方法。方法 选取5种盐干海参, 采用直接处理、洗涤处理和浸泡处理3种处理方式, 比较磁珠法和离心柱法两种核酸抽提方式的提取质量, 并采用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)法对提取的核酸进行分析确认。结果 同一种抽提方式不同海参处理组间核酸质量没有显著差异, 而两种抽提方式间核酸质量差异显著, 其中磁珠法提取的核酸得率高、纯度高, 而离心柱法提取的核酸得率及纯度均偏低。经PCR扩增验证, 磁珠法提取的核酸效果较佳。将扩增产物进行测序及系统进化分析发现5种海参实际种类与标注名称仿刺参存在较大差异。结论 盐干海参处理方式对核酸提取结果影响不大, 磁珠法提取核酸效果较好,单纯依靠COI和16S rRNA基因通用引物并不能对所有的海参种类进行鉴定。