| 番茄PIN基因家族的生物信息学分析及其表达模式 |
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| 引用本文： | 赵瑞瑞,申 琳,生吉萍.番茄PIN基因家族的生物信息学分析及其表达模式[J].食品科学,2017,38(4):1-5. |
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| 作者姓名： | 赵瑞瑞 申 琳 生吉萍 |
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| 作者单位： | 南京农业大学食品科技学院，江苏 南京 2100951.清华大学生命科学学院，北京 100084；2.中国农业大学食品科学与营养工程学院，北京 100083；
1.清华大学生命科学学院，北京 100084；2.中国农业大学食品科学与营养工程学院，北京 100083；
3.中国人民大学农业与农村发展学院，北京 100872 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目（31371847；31272215）；国家重点基础研究发展计划（973计划）项目（2013CB127106） |
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| 摘 要： | PIN蛋白是生长素输出蛋白,具有多个跨膜结构域,能够介导生长素在整个植物体内的流动。番茄作为一种具有重要经济价值的果蔬,对其生长发育调控的研究具有重要的意义。研究表明,PIN蛋白对植物果实的生长发育起着重要的调控作用。本研究通过生物信息学的方法对番茄PIN基因组中10个SlPINs的核酸和氨基酸序列进行分析,构建番茄Sl PINs的进化树,并分析番茄SlPINs在不同组织和果实生长发育过程中的表达量变化,为进一步研究SlPINs的生物学功能提供理论依据。
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| 关 键 词： | 番茄果实 PIN基因 生物信息学分析 表达模式 |
Bioinformatic Analysis of the PIN Gene Family in Tomato and Its Expression Pattern |
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| ZHAO Ruirui,SHEN Lin,SHENG Jiping.Bioinformatic Analysis of the PIN Gene Family in Tomato and Its Expression Pattern[J].Food Science,2017,38(4):1-5. |
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| Authors: | ZHAO Ruirui SHEN Lin SHENG Jiping |
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| Affiliation: | 1. School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing 100084, China;
2. College of Food Science and Nutritional Engineering, China Agricultural University, Beijing 100083, China;
3. School of Agricultural Economics and Rural Development, Renmin University of China, Beijing 100872, China |
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| Abstract: | PIN-FORMED (PIN) proteins work as auxin efflux proteins with multiple transmembrane domains and mediate auxin flow throughout the plant. As tomato is an important cash crop, studies aimed to regulate its growth and development are of great significance. Studies have shown that PIN proteins play an important role in regulating the growth and development of fruits. In this study, we predicted the characteristics of ten tomato PIN members by using on-line software, constructed a phylogenetic tree for SlPINs, and analyzed expression changes of SlPINs in different tissues and during fruit growth and development. This study will provide a basis for future study on the biological functions of SlPINs. |
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| Keywords: | tomato fruit PIN gene bioinformatic analysis expression pattern |
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