氨基酸序列特征提取方法研究

组成蛋白质的基本单位是氨基酸，对于蛋白质分类预测问题，氨基酸序列特征提取方法是一个非常重要的因素。对基于氨基酸组成、位置的特征提取算法如熵密度、n阶耦联组成和基于氨基酸性质的特征提取方法如自相关函数、伪氨基酸组成等方法进行了阐述，并进行了简单评价。基于氨基酸组成的方法实现简单、计算量小，且对所有的氨基酸序列都适用，但丢失了氨基酸的顺序信息以及其问的相互作用，基于氨基酸位置信息或理化特性等方法计算量非常大，科研工作者可以根据对蛋白质的不同要求选择相应的特征提取方法。

Research of Feature Extraction Methods of Amino Acid Sequence

Amino acids are the basic components of proteins.As for the prediction of protein classification,the feature extraction method of the amino acid sequence is a very important factor.It gives a clear clarification and simple evaluation on the basis of amino acid composition,location of the feature extraction algorithm,such as entropy density profile,n-order coupled composition,and feature extraction methods of amino acid nature,such as auto-correlation function,pseudo,amino acid composition and so on.Research...