| Bacillus fordii MH602海因酶序列及同源建模分析 |
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| 引用本文： | 季青春,梅艳珍,何冰芳.Bacillus fordii MH602海因酶序列及同源建模分析[J].计算机与应用化学,2008,25(12). |
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| 作者姓名： | 季青春 梅艳珍 何冰芳 |
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| 作者单位： | 南京工业大学制药与生命科学学院,江苏,南京,210009 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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| 摘 要： | 海因酶是5-取代海因生物转化制备手性氨基酸的关键酶.通过同源建模法建立MH602海因酶的三维结构,经分析,91.3%的氨基酸残基在可信区间,无氨基酸残基在不可信区间,而且能量处于较低水平,此模型可进一步研究.将MH602海因酶序列和PDB数据库中现有的6个海因酶序列比较(PDB编号为:1KID,1YNY,1NFG,1GKP,1GKQ,1GKR),结果显示了保守的活性位点残基(4个HIS,1个ASP),3个立体化学环(SGLs)和底物环外侧链结合的残基(MET63,PHE65,LEU94,PHE152,TYR155,VAL158,LEU159).通过比较发现MH602海因酶在159位是LEU,比其他海因酶的PHE159提供更大的底物结合空间,可能降低了对映体选择性但增加了对羟基苯海因的活力.为利用定点突变改造酶分子,提高MH602菌株生产L氨基酸的能力提供理论指导.
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| 关 键 词： | 海因酶 同源建模 序列 活性位点 |
Analysis of the sequence and homology modeling from Bacillus fordii MH602 |
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| Ji Qingchun,Mei Yanzhen,He Bingfang.Analysis of the sequence and homology modeling from Bacillus fordii MH602[J].Computers and Applied Chemistry,2008,25(12). |
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| Authors: | Ji Qingchun Mei Yanzhen He Bingfang |
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