| 基于XML的生物代谢Petri网模型的标准化 |
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| 引用本文： | 许滔,廖莎,曾绍群,刘笔锋.基于XML的生物代谢Petri网模型的标准化[J].计算机与数字工程,2005,33(1):17-20. |
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| 作者姓名： | 许滔 廖莎 曾绍群 刘笔锋 |
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| 作者单位： | 华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室,武汉,430074 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 (编号 :30 170 30 6 )，国家 86 3高技术研究发展计划 (编号 :2 0 0 2AA2 340 5 1) |
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| 摘 要： | 针对分析生物代谢网络的需要，构建了生物代谢Petri网模型建模环境，并采用基于XML的Petri网标记语言PNML为标准，利用DOM实现XML解析，完成Petri网模型的标准化，通过对代谢网络Petri网模型实例的仿真，验证了标准化模型的正确性。
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| 关 键 词： | Petri网 生物代谢 PNML XML DOM |
| 修稿时间： | 2004年5月19日 |
Standardization of Biological Metabolic Petri Nets Model based on XML |
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| Xu Tao,Liao Sha,Zeng Shaoqun\ Liu Bifeng.Standardization of Biological Metabolic Petri Nets Model based on XML[J].Computer and Digital Engineering,2005,33(1):17-20. |
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| Authors: | Xu Tao Liao Sha Zeng Shaoqun\ Liu Bifeng |
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| Abstract: | To analyze biological metabolic networks, the standardization of biological Petri Nets model is accomplished with the construction of a Petri Nets modeling environment. In the standardization, Petri Nets Markup Language (PNML) is adopted as standards, and Document Object Model(DOM) is used to parse XML. For validation, the standardization for biological Petri Nets model is evaluated with computational simulation, which exhibits consistence with classic biological theory. |
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| Keywords: | Petri Nets Biological Metabolism PNML XML DOM |
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