人工智能在合成生物学的应用 |
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引用本文: | 李敏,林子杰,廖文斌,陈廷柏,李坚强,陈杰,肖敏凤.人工智能在合成生物学的应用[J].集成技术,2021,10(5):43-56. |
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作者姓名: | 李敏 林子杰 廖文斌 陈廷柏 李坚强 陈杰 肖敏凤 |
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作者单位: | 深圳华大生命科学研究院 深圳 518083;中国科学院大学生命科学学院 北京 100049;深圳大学计算机与软件学院 深圳 518060;深圳华大生命科学研究院 深圳 518083;深圳大学计算机与软件学院 深圳 518060 |
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基金项目: | 国家重点研发计划“合成生物学专项”项目(2020YFA0908700);国家自然科学基金面上项目(62072315);深圳市孔雀团
队项目(KQTD2015033117210153) |
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摘 要: | 生命系统极其复杂,难以精确描述和预测,这给高效设计合成生物系统提出了挑战,故在合
成生物系统构建中往往须进行海量工程试错和优化。近年来,人工智能技术快速发展,其基于海量数
据的持续学习能力和在未知空间的智能探索能力有效契合了当前合成生物学工程化试错平台的需求,
在复杂生物特征的挖掘与生命系统的设计方面具备巨大潜力。该文回顾并总结人工智能在合成元件工
程、线路工程、代谢工程及基因组工程领域的研究进展,并分析和讨论人工智能与合成生物学交叉研
究在数据标准化、平台智能化、实验自动化、预测精准化方面存在的一系列挑战。人工智能和合成生
物学的融合有望给“设计—构建—测试—学习”闭环的全流程带来变革,而孕育“类合成生物学家”
也将反过来引起人工智能技术的飞跃。
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关 键 词: | 类合成生物学家 智能化试错 合成生物系统 生物铸造厂 海量工程平台 |
Application of Artificial Intelligence in Synthetic Biology: A Review |
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Authors: | LI Min LIN Zijie LIAO Wenbin CHEN Tingbo LI Jianqiang CHEN Jie XIAO Minfeng |
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Affiliation: | BGI-Shenzhen, Shenzhen 518083, China; School of Life Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China;College of Computer Science and Software Engineering, Shenzhen University, Shenzhen 518060, China; BGI-Shenzhen, Shenzhen 518083, China; Shenzhen Key Laboratory of Unknown Pathogen Identification, Shenzhen 518083, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | AI synthetic biologist intelligent trial-and-error synthetic biological system biofoundry massively parallel engineering platform |
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