| 分子标记多位点排序的并行计算 |
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| 引用本文： | 蒋安纳,徐逸卿,董程玲,童春发.分子标记多位点排序的并行计算[J].计算机应用研究,2015,32(1):75-79,84. |
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| 作者姓名： | 蒋安纳 徐逸卿 董程玲 童春发 |
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| 作者单位： | 1. 南京林业大学信息科学技术学院,南京,210037
2. 南京林业大学森林资源与环境学院,南京,210037 |
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| 摘 要： | 为了对一组连锁的分子标记位点获得正确的排序进而构建生物遗传连锁图谱,提出了并行算法PMMASLH,针对F2作图群体,通过基于消息传递接口并行最大最小蚂蚁系统求解连锁的多个分子标记位点排序,使用隐马尔可夫模型计算一列有序标记位点所获得的极大似然值作为排序的目标函数。计算机模拟结果表明,该算法执行效率高、计算稳定,排序的功效优于著名的连锁作图软件Mapmaker。
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| 关 键 词： | 分子标记排序 并行计算 最大最小蚂蚁系统 隐马尔可夫模型 F2群体 |
Parallel computation for ordering linkage group of molecular markers |
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| JIANG An-na,XU Yi-qing,DONG Cheng-ling,TONG Chun-fa.Parallel computation for ordering linkage group of molecular markers[J].Application Research of Computers,2015,32(1):75-79,84. |
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| Authors: | JIANG An-na XU Yi-qing DONG Cheng-ling TONG Chun-fa |
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| Affiliation: | JIANG An-na;XU Yi-qing;DONG Cheng-ling;TONG Chun-fa;College of Information Science & Technology,Nanjing Forestry University;College of Forest Resources & Environment,Nanjing Forestry University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | molecular marker ordering parallel computation max-min ant system hidden Markov models F2 population |
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