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| 基于爬山法的cDNA基因芯片图像自动划格算法 | |
| 引用本文： | 聂桂军,王加俊,周源,王靖,陈强,杨静宇.基于爬山法的cDNA基因芯片图像自动划格算法[J].南京工业职业技术学院学报,2009,9(2):42-46. |
| 作者姓名： | 聂桂军 王加俊 周源 王靖 陈强 杨静宇 |
| 作者单位： | 1. 南京工业职业技术学院,信息工程系,江苏,南京,210046;苏州大学,电子信息学院,江苏,苏州,215021;南京理工大学,计算机学院,江苏,南京,210094 2. 苏州大学,电子信息学院,江苏,苏州,215021 3. 南京工业职业技术学院,信息工程系,江苏,南京,210046 4. 南京人口管理干部学院,信息科学系,江苏,南京,210042 5. 南京理工大学,计算机学院,江苏,南京,210094 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
| 摘 要： | 划格是准确定位cDNA芯片图像中杂交荧光样点并提取样点杂交强度信息必不可少的步骤，实现了一种基于爬山法的基因芯片图像自动划格算法，对NCBI上GEO数据库的cDNA基因芯片图像的测试结果表明，该算法能有效地对基因芯片点阵图像进行自动划格。 |
| 关 键 词： | cDNA 基因芯片图像 自动划格 基因表达 图像分析 爬山算法 |
An Automatic Gridding for cDNA Microarray Images Based on Hill-Climbing Algorithm |
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| NIE Gui-jun,WANG Jia-jun,ZHOU Yuan,WANG Jing,CHEN Qiang,YANG Jing-yu.An Automatic Gridding for cDNA Microarray Images Based on Hill-Climbing Algorithm[J].Journal of Nanjing Institute of Industry Technology,2009,9(2):42-46. | |
| Authors: | NIE Gui-jun WANG Jia-jun ZHOU Yuan WANG Jing CHEN Qiang YANG Jing-yu |
| Affiliation: | 1. Nanjing Institute oflndnstry Technology, Nanjing 210046, China; 2. Soochow University, Suzhou 215021, China; 3. Nanjing University of Science ＆ Technology, Nanjing 210094, China; 4. Nanjing Institute of Population Management, Nanjing 210042, China) |
| Abstract: | Based on the fact that gridding is an indispensable stage of accurately identifying the location of each spot while extracting spot intensities from the microarray images, this paper realizes a hill-climbing based automatic gridding algorithm for cDNA microarray images. The experimental result of testing the cDNA microarray images shows that the calculation model can effectively detect the grids on cDNA microarray images. |
| Keywords: | cDNA |
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