| 一种仿生的面向可重构多细胞阵列的分布式定序方法 |
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| 引用本文： | 吕启,徐佳庆,窦勇,冯雪.一种仿生的面向可重构多细胞阵列的分布式定序方法[J].小型微型计算机系统,2011,32(11). |
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| 作者姓名： | 吕启 徐佳庆 窦勇 冯雪 |
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| 作者单位： | 1. 国防科学技术大学计算机学院,长沙,410073
2. 中国人民解放军沈阳军区总医院,沈阳,110016 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(60833004)资助; 国家八六三高技术研究发展计划重点基金项目(2008AA01A201)资助 |
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| 摘 要： | 提出一种仿生的面向多细胞阵列的分布式定序方法.该方法是基于生物学上的图式形成理论,通过催化剂-抑制剂模型在多细胞阵列中建立浓度梯度,并在此基础上进行定序.该方法具有如下的特点:跟现有的多细胞阵列维序方法相比,它采用主动的维序方式；跟传统的分布式定序方法相比,它不需要初始特征值就能实现定序和维序.故障注入实验表明,该定序方法较现有的方法具有更强的鲁棒性,在细胞出错的情况下能够重新建立浓度梯度和重新定序.此外,我们在Xilinx公司的型号为Virtex-6 XC6VLX760的FPGA芯片上实现了5x5多细胞阵列,对浓度梯度建立和重建时间及硬件资源开销进行了评估.
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| 关 键 词： | 仿生 分布式定序 可重构多细胞阵列 图式形成理论 |
Bio-inspired Distributed Ranking Approach for Reconfigurable Multicellular Array |
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| LV Qi
,
XU Jia-qing
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DOU Yong
,
FENG Xue.Bio-inspired Distributed Ranking Approach for Reconfigurable Multicellular Array[J].Mini-micro Systems,2011,32(11). |
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| Authors: | LV Qi XU Jia-qing DOU Yong FENG Xue |
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| Affiliation: | LV Qi,XU Jia-qing1,DOU Yong1,FENG Xue2 1(School of Computer,National University of Defense Technology,Changsha 410073,China) 2(The General Hospital of Shenyang Military Command,PLA,Shenyang 110016,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bio-inspired distributed ranking reconfigurable multicellular array pattern formation theory |
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