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代谢网络的全局结构特征和反应中心性(英文)
引用本文:丁德武. 代谢网络的全局结构特征和反应中心性(英文)[J]. 计算机与应用化学, 2013, 0(7): 827-830
作者姓名:丁德武
作者单位:池州学院数学与计算机科学系,安徽,池州,247000
基金项目:安徽省教育厅自然科学研究资助基金(KJ2013B167).Supported by Natural Science Fund of Anhui Education Department
摘    要:图(或复杂网络)是大规模代谢网络研究的重要工具。传统上,主要使用代谢物图研究代谢网络,特别是人类的代谢网络。本文则使用反应图来研究人类的代谢网络,即:如果反应x的某个代谢产物是反应Y的某个代谢底物,则将反应x链接到反应Y。首先,从公开发表的文献获取了人类的反应网络,它包含了1099个节点和5208个弧。然后,根据"蝴蝶结"的结构分解方法,提取了人类的反应网络巨强组成部分,它包含了682个节点和4119弧。此外,研究了人类代谢网络反应图巨强组成部分的全局结构特性,结果表明它是一个"小世界","无尺度"和"自相似"网络。最后,依据10种不同的中心化分析方法(度,偏心率,紧密度,发散性,质心值,最短路径介数,.Katz状态,交易,网页排名和HITS中心),我们将另一研究重心放在了人类代谢网络反应图巨强组成部分的反应中心性分析方面,并确定了前15个关键反应(R00351b,R00256a,R00220a,R00253a,R00352b,R01177b,R00181a,R00344a,R00355b,R00485b,R03778b,R03858b,R03991b,R04742b和.R04747b)。

关 键 词:中心化  代谢网络  无尺度  自相似  小世界

Global structure and reaction centrality of metabolic network
Ding Dewu. Global structure and reaction centrality of metabolic network[J]. Computers and Applied Chemistry, 2013, 0(7): 827-830
Authors:Ding Dewu
Affiliation:Ding Dewu* (Department of Mathematics and Computer Science,Chizhou College,Chizhou 247000,Anhui Province,China)
Abstract:
Keywords:centralization  metabolic network  scale-free  self-similarity  small-world
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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