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基于2DGE图像先验的蛋白质点检测方法
引用本文:欧巧凤,张会生,熊邦书,李立欣.基于2DGE图像先验的蛋白质点检测方法[J].半导体光电,2015,36(1):145-149.
作者姓名:欧巧凤  张会生  熊邦书  李立欣
作者单位:西北工业大学电子信息学院,西安710072;南昌航空大学图像处理与模式识别江西省重点实验室,南昌330063;西北工业大学电子信息学院,西安710072;南昌航空大学图像处理与模式识别江西省重点实验室,南昌330063
基金项目:国家自然科学基金,江西省自然科学基金,江西省工业支撑计划项目
摘    要:各种改进的分水岭变换是目前应用最广的二维凝胶电泳(2DGE)图像蛋白质点分割算法.其中标记控制分水岭分割效果较好,但由于忽略了蛋白质点大小和形状,导致外标记落在部分蛋白质点区域内而无法正确分割.针对该问题,提出一种结合2DGE先验的分水岭分割方法.首先,根据2DGE图像蛋白质点中心灰度极小先验提取中心标记,并通过中心标记膨胀提取距离标记;然后,根据2DGE图像背景灰度极大先验,在距离标记划分的区块内提取原始2DGE图的局部自然分区标记,并对二者进行融合优化,获得最佳背景标记;最后在梯度图像各区块内进行分水岭变换,提取蛋白质点边缘.通过对四组真实扫描2DGE图像进行实验,结果表明,该方法明显改善了蛋白质点边缘检测正确率.

关 键 词:二维凝胶电泳  图像先验  图像分割  分水岭变换  数据融合
收稿时间:2014/4/28 0:00:00

2DGE Image Priors Based Protein Spots Segmentation Method
OU Qiaofeng , ZHANG Huisheng , XIONG Bangshu , LI Lixin.2DGE Image Priors Based Protein Spots Segmentation Method[J].Semiconductor Optoelectronics,2015,36(1):145-149.
Authors:OU Qiaofeng  ZHANG Huisheng  XIONG Bangshu  LI Lixin
Abstract:
Keywords:2DGE  image prior  image segment  watershed transform  data fusion
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