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机器学习预测化合物的雌雄激素受体活性
引用本文:胡帅,孔韧,谢良旭.机器学习预测化合物的雌雄激素受体活性[J].现代计算机,2023(1):16-21.
作者姓名:胡帅  孔韧  谢良旭
作者单位:江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药研究工程研究所
基金项目:国家自然科学基金面上项目(22003020,81603152,81903661);
摘    要:预测一种化合物的雌雄激素受体的活性,对于避免暴露于环境中类似雌雄激素的化学物质是非常重要的。采用包括支持向量机、随机森林等多种机器学习方法,利用Binding Database数据库建立了预测活性的定量结构-活性关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,并对模型进行验证与评估。评估结果发现,随机森林结合扩展连通性分子指纹对数据集预测准确率为0.83,其受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)得到的数据集曲线下面积(area under curve, AUC)为0.892,表明该模型具有广泛且良好的预测能力。该研究建立的活性预测模型可用于化合物的活性预测,为内分泌化合物的活性评估和风险管理提供参考。

关 键 词:雌雄激素受体  QSAR  活性预测  机器学习
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