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| 海带配子体叶绿素a/c结合蛋白基因lhcf6的序列特征与系统发生分析 | |
| 引用本文： | 毕燕会,周志刚. 海带配子体叶绿素a/c结合蛋白基因lhcf6的序列特征与系统发生分析[J]. 高技术通讯, 2008, 18(1): 84-90. DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.01.016 |
| 作者姓名： | 毕燕会 周志刚 |
| 作者单位： | 上海水产大学生命科学与技术学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090;上海水产大学生命科学与技术学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 上海市教委资助项目 |
| 摘 要： | 通过根据糖海带(Laminaria saccharina)叶绿素 a/c 结合蛋白基因 lhcf6 的 cDNA 序列设计的引物和 PCR 方法获得了海带(L.japonica)配子体 llwf6 基因的 cDNA 全长序列(GenBank 登录号:DQ250739).该序列的开放阅读框(ORF)与糖海带 lhcf6 编码序列的相似性高达 99%,而两非翻译区(UTR)序列的相似性只有94%.经推测,海带配子体 lhcf6基因序列的 ORF 编码一个含 218 个氨基酸的前体蛋白 LHCF6,其氨基端的 40 个氨基酸组成跨质体内质网和叶绿体膜的信号肽,跨膜酶切后变为含 178 个氨基酸的成熟蛋白,它的分子量为 19.3 kD,等电点为 4.88.预测的成熟蛋白 IJ-ICF6 高级结构存在 2 个保守性的β折叠和 3 个跨类囊体膜的 a 螺旋区.根据海带配子体 LHCF6 成熟蛋白以及 GenBank 中 12 个同源蛋白质的氨基酸序列所构建的 Neighbor-joining 分子进化树,显示藻类在光捕获蛋白氨基酸序列水平上存在着蓝藻与红藻、杂色藻类、裸藻与绿藻等三个方向的演化途径,其中裸藻和绿藻与高等植物的亲缘关系更近. |
| 关 键 词： | 海带 叶绿素a/c结合蛋白 lhcf6 系统演化 |
| 修稿时间： | 2006-10-30 |
Characterization and phylogenetic implication of lhcf6,a light-harvesting chlorophyll a/c-binding protein gene from Laminaria japonica gametophytes |
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| Bi Yanhui,Zhou Zhigang. Characterization and phylogenetic implication of lhcf6,a light-harvesting chlorophyll a/c-binding protein gene from Laminaria japonica gametophytes[J]. High Technology Letters, 2008, 18(1): 84-90. DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.01.016 | |
| Authors: | Bi Yanhui Zhou Zhigang |
| Affiliation: | Bi Yanhui Zhou Zhigang (Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources , Aquaculture Ecosystem of Ministry of Agriculture,College of Aqua-life Science , Technology,Shanghai Fisheries University,Shanghai 200090) |
| Abstract: | The complete coding sequence(cds)of lhcf6 gene from Laminaria japonica gametophytes was obtained by using a PCR based method and primers designed according to the lhcf6 cds from L.saccharina.The sequence comparison of the open reading frame from this gene with its homolog in L.saccharina revealed the sequence similarity of 99%,but that of their untranslated regions was only 94%.The precursor protein was deduced to be composed of 218 amino acids and the first 40 amino acids from the terminal of NH_2 constitu... |
| Keywords: | Laminaria japonica light-harvesting chlorophyll a/c-binding protein lhcf6 phylogeny |
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