基于SAA的苏云金杆菌代谢网络功能模块 |
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作者姓名: | 丁德武 陆克中 须文波 吴璞 黄海生 |
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作者单位: | 池州学院数学与计算机科学系,池州247000;江南大学信息工程学院,无锡214036;池州学院数学与计算机科学系,池州,247000;江南大学信息工程学院,无锡,214036 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目,安徽省教育厅自然科学基金资助项目,池州学院引进硕士研究生基金资助项目 |
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摘 要: | 比较几种常用的社团结构分析方法,讨论它们在代谢网络分析中的不足之处。模拟退火算法在代谢网络模块分析中具有一定优势,选用该算法分析苏云金杆菌代谢网络巨强连通体中的功能模块,并将所得的结果与KEGG数据库中的途径信息进行对比研究,发现大部分的模块都对应于1~2个KEGG途径。进一步的研究表明这些模块均具备重要的生物学功能意义。
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关 键 词: | 社团结构 代谢网络 模块性 模拟退火算法 |
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