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用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ)
作者姓名:管维红  徐振源  朱平
作者单位:1. 江南大学,信息工程学院,江苏,无锡,214122
2. 江南大学,理学院,江苏,无锡,214122
摘    要:通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列.其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类).然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图.从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同.

关 键 词:非线性预测方法  蛋白质序列  蛋白质分类  线性预测方法  研究  蛋白质  特征序列  特性  Sequences  Protein  Properties  Analysis  Prediction  对应  波动  曲线  发现  图形  比值  误差  结构类  主类  结构域
文章编号:1673-1689(2008)01-0071-05
修稿时间:2007-01-15
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