| 真核生物多基因预测结果整合算法 |
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| 引用本文： | 刘金定,朱毅华,黄水清.真核生物多基因预测结果整合算法[J].数据采集与处理,2013,28(5):679-684. |
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| 作者姓名： | 刘金定 朱毅华 黄水清 |
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| 作者单位： | 南京农业大学信息科学技术学院,南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划("八六三"计划) |
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| 摘 要： | 针对独立基因预测算法可靠性较差的缺点,提出了真核生物多基因预测结果整合算法(Algorithm for integration of multiple eukaryotie gene prediction results,AIMEGPR).该算法在综合分析各种预测算法结果的基础上,首先用极大似然法估计各种预测算法的性能参数,然后利用这些性能参数计算基因证据区间上各个基因片段归属于各种基因元件类型的后验概率,最后采用动态规划法在基因证据区间上确定最优的一致基因结构.AIMEGPR既不需要人工定制整合规则,也不需要复杂的训练学习,因此AIMEGPR尤其在基因组新测序物种上进行编码基因注释时具有十分显著的优越性.实验结果表明,利用AIMEGPR算法对多基因预测结果整合可以明显提高一致基因的可靠性.
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| 关 键 词： | 多基因整合 一致基因 基因预测 动态规划 |
Algorithm for Integration of Multiple Eukaryotic Gene Prediction Results |
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| Liu Jinding
,
Zhu Yihua
,
Huang Shuiqing.Algorithm for Integration of Multiple Eukaryotic Gene Prediction Results[J].Journal of Data Acquisition & Processing,2013,28(5):679-684. |
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| Authors: | Liu Jinding Zhu Yihua Huang Shuiqing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | integration of multiple genes consensus gene gene prediction dynamic programming |
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