| 口蹄疫病毒WFL株2C-P3-3'NCR片段的克隆及适于设计siRNA的序列分析 |
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| 引用本文： | 任林柱,孙大辉,王兴龙,刘锴,王学理,张辉.口蹄疫病毒WFL株2C-P3-3''''NCR片段的克隆及适于设计siRNA的序列分析[J].粉末涂料与涂装,2007,20(7):489-492. |
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| 作者姓名： | 任林柱 孙大辉 王兴龙 刘锴 王学理 张辉 |
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| 作者单位： | 任林柱（吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系,长春,130062;军事医学科学院军事兽医研究所动物性食品研究室,长春,130062）
孙大辉（吉林大学第一医院骨关节一科,长春,130021）
王兴龙（军事医学科学院军事兽医研究所动物性食品研究室,长春,130062）
刘锴（吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系,长春,130062）
王学理（吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系,长春,130062）
张辉（吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系,长春,130062） |
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| 基金项目： | 军事医学科学院基金;吉林省科技厅科技发展计划 |
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| 摘 要： | 目的 筛选出口蹄疫病毒(FMDV)基因组上适于设计siRNA的基因片段.方法 以FMDV WFL株RNA为模板,用3'RACE法扩增出2C-P3-3'NCR序列,将PCR扩增片段克隆到pMD18-T载体上,转化E.coli DH5α,筛选阳性重组子,进行序列测定,并与参考毒株序列比较.结果 扩增的基因片段大小为4 033 bp,其2C、P3和3'NCR序列的核苷酸序列与参考毒株的同源性分别为87.11%～94.23%、84.91%～96.66%和66.98%～82.35%,2C和P3与参考毒株的氨基酸同源性分别为94.97%～99.39%和91.84%～98.55%,WFL株P3基因的第1 150～1 270、1 680～1 840和2 080～2 490 bp以及2C基因的第354～470 bp范围内与参考毒株具有高度保守的特性.因此,可以依据siRNA设计原则,在这4个区域内筛选抑制效果好的siRNA.结论 成功克隆了FMDV WFL株2C-P3-3'NCR基因的序列,并筛选出4个适于设计siRNA的基因区段.
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| 关 键 词： | 口蹄疫病毒 基因组 小干扰RNA 克隆 序列分析 |
| 文章编号： | 1004-5503(2007)07-489-04 |
| 修稿时间： | 2006年12月13 |
Cloning of 2C-P3-3'NCR of Foot-and-Mouth Disease Virus WFL Strain and Screening of Gene Fragment for Design of siRNA |
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