| 奶牛microRNA-205靶基因及调控网络的精细预测分析 |
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| 引用本文： | 沈冰蕾,韩硕,刘娟,邹紫雯,李鑫丽,罗林,武瑞,赵志辉.奶牛microRNA-205靶基因及调控网络的精细预测分析[J].粉末涂料与涂装,2019(8). |
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| 作者姓名： | 沈冰蕾 韩硕 刘娟 邹紫雯 李鑫丽 罗林 武瑞 赵志辉 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学动物科技学院;广东海洋大学农学院 |
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| 摘 要： | 目的预测奶牛microRNA-205(bta-miR-205)候选靶基因,对其进行生物信息学精细分析,构建候选靶基因参与的调控网络。方法应用miRBASE、Targetscan和miRWalk软件预测其候选靶基因,经Gene Ontology、Panther、STRING和DAVID软件进行功能注释、分类统计、蛋白质互作及KEGG通路注释和富集分析,通过Cytoscape软件绘制靶基因可能重点参与的调控网络。结果 miR-205基因成熟区序列高度保守,共筛选出288个bta-miR-205候选靶基因,其参与的主要生物进程是细胞过程、代谢过程和生物调控,主要参与形成细胞器等细胞组分,主要分子功能是结合、催化作用。MAPK3等多个候选靶基因存在基因共表达和蛋白互作关系,参与免疫系统、适应性免疫系统、基因表达(转录)、抗原加工等反应途径显著富集在鞘脂、甲状腺激素、PI3K-Akt等信号通路。结论 bta-miR-205的候选靶基因MAPK3等可能通过参与免疫系统、基因表达(转录)、抗原加工等反应途径及鞘脂、甲状腺激素、PI3K-Akt等信号通路,在奶牛炎症疾病抗性、生殖及发育过程调控中发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 奶牛microRNA-205 靶基因预测 调控网络 信号通路 |
Predictive analysis of target genes and involved regulatory network of cow microRNA-205 |
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