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集成遗传算法在特征基因选取中的应用
引用本文:江健生,汪妍.集成遗传算法在特征基因选取中的应用[J].安徽工业大学学报,2020,37(1):53-59.
作者姓名:江健生  汪妍
作者单位:安庆师范大学计算机与信息学院,安徽安庆246133;安庆师范大学安徽省智能感知与计算高校重点实验室,安徽安庆246133,上海市浦东新区人民医院肿瘤科,上海201299
基金项目:安徽省自然科学基金;国家自然科学基金;安徽省教育厅质量工程项目
摘    要:结合Filter和Wrapper方法的优点,提出一种基于集成遗传算法(FSEGA)的特征选择方法,用于从基因表达谱数据中选择特征基因。根据基因正负样本的分布关系定义信息指标过滤噪声基因,在递归特征消除过程中根据基因的集成权值生成候选基因子集,选择分类测试中具有最高AUC(接收者工作特征曲线下的面积)值的候选基因子集作为基因表达谱数据集的特征基因子集,将支持向量机(SVM)用于算法的适应度函数,研究FSEGA方法与分类器算法之间的关系,对5个肿瘤特征基因表达谱数据集进行基因选取实验。结果表明,采用提出的集成特征选取方法选取的特征基因集合含丰富类别信息,重复性较好,提高了肿瘤特征基因选取的稳定性和鲁棒性。

关 键 词:集成遗传算法  特征基因  特征选取  支持向量机  基因表达谱

Application of Ensemble Genetic Algorithm in Feature Gene Selection
JIANG Jiansheng,WANG Yan.Application of Ensemble Genetic Algorithm in Feature Gene Selection[J].Journal of Anhui University of Technology,2020,37(1):53-59.
Authors:JIANG Jiansheng  WANG Yan
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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