利用计算生物学方法识别原核启动子的研究进展 |
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引用本文: | 苏伟,孙自杰,岳鹏,林昊.利用计算生物学方法识别原核启动子的研究进展[J].电子科技大学学报(自然科学版),2021,50(5):667-675. |
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作者姓名: | 苏伟 孙自杰 岳鹏 林昊 |
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作者单位: | 1.电子科技大学生命科学与技术学院 成都 611731 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(61772119),四川省杰出青年基金(2020JDJQ0012) |
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摘 要: | 原核启动子作为DNA中的一个关键区域,含有RNA聚合酶特异性结合和基因转录起始所需的保守序列,在转录调控中发挥着重要作用。然而,由于实验方法在实验周期和实验耗材上的限制,对启动子序列进行批量准确的鉴定仍然是分子生物学领域一项艰巨的任务。随着计算机技术的发展,出现了多个基于计算生物学的原核启动子预测方法,这些方法在数据质量、数据集大小、提取的特征、特征选择技术、分类算法以及评估策略方面表现出高度的多样性。该文系统地比较并总结这些方法,以便改进和进一步发展原核启动子识别技术。
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关 键 词: | 生物信息 机器学习 预测器 原核启动子 |
收稿时间: | 2021-07-29 |
A Brief Review for Identifying Prokaryotic Promoters Based on Computational Biology |
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Affiliation: | 1.School of Life Science and Technology, University of Electronic Science and Technology of China Chengdu 6117312.School of Healthcare Technology, Chengdu Neusoft University Chengdu 611844 |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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