| 三维等离子体粒子模拟程序的数据模型和I/O性能改进 |
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| 引用本文： | 陈虹,张侠,夏芳,张爱清,宋磊.三维等离子体粒子模拟程序的数据模型和I/O性能改进[J].计算机工程与应用,2004,40(20):104-107,110. |
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| 作者姓名： | 陈虹 张侠 夏芳 张爱清 宋磊 |
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| 作者单位： | 1. 清华大学计算机科学与技术系高性能计算研究所,北京,100084;北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心,北京,100088
2. 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心,北京,100088 |
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| 基金项目： | 国家973基础研究发展计划项目(编号:G1999032805)，中物院预先研究项目(编号:42105)，科学技术基金(编号:20030654) |
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| 摘 要： | 文章围绕强激光与等离子体相互作用三维数值模拟程序LARED-P数据输出存在的问题,给出了基于HDF5格式的数据模型,通过将计算结果进行重新组织和管理,实现了数据的实时压缩存储和高性能并行I/O,获得了较好的空间存储效率和时间效率,同时,程序提供了灵活的数据搜索机制,能够在程序运行过程中提取数据子集,满足了可视化系统准实时读入数据的需求。
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| 关 键 词： | 数据管理 数值模拟 HDF5 数据模型 |
| 文章编号： | 1002-8331-(2004)20-0104-04 |
A Data Model and I/O Performance Improvement for 3-D Plasma Simulations with Particle |
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| Chen Hong , Zhang Xia Xia Fang Zhang Aiqing Song Lei.A Data Model and I/O Performance Improvement for 3-D Plasma Simulations with Particle[J].Computer Engineering and Applications,2004,40(20):104-107,110. |
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| Authors: | Chen Hong Zhang Xia Xia Fang Zhang Aiqing Song Lei |
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| Affiliation: | Chen Hong 1,2 Zhang Xia 2 Xia Fang 2 Zhang Aiqing 2 Song Lei 21 |
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| Abstract: | To solve some problems about output of the results of LARED-P,which is a3-D electromagnetic code for laser-plasma interaction,this paper presents an HDF5-based data model.With re-organizing and managing these data,the storage with real-time compression and high performance parallel I /O is implemented and the cost of memory and CPU time are decreased.Meanwhile,flexible mechanism for data searching is provided,which can help visualization sys-tems to retrieve data subset from the running code. |
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| Keywords: | data management numerical simulation HDF5 data model |
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