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一种新的MPI Allgather算法及其在万亿次机群系统上的实现与性能分析
引用本文:陈靖,张云泉,张林波,袁伟.一种新的MPI Allgather算法及其在万亿次机群系统上的实现与性能分析[J].计算机学报,2006,29(5):808-814.
作者姓名:陈靖  张云泉  张林波  袁伟
作者单位:1. 中国科学技术大学计算机科学与技术系,合肥,230026;中国科学院软件研究所并行计算实验室,北京,100080
2. 中国科学院软件研究所并行计算实验室,北京,100080;中国科学院计算机科学国家重点实验室,北京,100080
3. 中国科学院数学与系统科学研究院,北京,100080;中国科学院科学与工程计算国家重点实验室,北京,100080
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划);中国科学院资助项目;科技部科研项目;高比容电子铝箔的研究开发与应用项目;中国科学院软件研究所资助项目;国家重点实验室基金
摘    要:给出一个新的MPI Allgather算法--邻居交换算法(neighbor exchange).提出的平均逻辑通信距离的概念和计算公式,可以有效地衡量通信的局部性.通过分析,发现在4种MPI Allgather算法中,邻居交换和环算法均具有最优的通信局部性.在万亿次机群深腾6800和曙光4000A上对4个MPI Allgather算法进行的性能测试和分析结果表明,邻居交换算法的长消息通信性能最优,中长消息通信性能不稳定,短消息通信性能次于递归倍增和Bruck算法.

关 键 词:MPI  Allgather算法  集合通信  性能评测  机群
收稿时间:2005-12-13
修稿时间:2005-12-132006-01-20

Implementation and Performance Analysis of a New MPI Allgather Algorithm on Terascale Linux Clusters
CHEN Jing,ZHANG Yun-Quan,ZHANG Lin-Bo,YUAN Wei.Implementation and Performance Analysis of a New MPI Allgather Algorithm on Terascale Linux Clusters[J].Chinese Journal of Computers,2006,29(5):808-814.
Authors:CHEN Jing  ZHANG Yun-Quan  ZHANG Lin-Bo  YUAN Wei
Affiliation:1.Department of Computer Science, University of Science and Technology of China, Hefei 230026;2.Laboratory of Parallel Computing, Institute of Software, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080;3.State Key Laboratory of Computer Science, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080;4.Academy of Mathematics and Systems Sciences, ChineseAcademy of Sciences, Beljing 100080;5.State Key Laboratory of Scientific and Engineering Computing, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080
Abstract:
Keywords:MPI Allgather algorithm  collective communication  performance evaluation  cluster
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