系统发生网络构建算法综述 |
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引用本文: | 王娟,郭茂祖.系统发生网络构建算法综述[J].电脑学习,2014(1). |
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作者姓名: | 王娟 郭茂祖 |
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作者单位: | 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院; |
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基金项目: | 国家自然科学基金(60932008,61172098);高等学校博士学科点专项科研基金(20112302110040);中央高校基本科研业务费专项资金(HIT.ICRST.2010 022) |
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摘 要: | 物种的进化史通常被描述成一棵有根系统树,但是当物种进化过程中发生网状进化事件(如,杂交、重组和水平基因转移)时,物种的进化史不再适合被描述成系统树。系统发生网络是系统树的一般化,也是被用来描述物种的进化史,并可以描述物种的网状进化事件。而且系统发生网络也可以可视化冲突数据集,如由不同的基因得到的物种树。因此,系统发生网络的研究是生物信息的一个重要领域。介绍了系统发生网络的概念、发展、研究现状,总结了现有的系统发生网络构建算法。
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关 键 词: | 系统发生网络 网状进化事件 隐式网络 显式网络 |
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