| PPI网络聚类的评价方法的研究与应用 |
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| 引用本文： | 尤梦丽,雷秀娟.PPI网络聚类的评价方法的研究与应用[J].计算机科学,2013,40(12):254-258. |
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| 作者姓名： | 尤梦丽 雷秀娟 |
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| 作者单位： | 陕西师范大学计算机科学学院 西安710062;陕西师范大学计算机科学学院 西安710062 |
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| 基金项目： | 本文受国家自然科学基金青年基金(61100164,0),教育部留学回国人员科研启动基金(教外司留[2012]1707号),陕西省2010年自然科学基础研究计划青年基金(2010JQ8034)资助 |
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| 摘 要： | 蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)聚类结果的评价方法的研究是检测PPI网络功能模块聚类结果正确与否的关键。介绍并分析了4种有代表性的PPI网络聚类的评价方法,即p-value、匹配统计量、基于准确率和查全率的综合评价以及基于层结构的hF-measure,在此基础上考虑了主错误划分类与该预测类的相似性,提出了新的罚分函数和新的Sf-measure评价方法。仿真结果表明了各评价方法的特点及Sf-measure评价方法的有效性及合理性。
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| 关 键 词： | 蛋白质相互作用网络 评价方法 调和平均值 主错误划分类 Sf-measure 中图法分类号TP391文献标识码A |
| 收稿时间： | 2/1/2013 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2013/4/30 0:00:00 |
Study and Application of Evaluating Methods of PPI Network Clustering |
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| YOU Meng-li and LEI Xiu-juan.Study and Application of Evaluating Methods of PPI Network Clustering[J].Computer Science,2013,40(12):254-258. |
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| Authors: | YOU Meng-li and LEI Xiu-juan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Protein-protein interaction(PPI) network Evaluation method f-measure Main error classification Sf-mea-sure |
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