首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

面向大分子的三维数据场特征分析与可视化
引用本文:韩 玮,汪 莉,陈 为,万华根,彭群生,吴 韬,王 琦.面向大分子的三维数据场特征分析与可视化[J].软件学报,2006,17(Z1):103-109.
作者姓名:韩 玮  汪 莉  陈 为  万华根  彭群生  吴 韬  王 琦
作者单位:浙江大学 CAD&CG国家重点实验室,浙江 杭州 310027;浙江大学 CAD&CG国家重点实验室,浙江 杭州 310027;浙江大学 CAD&CG国家重点实验室,浙江 杭州 310027;浙江大学 CAD&CG国家重点实验室,浙江 杭州 310027;浙江大学 CAD&CG国家重点实验室,浙江 杭州 310027;浙江大学 化学系 分子设计与分子热力学研究所,浙江 杭州 310027;浙江大学 化学系 分子设计与分子热力学研究所,浙江 杭州 310027
基金项目:Supported by the National Natural Science Foundation of China under Grant Nos.60533050, 60503056, 60021201 (国家自然科学 基金)
摘    要:介绍了在面向生物大分子结构和功能分析的三维数据场建模、特征分析与可视化方面的初步尝试.从蛋白质分子结构出发,采用量子化学理论计算得到一个规则采样的三维数据场,场的每个格点上记录蛋白酶分子内部各种力的综合作用.在每个格点上实施离散一阶、二阶局部微分计算,从而筛选出一系列数据场内的临界点,这些临界点潜在地揭示了蛋白质分子的功能区域所在.继而,计算数据场内各种型值的分子势能面,交互地探寻具有一定生物活性的“通道”区域.此外,探索运用多种点、面和体可视化技术,来寻找分子内部的宏观结构.通过上述多种特征分析与可视化手段,成功地寻找到HIV-1蛋白酶分子中隐藏的水分子排出通道.

关 键 词:三维数据场  特征分析  可视化  临界点  蛋白质  生物大分子
收稿时间:2006/3/15 0:00:00
修稿时间:2006/9/11 0:00:00

Feature Analysis and Visualization of 3D Scalar Field with the Applications to the Macromolecule
HAN Wei,WANG Li,CHEN Wei,WAN Hua-Gen,PENG Qun-Sheng,WU Tao and WANG Qi.Feature Analysis and Visualization of 3D Scalar Field with the Applications to the Macromolecule[J].Journal of Software,2006,17(Z1):103-109.
Authors:HAN Wei  WANG Li  CHEN Wei  WAN Hua-Gen  PENG Qun-Sheng  WU Tao and WANG Qi
Abstract:
Keywords:3D scalar field  feature analysis  visualization  critical point  protein  macromolecule
点击此处可从《软件学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《软件学报》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号