| 生物网络比对的模型与算法 |
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| 引用本文： | 郭杏莉,高琳,陈新.生物网络比对的模型与算法[J].软件学报,2010,21(9):2089-2106. |
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| 作者姓名： | 郭杏莉 高琳 陈新 |
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| 作者单位： | 1. 西安电子科技大学,计算机学院,陕西,西安,710071;西安电子科技大学,软件学院,陕西,西安,710071
2. 西安电子科技大学,计算机学院,陕西,西安,710071 |
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| 基金项目： | Supported by the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60933009 (国家自然科学基金); the Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education of China under Grant No.200807010013 (高等学校博士学科点专项科研基金) |
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| 摘 要： | 生物网络比对是生物体结构、功能和进化分析的重要研究手段.首先给出了生物网络比对问题的形式化定义;其次重点分析了现有的比对模型和算法,按照比对方法的数学特性对其进行了分类,并对典型算法结合应用进行了深入探讨,对3类比对方法的特点进行了总结与比较;再次,分析归纳了生物网络比对软件,阐述了生物网络比对研究的意义和应用;最后指出了生物网络比对研究中的关键问题及生物网络比对未来的研究方向.
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| 关 键 词： | 生物网络 比对 图的匹配 约束优化 分治策略 |
| 收稿时间： | 2009/6/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/3/30 0:00:00 |
Models and Algorithms for Alignment of Biological Networks |
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| GUO Xing-Li,GAO Lin and CHEN Xin.Models and Algorithms for Alignment of Biological Networks[J].Journal of Software,2010,21(9):2089-2106. |
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| Authors: | GUO Xing-Li GAO Lin and CHEN Xin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | biological network alignment graph matching constrained optimization divide and conquer |
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