支持向量机方法预测离子通道蛋白 |
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引用本文: | 涂白,毕然.支持向量机方法预测离子通道蛋白[J].计算机与数字工程,2007,35(10):8-10. |
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作者姓名: | 涂白 毕然 |
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作者单位: | 华中科技大学生命科学与技术学院,武汉,430074 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(编号:90203011)资助. |
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摘 要: | 讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白。通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较。通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%。
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关 键 词: | 离子通道 结构域 支持向量机 基因本体 |
修稿时间: | 2006-03-20 |
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