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支持向量机方法预测离子通道蛋白
引用本文:涂白,毕然.支持向量机方法预测离子通道蛋白[J].计算机与数字工程,2007,35(10):8-10.
作者姓名:涂白  毕然
作者单位:华中科技大学生命科学与技术学院,武汉,430074
基金项目:国家自然科学基金项目(编号:90203011)资助.
摘    要:讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白。通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较。通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%。

关 键 词:离子通道  结构域  支持向量机  基因本体
修稿时间:2006-03-20
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