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| 基于分子指纹的化学结构相似度检索系统的研究(英文) | |
| 引用本文： | 彭涛,孙连英,刘海波,周家驹.基于分子指纹的化学结构相似度检索系统的研究(英文)[J].计算机与应用化学,2012,29(3):291-293. |
| 作者姓名： | 彭涛 孙连英 刘海波 周家驹 |
| 作者单位： | 1. 信息服务工程北京市重点实验室,北京联合大学信息学院,北京,100101 2. 中国医学科学院药用植物研究所,北京,100193 3. 生化工程国家重点实验室,中国科学院过程工程研究所,北京,100190 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，北京市优秀人才培养资助个人项目，北京联合大学人才强校计划资助项目，北京联合大学校级科研项目 |
| 摘 要： | 化学结构相似性检索在现代化学研究中具有重要作用。而化学结构的相似性度量是进行相似度检索的基础和前提。目前在化学信息学的研究中,有数量众多的化学结构距离度量和相似度表示方法。本文采用了Daylight的分子指纹方法,并采用了Tanimoto系数定义的相似度度量方法。并根据这种度量方法使用CDK来进行计算化学结构的相似度指数。在上述研究工作的基础上,开发了基于浏览器/服务器模式的化学结构相似度检索系统,通过该系统可以在中药活性成分数据库中进行化学结构相似度检索。用户在进行化学结构相似度检索时,可以选择已存在的化学结构,也可以采用JME来绘制新的化学结构。下一步将在该数据库中进行聚类分析和分子多样性的研究。 |
| 关 键 词： | 化学结构相似性 结构检索 分子指纹 中药数据库 |
Research of chemical similarity searching system based on molecular fingerprint |
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| Peng Tao , Sun Lianying , Liu Haibo , Zhou Jiaju.Research of chemical similarity searching system based on molecular fingerprint[J].Computers and Applied Chemistry,2012,29(3):291-293. | |
| Authors: | Peng Tao Sun Lianying Liu Haibo Zhou Jiaju |
| Affiliation: | 1.Beijing Key Laboratory of Information Service Engineering,College of Information Technology,Beijing Union University, 100101,Beijing,China) (2.Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences,Beijing,100193,China) (3.National Key Laboratory of Biochemical Engineering,Institute of Process Engineering,Chinese Academy of Sciences,Beijing, 100190,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | molecular similarity structure searching molecular fingerprint Traditional Chinese Medicine Database |
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