| 氨基酸嗜盐不对称指数与其理化性质的相关性 |
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| 引用本文： | 张光亚.氨基酸嗜盐不对称指数与其理化性质的相关性[J].计算机与应用化学,2012,29(5):545-548. |
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| 作者姓名： | 张光亚 |
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| 作者单位： | 华侨大学生物工程与技术系,福建,厦门,361021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，华侨大学高层次人才科研启动项目 |
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| 摘 要： | 了解嗜盐蛋白氨基酸使用的偏好及该偏好与其理化性质之间的联系对探索嗜盐蛋白构效关系具有重要意义。本文选取极端嗜盐细菌Salinibacter ruber和非嗜盐菌Pelodictyon luteolum中362对同源蛋白,统计了52102个氨基酸突变位点,以此计算氨基酸的嗜盐不对称指数(HAI),并与243个理化性质进行相关性分析。结果表明:天冬氨酸的嗜盐性能最强,而异亮氨酸和赖氨酸最弱;243个理化性质中有16个同HAI存在显著相关性,其中5个呈正相关;氨基酸的亲疏水性及β折叠的倾向性是影响HAI值的两种最重要的理化性质。本文提出的氨基酸嗜盐不对称指数为了解嗜盐蛋白稳定性机制提供了新视角。
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| 关 键 词： | 嗜盐蛋白 β折叠 氨基酸亲疏水性 嗜盐不对称指数 相关性分析 |
Halophilic asymmetry index of amino acids and its relationship with the physicochemical properties |
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| Zhang Guangya.Halophilic asymmetry index of amino acids and its relationship with the physicochemical properties[J].Computers and Applied Chemistry,2012,29(5):545-548. |
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| Authors: | Zhang Guangya |
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| Affiliation: | Zhang Guangya (Department of biotechnology and bioengineering, Huaqiao University, Xiamen, 361021, Fujian, China) |
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